TET1

TET1
Ідентифікатори
Символи	TET1, CXXC6, LCX, bA119F7.1, MLL-TET1-MLL, Tet methylcytosine dioxygenase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607790 MGI: 1098693 HomoloGene: 12735 GeneCards: TET1
шифр КФ	1.14.11.80
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іонами заліза; • зв'язування з іонами цинку; • methylcytosine dioxygenase activity; • dioxygenase activity; • зв’язування з іоном металу; • oxidoreductase activity; • зв'язування з ДНК; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of histone methylation; • protein O-linked glycosylation; • negative regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly; • ДНК-матрична транскрипція; • stem cell population maintenance; • inner cell mass cell differentiation; • positive regulation of cell population proliferation; • DNA demethylation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • 5-methylcytosine catabolic process; • oxidative demethylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	80312
	52463
	ENSG00000138336
	ENSMUSG00000047146
	Q8NFU7
	Q3URK3
	NM_030625
	NM_001253857; NM_027384
	NP_085128
	NP_001240786; NP_001393310; NP_001393311; NP_001393312
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TET1 (англ. Tet methylcytosine dioxygenase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 136 амінокислот, а молекулярна маса — 235 309^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSRSRHARPS	RLVRKEDVNK	KKKNSQLRKT	TKGANKNVAS	VKTLSPGKLK
QLIQERDVKK	KTEPKPPVPV	RSLLTRAGAA	RMNLDRTEVL	FQNPESLTCN
GFTMALRSTS	LSRRLSQPPL	VVAKSKKVPL	SKGLEKQHDC	DYKILPALGV
KHSENDSVPM	QDTQVLPDIE	TLIGVQNPSL	LKGKSQETTQ	FWSQRVEDSK
INIPTHSGPA	AEILPGPLEG	TRCGEGLFSE	ETLNDTSGSP	KMFAQDTVCA
PFPQRATPKV	TSQGNPSIQL	EELGSRVESL	KLSDSYLDPI	KSEHDCYPTS
SLNKVIPDLN	LRNCLALGGS	TSPTSVIKFL	LAGSKQATLG	AKPDHQEAFE
ATANQQEVSD	TTSFLGQAFG	AIPHQWELPG	ADPVHGEALG	ETPDLPEIPG
AIPVQGEVFG	TILDQQETLG	MSGSVVPDLP	VFLPVPPNPI	ATFNAPSKWP
EPQSTVSYGL	AVQGAIQILP	LGSGHTPQSS	SNSEKNSLPP	VMAISNVENE
KQVHISFLPA	NTQGFPLAPE	RGLFHASLGI	AQLSQAGPSK	SDRGSSQVSV
TSTVHVVNTT	VVTMPVPMVS	TSSSSYTTLL	PTLEKKKRKR	CGVCEPCQQK
TNCGECTYCK	NRKNSHQICK	KRKCEELKKK	PSVVVPLEVI	KENKRPQREK
KPKVLKADFD	NKPVNGPKSE	SMDYSRCGHG	EEQKLELNPH	TVENVTKNED
SMTGIEVEKW	TQNKKSQLTD	HVKGDFSANV	PEAEKSKNSE	VDKKRTKSPK
LFVQTVRNGI	KHVHCLPAET	NVSFKKFNIE	EFGKTLENNS	YKFLKDTANH
KNAMSSVATD	MSCDHLKGRS	NVLVFQQPGF	NCSSIPHSSH	SIINHHASIH
NEGDQPKTPE	NIPSKEPKDG	SPVQPSLLSL	MKDRRLTLEQ	VVAIEALTQL
SEAPSENSSP	SKSEKDEESE	QRTASLLNSC	KAILYTVRKD	LQDPNLQGEP
PKLNHCPSLE	KQSSCNTVVF	NGQTTTLSNS	HINSATNQAS	TKSHEYSKVT
NSLSLFIPKS	NSSKIDTNKS	IAQGIITLDN	CSNDLHQLPP	RNNEVEYCNQ
LLDSSKKLDS	DDLSCQDATH	TQIEEDVATQ	LTQLASIIKI	NYIKPEDKKV
ESTPTSLVTC	NVQQKYNQEK	GTIQQKPPSS	VHNNHGSSLT	KQKNPTQKKT
KSTPSRDRRK	KKPTVVSYQE	NDRQKWEKLS	YMYGTICDIW	IASKFQNFGQ
FCPHDFPTVF	GKISSSTKIW	KPLAQTRSIM	QPKTVFPPLT	QIKLQRYPES
AEEKVKVEPL	DSLSLFHLKT	ESNGKAFTDK	AYNSQVQLTV	NANQKAHPLT
QPSSPPNQCA	NVMAGDDQIR	FQQVVKEQLM	HQRLPTLPGI	SHETPLPESA
LTLRNVNVVC	SGGITVVSTK	SEEEVCSSSF	GTSEFSTVDS	AQKNFNDYAM
NFFTNPTKNL	VSITKDSELP	TCSCLDRVIQ	KDKGPYYTHL	GAGPSVAAVR
EIMENRYGQK	GNAIRIEIVV	YTGKEGKSSH	GCPIAKWVLR	RSSDEEKVLC
LVRQRTGHHC	PTAVMVVLIM	VWDGIPLPMA	DRLYTELTEN	LKSYNGHPTD
RRCTLNENRT	CTCQGIDPET	CGASFSFGCS	WSMYFNGCKF	GRSPSPRRFR
IDPSSPLHEK	NLEDNLQSLA	TRLAPIYKQY	APVAYQNQVE	YENVARECRL
GSKEGRPFSG	VTACLDFCAH	PHRDIHNMNN	GSTVVCTLTR	EDNRSLGVIP
QDEQLHVLPL	YKLSDTDEFG	SKEGMEAKIK	SGAIEVLAPR	RKKRTCFTQP
VPRSGKKRAA	MMTEVLAHKI	RAVEKKPIPR	IKRKNNSTTT	NNSKPSSLPT
LGSNTETVQP	EVKSETEPHF	ILKSSDNTKT	YSLMPSAPHP	VKEASPGFSW
SPKTASATPA	PLKNDATASC	GFSERSSTPH	CTMPSGRLSG	ANAAAADGPG
ISQLGEVAPL	PTLSAPVMEP	LINSEPSTGV	TEPLTPHQPN	HQPSFLTSPQ
DLASSPMEED	EQHSEADEPP	SDEPLSDDPL	SPAEEKLPHI	DEYWSDSEHI
FLDANIGGVA	IAPAHGSVLI	ECARRELHAT	TPVEHPNRNH	PTRLSLVFYQ
HKNLNKPQHG	FELNKIKFEA	KEAKNKKMKA	SEQKDQAANE	GPEQSSEVNE
LNQIPSHKAL	TLTHDNVVTV	SPYALTHVAG	PYNHWV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, репресорів, активаторів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, її регуляція. Білок має сайти для зв'язування з іонами металів, зокрема іоном цинку та заліза, ДНК. Спільно з TET2 бере участь в епігенетичній регуляції на стадії плюрипотентної бластоцисти^[5]. Забезпечує самовідновлення ембріональних стовбурових клітин шляхом зв'язування з промотором NANOG та підтримки його гіпометильованого стану^[6]. Каталітична активність TET1 необхідна для експресії DPPA3, який зв'язується з UHRF1 (ключовий компонент механізму метилювання ДНК ссавців) та витісняє його^[7]. Локалізований у ядрі.

