TRRAP

TRRAP
Ідентифікатори
Символи	TRRAP, PAF350/400, PAF400, STAF40, TR-AP, Tra1, transformation/transcription domain associated protein, DEDDFA, DFNA75
Зовнішні ІД	OMIM: 603015 MGI: 2153272 HomoloGene: 39246 GeneCards: TRRAP
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001104 transcription coregulator activity; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • thiol-dependent deubiquitinase; • кіназна активність;
Клітинна компонента	• комплекс Ґольджі; • transcription factor TFTC complex; • NuA4 histone acetyltransferase complex; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • Swr1 complex; • histone acetyltransferase complex; • SAGA complex;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • histone H2A acetylation; • ДНК-матрична транскрипція; • histone deubiquitination; • histone H4 acetylation; • фосфорилювання; • beta-catenin-TCF complex assembly; • histone acetylation; • protein deubiquitination; • GO:0100026 Репарація ДНК; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	8295
	100683
	ENSG00000196367
	ENSMUSG00000045482
	Q9Y4A5
	Q80YV3
	NM_003496; NM_001244580; NM_001375524
	NM_001081362; NM_133901
	NP_001231509; NP_003487; NP_001362453
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TRRAP (англ. Transformation/transcription domain associated protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 859 амінокислот, а молекулярна маса — 437 600^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAFVATQGAT	VVDQTTLMKK	YLQFVAALTD	VNTPDETKLK	MMQEVSENFE
NVTSSPQYST	FLEHIIPRFL	TFLQDGEVQF	LQEKPAQQLR	KLVLEIIHRI
PTNEHLRPHT	KNVLSVMFRF	LETENEENVL	ICLRIIIELH	KQFRPPITQE
IHHFLDFVKQ	IYKELPKVVN	RYFENPQVIP	ENTVPPPEMV	GMITTIAVKV
NPEREDSETR	THSIIPRGSL	SLKVLAELPI	IVVLMYQLYK	LNIHNVVAEF
VPLIMNTIAI	QVSAQARQHK	LYNKELYADF	IAAQIKTLSF	LAYIIRIYQE
LVTKYSQQMV	KGMLQLLSNC	PAETAHLRKE	LLIAAKHILT	TELRNQFIPC
MDKLFDESIL	IGSGYTARET	LRPLAYSTLA	DLVHHVRQHL	PLSDLSLAVQ
LFAKNIDDES	LPSSIQTMSC	KLLLNLVDCI	RSKSEQESGN	GRDVLMRMLE
VFVLKFHTIA	RYQLSAIFKK	CKPQSELGAV	EAALPGVPTA	PAAPGPAPSP
APVPAPPPPP	PPPPPATPVT	PAPVPPFEKQ	GEKDKEDKQT	FQVTDCRSLV
KTLVCGVKTI	TWGITSCKAP	GEAQFIPNKQ	LQPKETQIYI	KLVKYAMQAL
DIYQVQIAGN	GQTYIRVANC	QTVRMKEEKE	VLEHFAGVFT	MMNPLTFKEI
FQTTVPYMVE	RISKNYALQI	VANSFLANPT	TSALFATILV	EYLLDRLPEM
GSNVELSNLY	LKLFKLVFGS	VSLFAAENEQ	MLKPHLHKIV	NSSMELAQTA
KEPYNYFLLL	RALFRSIGGG	SHDLLYQEFL	PLLPNLLQGL	NMLQSGLHKQ
HMKDLFVELC	LTVPVRLSSL	LPYLPMLMDP	LVSALNGSQT	LVSQGLRTLE
LCVDNLQPDF	LYDHIQPVRA	ELMQALWRTL	RNPADSISHV	AYRVLGKFGG
SNRKMLKESQ	KLHYVVTEVQ	GPSITVEFSD	CKASLQLPME	KAIETALDCL
