TET2

TET2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4NM6, 5DEU, 5D9Y
Ідентифікатори
Символи	TET2, KIAA1546, MDS, tet methylcytosine dioxygenase 2, Tet methylcytosine dioxygenase 2, IMD75
Зовнішні ІД	OMIM: 612839 MGI: 2443298 HomoloGene: 49498 GeneCards: TET2
шифр КФ	1.14.11.80
Пов'язані генетичні захворювання
	рак молочної залози, меланома, справжня поліцитемія, мієлодиспластичний синдром, гострий мієлоїдний лейкоз, blood platelet count
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • зв’язування з іоном металу; • oxidoreductase activity; • dioxygenase activity; • зв'язування з іонами цинку; • зв'язування з ДНК; • ferrous iron binding; • methylcytosine dioxygenase activity; • зв'язування з іонами заліза;
Клітинна компонента	• клітинне ядро;
Біологічний процес	• 5-methylcytosine catabolic process; • клітинний цикл; • GO:1904578 response to organic cyclic compound; • protein O-linked glycosylation; • myeloid cell differentiation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • DNA demethylation; • histone H3-K4 trimethylation; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • oxidative demethylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	54790
	214133
	ENSG00000168769
	ENSMUSG00000040943
	Q6N021
	Q4JK59
	NM_001127208; NM_017628
	NM_001040400; NM_145989; NM_001346736
	NP_001120680; NP_060098
	NP_001035490; NP_001333665
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TET2 (англ. Tet methylcytosine dioxygenase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 002 амінокислот, а молекулярна маса — 223 811^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEQDRTNHVE	GNRLSPFLIP	SPPICQTEPL	ATKLQNGSPL	PERAHPEVNG
DTKWHSFKSY	YGIPCMKGSQ	NSRVSPDFTQ	ESRGYSKCLQ	NGGIKRTVSE
PSLSGLLQIK	KLKQDQKANG	ERRNFGVSQE	RNPGESSQPN	VSDLSDKKES
VSSVAQENAV	KDFTSFSTHN	CSGPENPELQ	ILNEQEGKSA	NYHDKNIVLL
KNKAVLMPNG	ATVSASSVEH	THGELLEKTL	SQYYPDCVSI	AVQKTTSHIN
AINSQATNEL	SCEITHPSHT	SGQINSAQTS	NSELPPKPAA	VVSEACDADD
ADNASKLAAM	LNTCSFQKPE	QLQQQKSVFE	ICPSPAENNI	QGTTKLASGE
EFCSGSSSNL	QAPGGSSERY	LKQNEMNGAY	FKQSSVFTKD	SFSATTTPPP
PSQLLLSPPP	PLPQVPQLPS	EGKSTLNGGV	LEEHHHYPNQ	SNTTLLREVK
IEGKPEAPPS	QSPNPSTHVC	SPSPMLSERP	QNNCVNRNDI	QTAGTMTVPL
CSEKTRPMSE	HLKHNPPIFG	SSGELQDNCQ	QLMRNKEQEI	LKGRDKEQTR
DLVPPTQHYL	KPGWIELKAP	RFHQAESHLK	RNEASLPSIL	QYQPNLSNQM
TSKQYTGNSN	MPGGLPRQAY	TQKTTQLEHK	SQMYQVEMNQ	GQSQGTVDQH
LQFQKPSHQV	HFSKTDHLPK	AHVQSLCGTR	FHFQQRADSQ	TEKLMSPVLK
QHLNQQASET	EPFSNSHLLQ	HKPHKQAAQT	QPSQSSHLPQ	NQQQQQKLQI
KNKEEILQTF	PHPQSNNDQQ	REGSFFGQTK	VEECFHGENQ	YSKSSEFETH
NVQMGLEEVQ	NINRRNSPYS	QTMKSSACKI	QVSCSNNTHL	VSENKEQTTH
PELFAGNKTQ	NLHHMQYFPN	NVIPKQDLLH	RCFQEQEQKS	QQASVLQGYK
NRNQDMSGQQ	AAQLAQQRYL	IHNHANVFPV	PDQGGSHTQT	PPQKDTQKHA
ALRWHLLQKQ	EQQQTQQPQT	ESCHSQMHRP	IKVEPGCKPH	ACMHTAPPEN
KTWKKVTKQE	NPPASCDNVQ	QKSIIETMEQ	HLKQFHAKSL	FDHKALTLKS
QKQVKVEMSG	PVTVLTRQTT	AAELDSHTPA	LEQQTTSSEK	TPTKRTAASV
LNNFIESPSK	LLDTPIKNLL	DTPVKTQYDF	PSCRCVEQII	EKDEGPFYTH
LGAGPNVAAI	REIMEERFGQ	KGKAIRIERV	IYTGKEGKSS	QGCPIAKWVV
RRSSSEEKLL	CLVRERAGHT	CEAAVIVILI	LVWEGIPLSL	ADKLYSELTE
TLRKYGTLTN	RRCALNEERT	CACQGLDPET	CGASFSFGCS	WSMYYNGCKF
ARSKIPRKFK	LLGDDPKEEE	KLESHLQNLS	TLMAPTYKKL	APDAYNNQIE
YEHRAPECRL	GLKEGRPFSG	VTACLDFCAH	AHRDLHNMQN	GSTLVCTLTR
EDNREFGGKP	EDEQLHVLPL	YKVSDVDEFG	SVEAQEEKKR	SGAIQVLSSF
RRKVRMLAEP	VKTCRQRKLE	AKKAAAEKLS	SLENSSNKNE	KEKSAPSRTK
QTENASQAKQ	LAELLRLSGP	VMQQSQQPQP	LQKQPPQPQQ	QQRPQQQQPH
HPQTESVNSY	SASGSTNPYM	RRPNPVSPYP	NSSHTSDIYG	STSPMNFYST
SSQAAGSYLN	SSNPMNPYPG	LLNQNTQYPS	YQCNGNLSVD	NCSPYLGSYS
PQSQPMDLYR	YPSQDPLSKL	SLPPIHTLYQ	PRFGNSQSFT	SKYLGYGNQN
MQGDGFSSCT	IRPNVHHVGK	LPPYPTHEMD	GHFMGATSRL	PPNLSNPNMD
YKNGEHHSPS	HIIHNYSAAP	GMFNSSLHAL	HLQNKENDML	SHTANGLSKM
LPALNHDRTA	CVQGGLHKLS	DANGQEKQPL	ALVQGVASGA	EDNDEVWSDS
EQSFLDPDIG	GVAVAPTHGS	ILIECAKREL	HATTPLKNPN	RNHPTRISLV
FYQHKSMNEP	KHGLALWEAK	MAEKAREKEE	ECEKYGPDYV	PQKSHGKKVK
REPAEPHETS	EPTYLRFIKS	LAERTMSVTT	DSTVTTSPYA	FTRVTGPYNR
YI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, альтернативний сплайсинг, метилювання. Регулює диференціацію, проліферацію та функцію тучних клітин^[6]. Також здатний каталізувати гідроксиметилювання РНК для здійснення посттранскрипційної регуляції.^[7] Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза, ДНК.