Взаємодії

Утворює комплекси з низкою епігенетичних регуляторів, наприклад із SIN3A, MECP2, HDAC1, HDAC6, HDAC7, EZH2, KDM1A^[8].

Медичне значення

Діє як супресор пухлини при раку товстої кишки та підшлункової залози, але як онкогенний чинник при раку яєчника, гострому мієлолейкозі (ГМЛ) та медулобластомі^[6].

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Kriaucionis S., Heintz N. (2009). The nuclear DNA base 5-hydroxymethylcytosine is present in Purkinje neurons and the brain. Science. 324: 929—930. PMID 19372393 doi:10.1126/science.1169786
Guo J.U., Su Y., Zhong C., Ming G.L., Song H. (2011). Hydroxylation of 5-methylcytosine by TET1 promotes active DNA demethylation in the adult brain. Cell. 145: 423—434. PMID 21496894 doi:10.1016/j.cell.2011.03.022

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29484 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8NFU7 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ Wang, Mengxi (10 лютого 2014). Studies of Mechanisms Regulating Tet Proteins (PDF). edoc.ub.uni-muenchen.de (англ.). Ludwig-Maximilians-Universität München.
↑ ^а ^б Liang J, Na X, Meng L, He L, Shu T, Fang Y, Zhang B, Zhao Z, Guo C, Li T, Na Z, Li D, Xiao X (1 липня 2025). Ten-Eleven Translocation Family Proteins: Structure, Biological Functions, Diseases, and Targeted Therapy. MedComm. 6 (7): e70245. doi:10.1002/mco2.70245. PMC 12211984. PMID 40599235.{{cite journal}}: Обслуговування CS1: Сторінки з номером статті як номер сторінки (посилання)
↑ Yang J, Bashkenova N, Zang R, Huang X, Wang J (15 січня 2020). The roles of TET family proteins in development and stem cells. Development. 147 (2): dev183129. doi:10.1242/dev.183129. PMC 6983710. PMID 31941705.
↑ Jin M, Ji J, Chen X, Zhou Y, Wang D, Liu A (5 січня 2023). The emerging role of TET enzymes in the immune microenvironment at the maternal-fetal interface during decidualization and early pregnancy. Frontiers in Immunology. 13. doi:10.3389/fimmu.2022.1066599. PMC 9850229. PMID 36685517.

Див. також

Хромосома 10

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29484 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q8NFU7 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[Wang2014-5] Wang, Mengxi (10 лютого 2014). Studies of Mechanisms Regulating Tet Proteins (PDF). edoc.ub.uni-muenchen.de (англ.). Ludwig-Maximilians-Universität München.

[Liang2025-6] а ^б Liang J, Na X, Meng L, He L, Shu T, Fang Y, Zhang B, Zhao Z, Guo C, Li T, Na Z, Li D, Xiao X (1 липня 2025). Ten-Eleven Translocation Family Proteins: Structure, Biological Functions, Diseases, and Targeted Therapy. MedComm. 6 (7): e70245. doi:10.1002/mco2.70245. PMC 12211984. PMID 40599235.{{cite journal}}: Обслуговування CS1: Сторінки з номером статті як номер сторінки (посилання)

[Yang2020-7] Yang J, Bashkenova N, Zang R, Huang X, Wang J (15 січня 2020). The roles of TET family proteins in development and stem cells. Development. 147 (2): dev183129. doi:10.1242/dev.183129. PMC 6983710. PMID 31941705.

[Jin2023-8] Jin M, Ji J, Chen X, Zhou Y, Wang D, Liu A (5 січня 2023). The emerging role of TET enzymes in the immune microenvironment at the maternal-fetal interface during decidualization and early pregnancy. Frontiers in Immunology. 13. doi:10.3389/fimmu.2022.1066599. PMC 9850229. PMID 36685517.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]