SIN3A

SIN3A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1PO4
Ідентифікатори
Символи	SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, SIN3 transcription regulator family member A, WITKOS
Зовнішні ІД	OMIM: 607776 MGI: 107157 HomoloGene: 32124 GeneCards: SIN3A
Пов'язані генетичні захворювання
	chromosome 15q24 deletion syndrome
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з ДНК; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • histone deacetylase activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • protein deacetylase activity; • зв'язування з фактором транскрипції; • chromatin binding; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • зв'язування з РНК; • GO:0032403 protein-containing complex binding;
Клітинна компонента	• регуляторний транскрипційний комплекс; • transcription repressor complex; • нуклеоплазма; • ядерце; • хроматин; • клітинне ядро; • кінетохор; • Sin3 complex; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• negative regulation of protein localization to nucleus; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress; • ритмічний процес; • cellular response to dopamine; • response to methylglyoxal; • negative regulation of circadian rhythm; • regulation of hormone levels; • GO:0010260 старіння людини; • negative regulation of apoptotic process; • in utero embryonic development; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • ДНК-матрична транскрипція; • protein deacetylation; • реплікація ДНК; • negative regulation of transcription regulatory region DNA binding; • response to organonitrogen compound; • hematopoietic progenitor cell differentiation; • activation of innate immune response; • positive regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • histone deacetylation; • negative regulation of histone H3-K27 acetylation; • cellular response to glucose stimulus; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of defense response to virus by host; • regulation of lipid metabolic process; • regulation of megakaryocyte differentiation; • negative regulation of nucleic acid-templated transcription;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	25942
	20466
	ENSG00000169375
	ENSMUSG00000042557
	Q96ST3
	Q60520
	NM_001145357; NM_001145358; NM_015477
	NM_001110350; NM_001110351; NM_011378; NM_001357754
	NP_001138829; NP_001138830; NP_056292
	NP_001103820; NP_001103821; NP_035508; NP_001344683
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SIN3A (англ. SIN3 transcription regulator family member A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 273 амінокислот, а молекулярна маса — 145 175^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKRRLDDQES	PVYAAQQRRI	PGSTEAFPHQ	HRVLAPAPPV	YEAVSETMQS
ATGIQYSVTP	SYQVSAMPQS	SGSHGPAIAA	VHSSHHHPTA	VQPHGGQVVQ
SHAHPAPPVA	PVQGQQQFQR	LKVEDALSYL	DQVKLQFGSQ	PQVYNDFLDI
MKEFKSQSID	TPGVISRVSQ	LFKGHPDLIM	GFNTFLPPGY	KIEVQTNDMV
NVTTPGQVHQ	IPTHGIQPQP	QPPPQHPSQP	SAQSAPAPAQ	PAPQPPPAKV
SKPSQLQAHT	PASQQTPPLP	PYASPRSPPV	QPHTPVTISL	GTAPSLQNNQ
PVEFNHAINY	VNKIKNRFQG	QPDIYKAFLE	ILHTYQKEQR	NAKEAGGNYT
PALTEQEVYA	QVARLFKNQE	DLLSEFGQFL	PDANSSVLLS	KTTAEKVDSV
RNDHGGTVKK	PQLNNKPQRP	SQNGCQIRRH	PTGTTPPVKK	KPKLLNLKDS
SMADASKHGG	GTESLFFDKV	RKALRSAEAY	ENFLRCLVIF	NQEVISRAEL
VQLVSPFLGK	FPELFNWFKN	FLGYKESVHL	ETYPKERATE	GIAMEIDYAS
CKRLGSSYRA	LPKSYQQPKC	TGRTPLCKEV	LNDTWVSFPS	WSEDSTFVSS