Взаємодії

Утворює комплекси з низкою епігенетичних регуляторів, наприклад із SMARCB1, SMARCC2, SMARCE1, HDAC1, HDAC2, NCOR1, NCOR2, BAZ1A, BAZ1B, TOP2A, TOP2B, MBD2, PHF2, INO80, SAP30BP, TRRAP, WDHD1, CHD8, CHAF1A, DNMT3A^[8]. Здатний зв'язуватися з промотором NANOG в ембріональних стовбурових клітинах людини (hESC). За дефіциту TET2 спостерігається гіперметилювання цього промотора та значне зниження експресії NANOG, що призводить до втрати клітинами плюрипотентності.^[9]

Клінічне значення

Багато мутацій TET2, включно з нонсенс- і місенс-мутаціями, делеціями та зсувами рамки зчитування, були виявлені при мієлодиспластичному синдромі та інших типах лейкозів^[10], однак лише їх недостатньо для розвитку гемопоетичних злоякісних захворювань.^[11]. Серед лімфоїдних злоякісних новоутворень мутації цього гена спостерігаються приблизно у 2% В-клітинних лімфом та 12% Т-клітинних лімфом. Делеція TET2 посилює стовбурові властивості клітин гліобластоми та індукує агресивніший фенотип пухлини.^[11].

У пацієнтів із медикаментозно-резистентною епілепсією значно підвищена експресія TET2 у корі скроневої частки, особливо в периваскулярних зонах^[11].

