UHRF1

UHRF1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2FAZ, 2L3R, 2LGG, 2LGK, 2LGL, 2PB7, 3ASK, 3ASL, 3BI7, 3CLZ, 3DB3, 3DB4, 3DWH, 3FL2, 3SHB, 3SOU, 3SOW, 3SOX, 3T6R, 3ZVY, 3ZVZ, 4GY5, 4QQD, 5C6D, 5IAY
Ідентифікатори
Символи	UHRF1, ICBP90, Np95, RNF106, hNP95, hhuNp95, TDRD22, ubiquitin like with PHD and ring finger domains 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607990 MGI: 1338889 HomoloGene: 7866 GeneCards: UHRF1
шифр КФ	2.3.2.27
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з ДНК; • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity; • hemi-methylated DNA-binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • зв'язування з метильованими CpG-динуклеотидами; • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • зв’язування з іоном металу; • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • methylated histone binding; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • identical protein binding; • трансферазна активність; • зв'язування з іонами цинку; • GO:0031493 histone binding;
Клітинна компонента	• GO:0035327 Еухроматин; • ядерний матрикс; • replication fork; • GO:0035328 Гетерохроматин; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• histone monoubiquitination; • GO:0051247, GO:0051200 positive regulation of protein metabolic process; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • maintenance of DNA methylation; • positive regulation of DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing) activity; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • ДНК-матрична транскрипція; • regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly; • cellular response to DNA damage stimulus; • Убіквітин-залежний протеоліз; • клітинний цикл; • проліферація; • histone ubiquitination; • GO:0100026 Репарація ДНК; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • protein autoubiquitination; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • убіквітин-залежний протеоліз; • regulation of epithelial cell proliferation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	29128
	18140
	ENSG00000276043
	ENSMUSG00000001228
	Q96T88
	Q8VDF2
	NM_001048201; NM_001290050; NM_001290051; NM_001290052; NM_013282
	NM_001111078; NM_001111079; NM_001111080; NM_010931
	NP_001041666; NP_001276979; NP_001276980; NP_001276981; NP_037414
	NP_001104548; NP_001104549; NP_001104550; NP_035061
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

UHRF1 (англ. Ubiquitin like with PHD and ring finger domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 793 амінокислот, а молекулярна маса — 89 814^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWIQVRTMDG	RQTHTVDSLS	RLTKVEELRR	KIQELFHVEP	GLQRLFYRGK
QMEDGHTLFD	YEVRLNDTIQ	LLVRQSLVLP	HSTKERDSEL	SDTDSGCCLG
QSESDKSSTH	GEAAAETDSR	PADEDMWDET	ELGLYKVNEY	VDARDTNMGA
WFEAQVVRVT	RKAPSRDEPC	SSTSRPALEE	DVIYHVKYDD	YPENGVVQMN
SRDVRARART	IIKWQDLEVG	QVVMLNYNPD	NPKERGFWYD	AEISRKRETR
TARELYANVV	LGDDSLNDCR	IIFVDEVFKI	ERPGEGSPMV	DNPMRRKSGP
SCKHCKDDVN	RLCRVCACHL	CGGRQDPDKQ	LMCDECDMAF	HIYCLDPPLS
SVPSEDEWYC	PECRNDASEV	VLAGERLRES	KKKAKMASAT	SSSQRDWGKG
MACVGRTKEC	TIVPSNHYGP	IPGIPVGTMW	RFRVQVSESG	VHRPHVAGIH
GRSNDGAYSL	VLAGGYEDDV	DHGNFFTYTG	SGGRDLSGNK	RTAEQSCDQK
LTNTNRALAL	NCFAPINDQE	GAEAKDWRSG	KPVRVVRNVK	GGKNSKYAPA
EGNRYDGIYK	VVKYWPEKGK	SGFLVWRYLL	RRDDDEPGPW	TKEGKDRIKK
LGLTMQYPEG	YLEALANRER	EKENSKREEE	EQQEGGFASP	RTGKGKWKRK
SAGGGPSRAG	SPRRTSKKTK	VEPYSLTAQQ	SSLIREDKSN	AKLWNEVLAS
LKDRPASGSP	FQLFLSKVEE	TFQCICCQEL	VFRPITTVCQ	HNVCKDCLDR
SFRAQVFSCP	ACRYDLGRSY	AMQVNQPLQT	VLNQLFPGYG	NGR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Бере участь у спрямуванні DNMT1 до ділянок модифікації.^[5] Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Unoki M., Nishidate T., Nakamura Y. (2004). ICBP90, an E2F-1 target, recruits HDAC1 and binds to methyl-CpG through its SRA domain. Oncogene. 23: 7601—7610. PMID 15361834 doi:10.1038/sj.onc.1208053
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 doi:10.1038/nbt1240
Karagianni P., Amazit L., Qin J., Wong J. (2008). ICBP90, a novel methyl K9 H3 binding protein linking protein ubiquitination with heterochromatin formation. Mol. Cell. Biol. 28: 705—717. PMID 17967883 doi:10.1128/MCB.01598-07
Kim J.K., Esteve P.O., Jacobsen S.E., Pradhan S. (2009). UHRF1 binds G9a and participates in p21 transcriptional regulation in mammalian cells. Nucleic Acids Res. 37: 493—505. PMID 19056828 doi:10.1093/nar/gkn961
Guan D., Factor D., Liu Y., Wang Z., Kao H.Y. (2013). The epigenetic regulator UHRF1 promotes ubiquitination-mediated degradation of the tumor-suppressor protein promyelocytic leukemia protein. Oncogene. 32: 3819—3828. PMID 22945642 doi:10.1038/onc.2012.406

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12556 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q96T88 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ Wang, Mengxi (10 лютого 2014). Studies of Mechanisms Regulating Tet Proteins (PDF). edoc.ub.uni-muenchen.de (англ.). Ludwig-Maximilians-Universität München.

Див. також

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12556 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q96T88 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[5] Wang, Mengxi (10 лютого 2014). Studies of Mechanisms Regulating Tet Proteins (PDF). edoc.ub.uni-muenchen.de (англ.). Ludwig-Maximilians-Universität München.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]