TOP2A

TOP2A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1ZXM, 1ZXN, 4FM9, 4R1F
Ідентифікатори
Символи	TOP2A, TOP2, TP2A, topoisomerase (DNA) II alpha, DNA topoisomerase II alpha, TOPIIA, TOP2alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 126430 MGI: 98790 HomoloGene: 830 GeneCards: TOP2A
шифр КФ	5.6.2.2
Реагує на сполуку
	доксорубіцин, етопозид, мітоксантрон, ідарубіцин, vosaroxin, доксорубіцин, adoxorubicin, мітоксантрон, doxorubicin hydrochloride
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з ДНК; • зв'язування з нуклеотидами; • ATP-dependent activity, acting on DNA; • гомодимеризація білків; • histone deacetylase binding; • chromatin binding; • isomerase activity; • зв’язування з іоном металу; • DNA topoisomerase activity; • protein C-terminus binding; • ubiquitin binding; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • активність гетеродимеризації білків; • enzyme binding; • зв'язування з АТФ; • protein kinase C binding; • magnesium ion binding; • DNA binding, bending; • зв'язування з РНК; • GO:0003918 DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) complex; • нуклеоплазма; • nuclear chromosome; • ядерце; • Центріоль; • condensed chromosome; • клітинне ядро; • viral integration complex; • GO:0009327 protein-containing complex; • рибонуклеопротеїни;
Біологічний процес	• resolution of meiotic recombination intermediates; • apoptotic chromosome condensation; • embryonic cleavage; • ритмічний процес; • chromosome segregation; • DNA metabolic process; • protein sumoylation; • cellular response to DNA damage stimulus; • DNA ligation; • chromosome condensation; • regulation of circadian rhythm; • hematopoietic progenitor cell differentiation; • позитивна регуляція апоптозу; • mitotic DNA integrity checkpoint signaling; • positive regulation of viral genome replication; • positive regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate; • sister chromatid segregation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • DNA topological change; • negative regulation of DNA duplex unwinding; • female meiotic nuclear division;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	7153
	21973
	ENSG00000131747
	ENSMUSG00000020914
	P11388
	Q01320
	NM_001067
	NM_011623
	NP_001058
	NP_035753
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TOP2A (англ. DNA topoisomerase II alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 531 амінокислот, а молекулярна маса — 174 385^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEVSPLQPVN	ENMQVNKIKK	NEDAKKRLSV	ERIYQKKTQL	EHILLRPDTY
IGSVELVTQQ	MWVYDEDVGI	NYREVTFVPG	LYKIFDEILV	NAADNKQRDP
KMSCIRVTID	PENNLISIWN	NGKGIPVVEH	KVEKMYVPAL	IFGQLLTSSN
YDDDEKKVTG	GRNGYGAKLC	NIFSTKFTVE	TASREYKKMF	KQTWMDNMGR
AGEMELKPFN	GEDYTCITFQ	PDLSKFKMQS	LDKDIVALMV	RRAYDIAGST
KDVKVFLNGN	KLPVKGFRSY	VDMYLKDKLD	ETGNSLKVIH	EQVNHRWEVC
LTMSEKGFQQ	ISFVNSIATS	KGGRHVDYVA	DQIVTKLVDV	VKKKNKGGVA
VKAHQVKNHM	WIFVNALIEN	PTFDSQTKEN	MTLQPKSFGS	TCQLSEKFIK
AAIGCGIVES	ILNWVKFKAQ	VQLNKKCSAV	KHNRIKGIPK	LDDANDAGGR
NSTECTLILT	EGDSAKTLAV	SGLGVVGRDK	YGVFPLRGKI	LNVREASHKQ
IMENAEINNI	IKIVGLQYKK	NYEDEDSLKT	LRYGKIMIMT	DQDQDGSHIK
GLLINFIHHN	WPSLLRHRFL	EEFITPIVKV	SKNKQEMAFY	SLPEFEEWKS
STPNHKKWKV	KYYKGLGTST	SKEAKEYFAD	MKRHRIQFKY	SGPEDDAAIS
LAFSKKQIDD	RKEWLTNFME	DRRQRKLLGL	PEDYLYGQTT	TYLTYNDFIN
KELILFSNSD	NERSIPSMVD	GLKPGQRKVL	FTCFKRNDKR	EVKVAQLAGS
VAEMSSYHHG	EMSLMMTIIN	LAQNFVGSNN	LNLLQPIGQF	GTRLHGGKDS
ASPRYIFTML	SSLARLLFPP	KDDHTLKFLY	DDNQRVEPEW	YIPIIPMVLI
NGAEGIGTGW	SCKIPNFDVR	EIVNNIRRLM	DGEEPLPMLP	SYKNFKGTIE
ELAPNQYVIS	GEVAILNSTT	IEISELPVRT	WTQTYKEQVL	EPMLNGTEKT
PPLITDYREY	HTDTTVKFVV	KMTEEKLAEA	ERVGLHKVFK	LQTSLTCNSM
VLFDHVGCLK	KYDTVLDILR	DFFELRLKYY	GLRKEWLLGM	LGAESAKLNN
QARFILEKID	GKIIIENKPK	KELIKVLIQR	GYDSDPVKAW	KEAQQKVPDE
EENEESDNEK	ETEKSDSVTD	SGPTFNYLLD	MPLWYLTKEK	KDELCRLRNE
KEQELDTLKR	KSPSDLWKED	LATFIEELEA	VEAKEKQDEQ	VGLPGKGGKA
KGKKTQMAEV	LPSPRGQRVI	PRITIEMKAE	AEKKNKKKIK	NENTEGSPQE
DGVELEGLKQ	RLEKKQKREP	GTKTKKQTTL	AFKPIKKGKK	RNPWSDSESD
RSSDESNFDV	PPRETEPRRA	ATKTKFTMDL	DSDEDFSDFD	EKTDDEDFVP
SDASPPKTKT	SPKLSNKELK	PQKSVVSDLE	ADDVKGSVPL	SSSPPATHFP
DETEITNPVP	KKNVTVKKTA	AKSQSSTSTT	GAKKRAAPKG	TKRDPALNSG
VSQKPDPAKT	KNRRKRKPST	SDDSDSNFEK	IVSKAVTSKK	SKGESDDFHM
DFDSAVAPRA	KSVRAKKPIK	YLEESDEDDL	F

