INO80

INO80
Ідентифікатори
Символи	INO80, INO80A, INOC1, hINO80 complex subunit, INO80 complex ATPase subunit
Зовнішні ІД	OMIM: 610169 MGI: 1915392 HomoloGene: 75070 GeneCards: INO80
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з ДНК; • зв'язування з нуклеотидами; • GO:0008026 helicase activity; • alpha-tubulin binding; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • зв'язування з актином; • гідролазна активність; • зв'язування з АТФ; • ATP-dependent activity, acting on DNA; • АТФазна активність; • GO:0031493 histone binding; • GO:0043140 3'-5' DNA helicase activity;
Клітинна компонента	• Ino80 complex; • мікротрубочка; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • клітинна мембрана; • ядерні тільця; • intermediate filament cytoskeleton; • хромосома; • цитоплазма; • веретено поділу; • цитоскелет;
Біологічний процес	• DNA recombination; • cellular response to UV; • positive regulation of nuclear cell cycle DNA replication; • ДНК-матрична транскрипція; • cellular response to DNA damage stimulus; • поділ клітини; • spindle assembly; • regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle; • positive regulation of cell growth; • double-strand break repair; • double-strand break repair via homologous recombination; • mitotic sister chromatid segregation; • клітинна відповідь на іонізуюче випромінювання; • клітинний цикл; • UV-damage excision repair; • GO:0100026 Репарація ДНК; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • protein deubiquitination; • ремоделювання хроматину; • DNA duplex unwinding; • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to stress;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	54617
	68142
	ENSG00000128908
	ENSMUSG00000034154
	Q9ULG1
	Q6ZPV2
	NM_017553; NM_032196
	NM_026574
	NP_060023
	NP_080850
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

INO80 (англ. INO80 complex subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 15-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 556 амінокислот, а молекулярна маса — 176 753^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASELGARDD	GGCTELAKPL	YLQYLERALR	LDHFLRQTSA	IFNRNISSDD
SEDGLDDSNP	LLPQSGDPLI	QVKEEPPNSL	LGETSGAGSS	GMLNTYSLNG
VLQSESKCDK	GNLYNFSKLK	KSRKWLKSIL	LSDESSEADS	QSEDDDEEEL
NLSREELHNM	LRLHKYKKLH	QNKYSKDKEL	QQYQYYSAGL	LSTYDPFYEQ
QRHLLGPKKK	KFKEEKKLKA	KLKKVKKKRR	RDEELSSEES	PRRHHHQTKV
FAKFSHDAPP	PGTKKKHLSI	EQLNARRRKV	WLSIVKKELP	KANKQKASAR
NLFLTNSRKL	AHQCMKEVRR	AALQAQKNCK	ETLPRARRLT	KEMLLYWKKY
EKVEKEHRKR	AEKEALEQRK	LDEEMREAKR	QQRKLNFLIT	QTELYAHFMS
RKRDMGHDGI	QEEILRKLED	SSTQRQIDIG	GGVVVNITQE	DYDSNHFKAQ
ALKNAENAYH	IHQARTRSFD	EDAKESRAAA	LRAANKSGTG	FGESYSLANP
SIRAGEDIPQ	PTIFNGKLKG	YQLKGMNWLA	NLYEQGINGI	LADEMGLGKT
VQSIALLAHL	AERENIWGPF	LIISPASTLN	NWHQEFTRFV	PKFKVLPYWG
NPHDRKVIRR	FWSQKTLYTQ	DAPFHVVITS	YQLVVQDVKY	FQRVKWQYMV
LDEAQALKSS	SSVRWKILLQ	FQCRNRLLLT	GTPIQNTMAE	LWALLHFIMP
TLFDSHEEFN	EWFSKDIESH	AENKSAIDEN	QLSRLHMILK	PFMLRRIKKD
VENELSDKIE	ILMYCQLTSR	QKLLYQALKN	KISIEDLLQS	SMGSTQQAQN
TTSSLMNLVM	QFRKVCNHPE	LFERQETWSP	FHISLKPYHI	SKFIYRHGQI
RVFNHSRDRW	LRVLSPFAPD	YIQRSLFHRK	GINEESCFSF	LRFIDISPAE
MANLMLQGLL	ARWLALFLSL	KASYRLHQLR	SWGAPEGESH	QRYLRNKDFL
LGVNFPLSFP	NLCSCPLLKS	LVFSSHCKAV	SGYSDQVVHQ	RRSATSSLRR
CLLTELPSFL	CVASPRVTAV	PLDSYCNDRS	AEYERRVLKE	GGSLAAKQCL
LNGAPELAAD	WLNRRSQFFP	EPAGGLWSIR	PQNGWSFIRI	PGKESLITDS
GKLYALDVLL	TRLKSQGHRV	LIYSQMTRMI	DLLEEYMVYR	KHTYMRLDGS
SKISERRDMV	ADFQNRNDIF	VFLLSTRAGG	LGINLTAADT	VIFYDSDWNP
TVDQQAMDRA	HRLGQTKQVT	VYRLICKGTI	EERILQRAKE	KSEIQRMVIS
GGNFKPDTLK	PKEVVSLLLD	DEELEKKLRL	RQEEKRQQEE	TNRVKERKRK
REKYAEKKKK	EDELDGKRRK	EGVNLVIPFV	PSADNSNLSA	DGDDSFISVD
SAMPSPFSEI	SISSELHTGS	IPLDESSSDM	LVIVDDPASS	APQSRATNSP
ASITGSVSDT	VNGISIQEMP	AAGRGHSARS	RGRPKGSGST	AKGAGKGRSR
KSTAGSAAAM	AGAKAGAAAA	SAAAYAAYGY	NVSKGISASS	PLQTSLVRPA
GLADFGPSSA	SSPLSSPLSK	GNNVPGNPKN	LHMTSSLAPD	SLVRKQGKGT
NPSGGR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мітоз, рекомбінація ДНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою актину, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Park E.J., Hur S.K., Kwon J. (2010). Human INO80 chromatin-remodelling complex contributes to DNA double-strand break repair via the expression of Rad54B and XRCC3 genes. Biochem. J. 431: 179—187. PMID 20687897 doi:10.1042/BJ20100988

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26956 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9ULG1 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 15

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26956 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9ULG1 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]