KSANTEPYYR	RQAWEVIKCF	LVAMMSLEDN	KHALYQLLAH	PNFTEKTIPN
VIISHRYKAQ	DTPARKTFEQ	ALTGAFMSAV	IKDLRPSALP	FVASLIRHYT
MVAVAQQCGP	FLLPCYQVGS	QPSTAMFHSE	ENGSKGMDPL	VLIDAIAICM
AYEEKELCKI	GEVALAVIFD	VASIILGSKE	RACQLPLFSY	IVERLCACCY
EQAWYAKLGG	VVSIKFLMER	LPLTWVLQNQ	QTFLKALLFV	MMDLTGEVSN
GAVAMAKTTL	EQLLMRCATP	LKDEERAEEI	VAAQEKSFHH	VTHDLVREVT
SPNSTVRKQA	MHSLQVLAQV	TGKSVTVIME	PHKEVLQDMV	PPKKHLLRHQ
PANAQIGLME	GNTFCTTLQP	RLFTMDLNVV	EHKVFYTELL	NLCEAEDSAL
TKLPCYKSLP	SLVPLRIAAL	NALAACNYLP	QSREKIIAAL	FKALNSTNSE
LQEAGEACMR	KFLEGATIEV	DQIHTHMRPL	LMMLGDYRSL	TLNVVNRLTS
VTRLFPNSFN	DKFCDQMMQH	LRKWMEVVVI	THKGGQRSDG	NESISECGRC
PLSPFCQFEE	MKICSAIINL	FHLIPAAPQT	LVKPLLEVVM	KTERAMLIEA
GSPFREPLIK	FLTRHPSQTV	ELFMMEATLN	DPQWSRMFMS	FLKHKDARPL
RDVLAANPNR	FITLLLPGGA	QTAVRPGSPS	TSTMRLDLQF	QAIKIISIIV
KNDDSWLASQ	HSLVSQLRRV	WVSENFQERH	RKENMAATNW	KEPKLLAYCL
LNYCKRNYGD	IELLFQLLRA	FTGRFLCNMT	FLKEYMEEEI	PKNYSIAQKR
ALFFRFVDFN	DPNFGDELKA	KVLQHILNPA	FLYSFEKGEG	EQLLGPPNPE
GDNPESITSV	FITKVLDPEK	QADMLDSLRI	YLLQYATLLV	EHAPHHIHDN
NKNRNSKLRR	LMTFAWPCLL	SKACVDPACK	YSGHLLLAHI	IAKFAIHKKI
VLQVFHSLLK	AHAMEARAIV	RQAMAILTPA	VPARMEDGHQ	MLTHWTRKII
VEEGHTVPQL	VHILHLIVQH	FKVYYPVRHH	LVQHMVSAMQ	RLGFTPSVTI
EQRRLAVDLS	EVVIKWELQR	IKDQQPDSDM	DPNSSGEGVN	SVSSSIKRGL
SVDSAQEVKR	FRTATGAISA	VFGRSQSLPG	ADSLLAKPID	KQHTDTVVNF
LIRVACQVND	NTNTAGSPGE	VLSRRCVNLL	KTALRPDMWP	KSELKLQWFD
KLLMTVEQPN	QVNYGNICTG	LEVLSFLLTV	LQSPAILSSF	KPLQRGIAAC
MTCGNTKVLR	AVHSLLSRLM	SIFPTEPSTS	SVASKYEELE	CLYAAVGKVI
YEGLTNYEKA	TNANPSQLFG	TLMILKSACS	NNPSYIDRLI	SVFMRSLQKM
VREHLNPQAA	SGSTEATSGT	SELVMLSLEL	VKTRLAVMSM	EMRKNFIQAI
LTSLIEKSPD	AKILRAVVKI	VEEWVKNNSP	MAANQTPTLR	EKSILLVKMM
TYIEKRFPED	LELNAQFLDL	VNYVYRDETL	SGSELTAKLE	PAFLSGLRCA
QPLIRAKFFE	VFDNSMKRRV	YERLLYVTCS	QNWEAMGNHF	WIKQCIELLL
AVCEKSTPIG	TSCQGAMLPS	ITNVINLADS	HDRAAFAMVT	HVKQEPRERE
NSESKEEDVE	IDIELAPGDQ	TSTPKTKELS	EKDIGNQLHM	LTNRHDKFLD
TLREVKTGAL	LSAFVQLCHI	STTLAEKTWV	QLFPRLWKIL	SDRQQHALAG
EISPFLCSGS	HQVQRDCQPS	ALNCFVEAMS	QCVPPIPIRP	CVLKYLGKTH
NLWFRSTLML	EHQAFEKGLS	LQIKPKQTTE	FYEQESITPP	QQEILDSLAE
LYSLLQEEDM	WAGLWQKRCK	YSETATAIAY	EQHGFFEQAQ	ESYEKAMDKA
KKEHERSNAS	PAIFPEYQLW	EDHWIRCSKE	LNQWEALTEY	GQSKGHINPY
LVLECAWRVS	NWTAMKEALV	QVEVSCPKEM	AWKVNMYRGY	LAICHPEEQQ
LSFIERLVEM	ASSLAIREWR	RLPHVVSHVH	TPLLQAAQQI	IELQEAAQIN
AGLQPTNLGR	NNSLHDMKTV	VKTWRNRLPI	VSDDLSHWSS	IFMWRQHHYQ
GKPTWSGMHS	SSIVTAYENS	SQHDPSSNNA	MLGVHASASA	IIQYGKIARK
QGLVNVALDI	LSRIHTIPTV	PIVDCFQKIR	QQVKCYLQLA	GVMGKNECMQ
GLEVIESTNL	KYFTKEMTAE	FYALKGMFLA	QINKSEEANK	AFSAAVQMHD
VLVKAWAMWG	DYLENIFVKE	RQLHLGVSAI	TCYLHACRHQ	NESKSRKYLA