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ізомераз, топоізомераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біологічні ритми, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, ДНК, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Escargueil A.E., Plisov S.Y., Filhol O., Cochet C., Larsen A.K. (2000). Mitotic phosphorylation of DNA topoisomerase II alpha by protein kinase CK2 creates the MPM-2 phosphoepitope on Ser-1469. J. Biol. Chem. 275: 34710—34718. PMID 10942766 doi:10.1074/jbc.M005179200
Mirski S.E., Bielawski J.C., Cole S.P. (2003). Identification of functional nuclear export sequences in human topoisomerase IIalpha and beta. Biochem. Biophys. Res. Commun. 306: 905—911. PMID 12821127 doi:10.1016/S0006-291X(03)01077-5
Yun J., Tomida A., Andoh T., Tsuruo T. (2004). Interaction between glucose-regulated destruction domain of DNA topoisomerase IIalpha and MPN domain of Jab1/CSN5. J. Biol. Chem. 279: 31296—31303. PMID 15126503 doi:10.1074/jbc.M401411200
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 doi:10.1038/nbt1240
Iida M., Matsuda M., Komatani H. (2008). Plk3 phosphorylates topoisomerase IIalpha at Thr(1342), a site that is not recognized by Plk1. Biochem. J. 411: 27—32. PMID 18062778 doi:10.1042/BJ20071394

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з DNA topoisomerase II alpha переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11989 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P11388 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з DNA topoisomerase II alpha переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11989 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P11388 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]