Альфа-тубулін, ізоформа 1b

Альфа-тубулін, ізоформа 1b
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2E4H, 4TV8, 3RYI, 3JAR, 4TUY, 4TV9, 4YJ2, 3RYH, 3JAK, 3JAS, 4F61, 3UT5, 4O4J, 4YJ3, 4EB6, 4WBN, 3JAW, 4O2A, 3RYF, 3JAL, 4O4H, 4LNU, 3J8Y, 4IIJ, 4O4I, 3RYC, 4O4L, 4O2B, 4I50, 3JAT, 4HNA, 4F6R, 3J8X, 5CA0, 5ITZ, 5JQG, 5IJ0, 5FNV, 5IJ9
Ідентифікатори
Символи	TUBA1B, K-ALPHA-1, tubulin alpha 1b
Зовнішні ІД	OMIM: 602530 MGI: 107804 HomoloGene: 134527 GeneCards: TUBA1B
Реагує на сполуку
	velban, Іксабепілон, plinabulin, vinblastine sulfate, patupilone, vincristine sulfate, dolastatin 10
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з нуклеотидами; • зв'язування з ГТФ; • structural molecule activity; • structural constituent of cytoskeleton; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • GO:0006184 GTPase activity; • double-stranded RNA binding; • зв'язування з убіквітинпротеїнлігазою;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • myelin sheath; • cytoplasmic microtubule; • мікротрубочка; • цитоскелет; • microtubule cytoskeleton; • membrane raft;
Біологічний процес	• cellular response to interleukin-4; • cytoskeleton-dependent intracellular transport; • поділ клітини; • microtubule-based process; • microtubule cytoskeleton organization; • GO:0007067 мітоз;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	10376
	22143
	ENSG00000123416
	ENSMUSG00000023004
	P68363
	P05213
	NM_006082
	NM_011654
	NP_006073
	NP_035784
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Альфа-тубулін, ізоформа 1b (англ. Tubulin alpha 1b) – білок, який кодується геном TUBA1B, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 451 амінокислот, а молекулярна маса — 50 152^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRECISIHVG	QAGVQIGNAC	WELYCLEHGI	QPDGQMPSDK	TIGGGDDSFN
TFFSETGAGK	HVPRAVFVDL	EPTVIDEVRT	GTYRQLFHPE	QLITGKEDAA
NNYARGHYTI	GKEIIDLVLD	RIRKLADQCT	GLQGFLVFHS	FGGGTGSGFT
SLLMERLSVD	YGKKSKLEFS	IYPAPQVSTA	VVEPYNSILT	THTTLEHSDC
AFMVDNEAIY	DICRRNLDIE	RPTYTNLNRL	ISQIVSSITA	SLRFDGALNV
DLTEFQTNLV	PYPRIHFPLA	TYAPVISAEK	AYHEQLSVAE	ITNACFEPAN
QMVKCDPRHG	KYMACCLLYR	GDVVPKDVNA	AIATIKTKRS	IQFVDWCPTG
FKVGINYQPP	TVVPGGDLAK	VQRAVCMLSN	TTAIAEAWAR	LDHKFDLMYA
KRAFVHWYVG	EGMEEGEFSE	AREDMAALEK	DYEEVGVDSV	EGEGEEEGEE
Y

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

Cowan N.J., Dobner P., Fuchs E.V., Cleveland D.W. (1983). Expression of human alpha-tubulin genes: interspecies conservation of 3' untranslated regions. Mol. Cell. Biol. 3: 1738—1745. PMID 6646120 doi:10.1128/MCB.3.10.1738
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Baumann M.H., Wisniewski T., Levy E., Plant G.T., Ghiso J. (1996). C-terminal fragments of alpha- and beta-tubulin form amyloid fibrils in vitro and associate with amyloid deposits of familial cerebral amyloid angiopathy, British type. Biochem. Biophys. Res. Commun. 219: 238—242. PMID 8619814 doi:10.1006/bbrc.1996.0211
Valenstein M.L., Roll-Mecak A. (2016). Graded control of microtubule severing by tubulin glutamylation. Cell. 164: 911—921. PMID 26875866 doi:10.1016/j.cell.2016.01.019
Nirschl J.J., Magiera M.M., Lazarus J.E., Janke C., Holzbaur E.L. (2016). Alpha-tubulin tyrosination and CLIP-170 phosphorylation regulate the initiation of dynein-driven transport in neurons. Cell Rep. 14: 2637—2652. PMID 26972003 doi:10.1016/j.celrep.2016.02.046