KVLWLLSFDD	DKNTLADAVD	KYCIGVPPIQ	WLAWIPQLLT	CLVGSEGKLL
LNLISQVGRV	YPQAVYFPIR	TLYLTLKIEQ	RERYKSDPGP	IRATAPMWRC
SRIMHMQREL	HPTLLSSLEG	IVDQMVWFRE	NWHEEVLRQL	QQGLAKCYSV
AFEKSGAVSD	AKITPHTLNF	VKKLVSTFGV	GLENVSNVST	MFSSAASESL
ARRAQATAQD	PVFQKLKGQF	TTDFDFSVPG	SMKLHNLISK	LKKWIKILEA
KTKQLPKFFL	IEEKCRFLSN	FSAQTAEVEI	PGEFLMPKPT	HYYIKIARFM
PRVEIVQKHN	TAARRLYIRG	HNGKIYPYLV	MNDACLTESR	REERVLQLLR
LLNPCLEKRK	ETTKRHLFFT	VPRVVAVSPQ	MRLVEDNPSS	LSLVEIYKQR
CAKKGIEHDN	PISRYYDRLA	TVQARGTQAS	HQVLRDILKE	VQSNMVPRSM
LKEWALHTFP	NATDYWTFRK	MFTIQLALIG	FAEFVLHLNR	LNPEMLQIAQ
DTGKLNVAYF	RFDINDATGD	LDANRPVPFR	LTPNISEFLT	TIGVSGPLTA
SMIAVARCFA	QPNFKVDGIL	KTVLRDEIIA	WHKKTQEDTS	SPLSAAGQPE
NMDSQQLVSL	VQKAVTAIMT	RLHNLAQFEG	GESKVNTLVA	AANSLDNLCR
MDPAWHPWL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

McMahon S.B., Van Buskirk H.A., Dugan K.A., Copeland T.D., Cole M.D. (1998). The novel ATM-related protein TRRAP is an essential cofactor for the c-Myc and E2F oncoproteins. Cell. 94: 363—374. PMID 9708738 doi:10.1016/S0092-8674(00)81479-8
Brand M., Yamamoto K., Staub A., Tora L. (1999). Identification of TATA-binding protein-free TAFII-containing complex subunits suggests a role in nucleosome acetylation and signal transduction. J. Biol. Chem. 274: 18285—18289. PMID 10373431 doi:10.1074/jbc.274.26.18285
McMahon S.B., Wood M.A., Cole M.D. (2000). The essential cofactor TRRAP recruits the histone acetyltransferase hGCN5 to c-Myc. Mol. Cell. Biol. 20: 556—562. PMID 10611234 doi:10.1128/MCB.20.2.556-562.2000
Lang S.E., McMahon S.B., Cole M.D., Hearing P. (2001). E2F transcriptional activation requires TRRAP and GCN5 cofactors. J. Biol. Chem. 276: 32627—32634. PMID 11418595 doi:10.1074/jbc.M102067200
Park J., Kunjibettu S., McMahon S.B., Cole M.D. (2001). The ATM-related domain of TRRAP is required for histone acetyltransferase recruitment and Myc-dependent oncogenesis. Genes Dev. 15: 1619—1624. PMID 11445536 doi:10.1101/gad.900101
Park J., Wood M.A., Cole M.D. (2002). BAF53 forms distinct nuclear complexes and functions as a critical c-Myc-interacting nuclear cofactor for oncogenic transformation. Mol. Cell. Biol. 22: 1307—1316. PMID 11839798 doi:10.1128/MCB.22.5.1307-1316.2002

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12347 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9Y4A5 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12347 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9Y4A5 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]