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 doi:10.1093/dnares/7.4.271
Chen Q., Chen Y., Bian C., Fujiki R., Yu X. (2013). TET2 promotes histone O-GlcNAcylation during gene transcription. Nature. 493: 561—564. PMID 23222540 doi:10.1038/nature11742
Katoh M., Katoh M. (2004). Identification and characterization of human CXXC10 gene in silico. Int. J. Oncol. 25: 1193—1199. PMID 15375572

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TET2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25941 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q6N021 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.
↑ Gerecke C, Rodrigues CE, Homann T, Kleuser B (21 березня 2022). The Role of Ten-Eleven Translocation Proteins in Inflammation. Frontiers in Immunology. 13: 861351. doi:10.3389/fimmu.2022.861351.{{cite journal}}: Обслуговування CS1: Сторінки з номером статті як номер сторінки (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
↑ Zhang, Xinchao; Zhang, Yue; Wang, Chaofu; Wang, Xu (11 серпня 2023). TET (Ten-eleven translocation) family proteins: structure, biological functions and applications. Signal Transduction and Targeted Therapy (англ.). 8 (1): 297. doi:10.1038/s41392-023-01537-x.
↑ Jin M, Ji J, Chen X, Zhou Y, Wang D, Liu A (5 січня 2023). The emerging role of TET enzymes in the immune microenvironment at the maternal-fetal interface during decidualization and early pregnancy. Frontiers in Immunology. 13. doi:10.3389/fimmu.2022.1066599. PMC 9850229. PMID 36685517.
↑ Yang J, Bashkenova N, Zang R, Huang X, Wang J (15 січня 2020). The roles of TET family proteins in development and stem cells. Development. 147 (2): dev183129. doi:10.1242/dev.183129. PMC 6983710. PMID 31941705.
↑ Chen HF, Wu KJ (2016). Epigenetics, TET proteins, and hypoxia in epithelial-mesenchymal transition and tumorigenesis. BioMedicine. 6 (1): 1. doi:10.7603/s40681-016-0001-9. PMC 4751095. PMID 26869355.
↑ ^а ^б ^в Liang J, Na X, Meng L, He L, Shu T, Fang Y, Zhang B, Zhao Z, Guo C, Li T, Na Z, Li D, Xiao X (1 липня 2025). Ten-Eleven Translocation Family Proteins: Structure, Biological Functions, Diseases, and Targeted Therapy. MedComm. 6 (7): e70245. doi:10.1002/mco2.70245. PMC 12211984. PMID 40599235.{{cite journal}}: Обслуговування CS1: Сторінки з номером статті як номер сторінки (посилання)

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з TET2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25941 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q6N021 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.

[Gerecke2022-6] Gerecke C, Rodrigues CE, Homann T, Kleuser B (21 березня 2022). The Role of Ten-Eleven Translocation Proteins in Inflammation. Frontiers in Immunology. 13: 861351. doi:10.3389/fimmu.2022.861351.{{cite journal}}: Обслуговування CS1: Сторінки з номером статті як номер сторінки (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)

[TET_proteins_2023-7] Zhang, Xinchao; Zhang, Yue; Wang, Chaofu; Wang, Xu (11 серпня 2023). TET (Ten-eleven translocation) family proteins: structure, biological functions and applications. Signal Transduction and Targeted Therapy (англ.). 8 (1): 297. doi:10.1038/s41392-023-01537-x.

[Jin2023-8] Jin M, Ji J, Chen X, Zhou Y, Wang D, Liu A (5 січня 2023). The emerging role of TET enzymes in the immune microenvironment at the maternal-fetal interface during decidualization and early pregnancy. Frontiers in Immunology. 13. doi:10.3389/fimmu.2022.1066599. PMC 9850229. PMID 36685517.

[Yang2020-9] Yang J, Bashkenova N, Zang R, Huang X, Wang J (15 січня 2020). The roles of TET family proteins in development and stem cells. Development. 147 (2): dev183129. doi:10.1242/dev.183129. PMC 6983710. PMID 31941705.

[Chen2016-10] Chen HF, Wu KJ (2016). Epigenetics, TET proteins, and hypoxia in epithelial-mesenchymal transition and tumorigenesis. BioMedicine. 6 (1): 1. doi:10.7603/s40681-016-0001-9. PMC 4751095. PMID 26869355.

[Liang2025-11] а ^б ^в Liang J, Na X, Meng L, He L, Shu T, Fang Y, Zhang B, Zhao Z, Guo C, Li T, Na Z, Li D, Xiao X (1 липня 2025). Ten-Eleven Translocation Family Proteins: Structure, Biological Functions, Diseases, and Targeted Therapy. MedComm. 6 (7): e70245. doi:10.1002/mco2.70245. PMC 12211984. PMID 40599235.{{cite journal}}: Обслуговування CS1: Сторінки з номером статті як номер сторінки (посилання)

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]