PPARA

PPARA
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1I7G, 1K7L, 1KKQ, 2NPA, 2P54, 2REW, 2ZNN, 3ET1, 3FEI, 3G8I, 3KDT, 3KDU, 3SP6, 3VI8, 4BCR, 4CI4, 5AZT
Ідентифікатори
Символи	PPARA, NR1C1, PPAR, PPARalpha, hPPAR, peroxisome proliferator activated receptor alpha, PPAR-alpha
Зовнішні ІД	MGI: 104740 HomoloGene: 21047 GeneCards: PPARA
Реагує на сполуку
	bezafibrate, ciprofibrate, Клофібрат, farglitazar, Фенофібрат, gemfibrozil, oleic monoethanolamide, pirinixic acid
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з ДНК; • специфічне до послідовності зв'язування з ДНК; • protein domain specific binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • зв'язування з іонами цинку; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • зв’язування з іоном металу; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • steroid hormone receptor activity; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • ubiquitin conjugating enzyme binding; • lipid binding; • зв'язування з фактором транскрипції; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • сигнальна рецепторна активність; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • transcription coactivator binding; • phosphatase binding; • NFAT protein binding; • MDM2/MDM4 family protein binding; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • fatty acid binding; • nuclear receptor coactivator activity;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма; • RNA polymerase II transcription regulator complex;
Біологічний процес	• lipoprotein metabolic process; • negative regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of fatty acid beta-oxidation; • negative regulation of glycolytic process; • response to hypoxia; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of blood pressure; • обмін жирів; • ритмічний процес; • Загоєння ран; • negative regulation of leukocyte cell-cell adhesion; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • fatty acid transport; • negative regulation of protein binding; • negative regulation of appetite; • circadian regulation of gene expression; • ДНК-матрична транскрипція; • fatty acid metabolic process; • behavioral response to nicotine; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • negative regulation of cholesterol storage; • response to insulin; • development of the heart; • intracellular receptor signaling pathway; • negative regulation of transcription regulatory region DNA binding; • negative regulation of sequestering of triglyceride; • regulation of circadian rhythm; • regulation of fatty acid metabolic process; • epidermis development; • регуляція експресії генів; • enamel mineralization; • positive regulation of gluconeogenesis; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • negative regulation of inflammatory response; • negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • steroid hormone mediated signaling pathway; • negative regulation of neuron death; • positive regulation of fatty acid oxidation; • regulation of lipid metabolic process; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • розвиток багатоклітинного організму; • hormone-mediated signaling pathway; • диференціація клітин; • response to lipid; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of cell growth involved in cardiac muscle cell development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5465
	19013
	ENSG00000186951
	ENSMUSG00000022383
	Q07869; Q86SF0
	P23204
NM_001001928; NM_001001929; NM_001001930; NM_005036; NM_032644;
	NM_001362872; NM_001362873; NM_001393941; NM_001393942; NM_001393943; NM_001393944; NM_001393945; NM_001393946; NM_001393947
	NM_001113418; NM_011144
	NP_001001928; NP_005027; NP_001349801; NP_001349802
	NP_001106889; NP_035274
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PPARA (англ. Peroxisome proliferator activated receptor alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 468 амінокислот, а молекулярна маса — 52 225^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVDTESPLCP	LSPLEAGDLE	SPLSEEFLQE	MGNIQEISQS	IGEDSSGSFG
FTEYQYLGSC	PGSDGSVITD	TLSPASSPSS	VTYPVVPGSV	DESPSGALNI
ECRICGDKAS	GYHYGVHACE	GCKGFFRRTI	RLKLVYDKCD	RSCKIQKKNR
NKCQYCRFHK	CLSVGMSHNA	IRFGRMPRSE	KAKLKAEILT	CEHDIEDSET
ADLKSLAKRI	YEAYLKNFNM	NKVKARVILS	GKASNNPPFV	IHDMETLCMA
EKTLVAKLVA	NGIQNKEAEV	RIFHCCQCTS	VETVTELTEF	AKAIPGFANL
DLNDQVTLLK	YGVYEAIFAM	LSSVMNKDGM	LVAYGNGFIT	REFLKSLRKP
FCDIMEPKFD	FAMKFNALEL	DDSDISLFVA	AIICCGDRPG	LLNVGHIEKM
QEGIVHVLRL	HLQSNHPDDI	FLFPKLLQKM	ADLRQLVTEH	AQLVQIIKKT
ESDAALHPLL	QEIYRDMY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами, іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Sher T., Yi H.F., McBride O.W., Gonzales F.J. (1993). cDNA cloning, chromosomal mapping, and functional characterization of the human peroxisome proliferator activated receptor. Biochemistry. 32: 5598—5604. PMID 7684926 doi:10.1021/bi00072a015
Mukherjee R., Jow L., Noonan D., McDonnell D.P. (1994). Human and rat peroxisome proliferator activated receptors (PPARs) demonstrate similar tissue distribution but different responsiveness to PPAR activators. J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 51: 157—166. PMID 7981125 doi:10.1016/0960-0760(94)90089-2
Tugwood J.D., Aldridge T.C., Lambe K.G., Macdonald N., Woodyatt N.J. (1996). Peroxisome proliferator-activated receptors: structures and function. Ann. N. Y. Acad. Sci. 804: 252—265. PMID 8993548 doi:10.1111/j.1749-6632.1996.tb18620.x
Kobayashi T., Kodani Y., Nozawa A., Endo Y., Sawasaki T. (2008). DNA-binding profiling of human hormone nuclear receptors via fluorescence correlation spectroscopy in a cell-free system. FEBS Lett. 582: 2737—2744. PMID 18619963 doi:10.1016/j.febslet.2008.07.003
Li H., Gomes P.J., Chen J.D. (1997). RAC3, a steroid/nuclear receptor-associated coactivator that is related to SRC-1 and TIF2. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 8479—8484. PMID 9238002 doi:10.1073/pnas.94.16.8479
Gorla-Bajszczak A., Juge-Aubry C., Pernin A., Burger A.G., Meier C.A. (1999). Conserved amino acids in the ligand-binding and tau(i) domains of the peroxisome proliferator-activated receptor alpha are necessary for heterodimerization with RXR. Mol. Cell. Endocrinol. 147: 37—47. PMID 10195690 doi:10.1016/S0303-7207(98)00217-2