BAZ1B

BAZ1B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1F62
Ідентифікатори
Символи	BAZ1B, WBSCR10, WBSCR9, WSTF, bromodomain adjacent to zinc finger domain 1B
Зовнішні ІД	OMIM: 605681 MGI: 1353499 HomoloGene: 22651 GeneCards: BAZ1B
шифр КФ	2.7.10.2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• трансферазна активність; • зв'язування з нуклеотидами; • histone kinase activity; • GO:0031493 histone binding; • non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity; • зв’язування з іоном металу; • кіназна активність; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • protein tyrosine kinase activity; • зв'язування з АТФ; • зв'язування з іонами цинку;
Клітинна компонента	• pericentric heterochromatin; • nuclear replication fork; • нуклеоплазма; • condensed chromosome; • клітинне ядро; • ядерні тільця;
Біологічний процес	• epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation; • ремоделювання хроматину; • фосфорилювання; • ДНК-матрична транскрипція; • cellular response to DNA damage stimulus; • peptidyl-tyrosine phosphorylation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	9031
	22385
	ENSG00000009954
	ENSMUSG00000002748
	Q9UIG0
	Q9Z277
	NM_023005; NM_032408; NM_001370402
	NM_011714
	NP_115784; NP_001357331
	NP_035844
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

BAZ1B (англ. Bromodomain adjacent to zinc finger domain 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 483 амінокислот, а молекулярна маса — 170 903^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPLLGRKPF	PLVKPLPGEE	PLFTIPHTQE	AFRTREEYEA	RLERYSERIW
TCKSTGSSQL	THKEAWEEEQ	EVAELLKEEF	PAWYEKLVLE	MVHHNTASLE
KLVDTAWLEI	MTKYAVGEEC	DFEVGKEKML	KVKIVKIHPL	EKVDEEATEK
KSDGACDSPS	SDKENSSQIA	QDHQKKETVV	KEDEGRRESI	NDRARRSPRK
LPTSLKKGER	KWAPPKFLPH	KYDVKLQNED	KIISNVPADS	LIRTERPPNK
EIVRYFIRHN	ALRAGTGENA	PWVVEDELVK	KYSLPSKFSD	FLLDPYKYMT
LNPSTKRKNT	GSPDRKPSKK	SKTDNSSLSS	PLNPKLWCHV	HLKKSLSGSP
LKVKNSKNSK	SPEEHLEEMM	KMMSPNKLHT	NFHIPKKGPP	AKKPGKHSDK
PLKAKGRSKG	ILNGQKSTGN	SKSPKKGLKT	PKTKMKQMTL	LDMAKGTQKM
TRAPRNSGGT	PRTSSKPHKH	LPPAALHLIA	YYKENKDRED	KRSALSCVIS
KTARLLSSED	RARLPEELRS	LVQKRYELLE	HKKRWASMSE	EQRKEYLKKK
REELKKKLKE	KAKERREKEM	LERLEKQKRY	EDQELTGKNL	PAFRLVDTPE
GLPNTLFGDV	AMVVEFLSCY	SGLLLPDAQY	PITAVSLMEA	LSADKGGFLY
LNRVLVILLQ	TLLQDEIAED	YGELGMKLSE	IPLTLHSVSE	LVRLCLRRSD
VQEESEGSDT	DDNKDSAAFE	DNEVQDEFLE	KLETSEFFEL	TSEEKLQILT
ALCHRILMTY	SVQDHMETRQ	QMSAELWKER	LAVLKEENDK	KRAEKQKRKE
MEAKNKENGK	VENGLGKTDR	KKEIVKFEPQ	VDTEAEDMIS	AVKSRRLLAI
QAKKEREIQE	REMKVKLERQ	AEEERIRKHK	AAAEKAFQEG	IAKAKLVMRR
TPIGTDRNHN	RYWLFSDEVP	GLFIEKGWVH	DSIDYRFNHH	CKDHTVSGDE
DYCPRSKKAN	LGKNASMNTQ	HGTATEVAVE	TTTPKQGQNL	WFLCDSQKEL
DELLNCLHPQ	GIRESQLKER	LEKRYQDIIH	SIHLARKPNL	GLKSCDGNQE
LLNFLRSDLI	EVATRLQKGG	LGYVEETSEF	EARVISLEKL	KDFGECVIAL
QASVIKKFLQ	GFMAPKQKRR	KLQSEDSAKT	EEVDEEKKMV	EEAKVASALE
KWKTAIREAQ	TFSRMHVLLG	MLDACIKWDM	SAENARCKVC	RKKGEDDKLI
LCDECNKAFH	LFCLRPALYE	VPDGEWQCPA	CQPATARRNS	RGRNYTEESA
SEDSEDDESD	EEEEEEEEEE	EEEDYEVAGL	RLRPRKTIRG	KHSVIPPAAR
SGRRPGKKPH	STRRSQPKAP	PVDDAEVDEL	VLQTKRSSRR	QSLELQKCEE
ILHKIVKYRF	SWPFREPVTR	DEAEDYYDVI	THPMDFQTVQ	NKCSCGSYRS
VQEFLTDMKQ	VFTNAEVYNC	RGSHVLSCMV	KTEQCLVALL	HKHLPGHPYV
RRKRKKFPDR	LAEDEGDSEP	EAVGQSRGRR	QKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

Lu X., Meng X., Morris C.A., Keating M.T. (1998). A novel human gene, WSTF, is deleted in Williams Syndrome. Genomics. 54: 241—249. PMID 9828126 doi:10.1006/geno.1998.5578
Jones M.H., Hamana N., Nezu J., Shimane M. (2000). A novel family of bromodomain genes. Genomics. 63: 40—45. PMID 10662543 doi:10.1006/geno.1999.6071
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Bozhenok L., Wade P.A., Varga-Weisz P. (2002). WSTF-ISWI chromatin remodeling complex targets heterochromatic replication foci. EMBO J. 21: 2231—2241. PMID 11980720 doi:10.1093/emboj/21.9.2231
Cavellan E., Asp P., Percipalle P., Oestlund Farrants A.-K. (2006). The WSTF-SNF2h chromatin remodeling complex interacts with several nuclear proteins in transcription. J. Biol. Chem. 281: 16264—16271. PMID 16603771 doi:10.1074/jbc.M600233200
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 doi:10.1073/pnas.1413825111

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:961 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9UIG0 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:961 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9UIG0 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]