KKTQYEEHIY	RCEDERFELD	VVLETNLATI	RVLEAIQKKL	SRLSAEEQAK
FRLDNTLGGT	SEVIHRKALQ	RIYADKAADI	IDGLRKNPSI	AVPIVLKRLK
MKEEEWREAQ	RGFNKVWREQ	NEKYYLKSLD	HQGINFKQND	TKVLRSKSLL
NEIESIYDER	QEQATEENAG	VPVGPHLSLA	YEDKQILEDA	AALIIHHVKR
QTGIQKEDKY	KIKQIMHHFI	PDLLFAQRGD	LSDVEEEEEE	EMDVDEATGA
VKKHNGVGGS	PPKSKLLFSN	TAAQKLRGMD	EVYNLFYVNN	NWYIFMRLHQ
ILCLRLLRIC	SQAERQIEEE	NREREWEREV	LGIKRDKSDS	PAIQLRLKEP
MDVDVEDYYP	AFLDMVRSLL	DGNIDSSQYE	DSLREMFTIH	AYIAFTMDKL
IQSIVRQLQH	IVSDEICVQV	TDLYLAENNN	GATGGQLNTQ	NSRSLLESTY
QRKAEQLMSD	ENCFKLMFIQ	SQGQVQLTIE	LLDTEEENSD	DPVEAERWSD
YVERYMNSDT	TSPELREHLA	QKPVFLPRNL	RRIRKCQRGR	EQQEKEGKEG
NSKKTMENVD	SLDKLECRFK	LNSYKMVYVI	KSEDYMYRRT	ALLRAHQSHE
RVSKRLHQRF	QAWVDKWTKE	HVPREMAAET	SKWLMGEGLE	GLVPCTTTCD
TETLHFVSIN	KYRVKYGTVF	KAP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, її регуляція, біологічні ритми, ацетилювання. Може функціонувати як транскрипційний коактиватор LEFTY1. Для активації транскрипції SIN3A взаємодіє з білком TET1, сприяючи деметилюванню промотора Lefty1.^[6] Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Mathur M., Tucker P.W., Samuels H.H. (2001). PSF is a novel corepressor that mediates its effect through Sin3A and the DNA binding domain of nuclear hormone receptors. Mol. Cell. Biol. 21: 2298—2311. PMID 11259580 doi:10.1128/MCB.21.7.2298-2311.2001
Yang X., Zhang F., Kudlow J.E. (2002). Recruitment of O-GlcNAc transferase to promoters by corepressor mSin3A: coupling protein O-GlcNAcylation to transcriptional repression. Cell. 110: 69—80. PMID 12150998 doi:10.1016/S0092-8674(02)00810-3
Wysocka J., Myers M.P., Laherty C.D., Eisenman R.N., Herr W. (2003). Human Sin3 deacetylase and trithorax-related Set1/Ash2 histone H3-K4 methyltransferase are tethered together selectively by the cell-proliferation factor HCF-1. Genes Dev. 17: 896—911. PMID 12670868 doi:10.1101/gad.252103
Fleischer T.C., Yun U.J., Ayer D.E. (2003). Identification and characterization of three new components of the mSin3A corepressor complex. Mol. Cell. Biol. 23: 3456—3467. PMID 12724404 doi:10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003
Nikolaev A.Y., Papanikolaou N.A., Li M., Qin J., Gu W. (2004). Identification of a novel BRMS1-homologue protein p40 as a component of the mSin3A/p33(ING1b)/HDAC1 deacetylase complex. Biochem. Biophys. Res. Commun. 323: 1216—1222. PMID 15451426 doi:10.1016/j.bbrc.2004.08.227

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SIN3A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19353 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q96ST3 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ Yang J, Bashkenova N, Zang R, Huang X, Wang J (15 січня 2020). The roles of TET family proteins in development and stem cells. Development. 147 (2): dev183129. doi:10.1242/dev.183129. PMC 6983710. PMID 31941705.

Див. також

Хромосома 15

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з SIN3A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19353 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q96ST3 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[Yang2020-6] Yang J, Bashkenova N, Zang R, Huang X, Wang J (15 січня 2020). The roles of TET family proteins in development and stem cells. Development. 147 (2): dev183129. doi:10.1242/dev.183129. PMC 6983710. PMID 31941705.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]