POU5F1

POU5F1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1OCP, 3L1P
Ідентифікатори
Символи	POU5F1, OCT3, OCT4, OTF-3, OTF3, OTF4, Oct-3, Oct-4, POU class 5 homeobox 1, Oct3/4
Зовнішні ІД	OMIM: 164177 MGI: 101893 HomoloGene: 8422 GeneCards: POU5F1
Пов'язані генетичні захворювання
	синдром Стівенса — Джонсона
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з ДНК; • специфічне до послідовності зв'язування з ДНК; • miRNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • зв'язування з фактором транскрипції; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • зв'язування з убіквітинпротеїнлігазою; • зв'язування з РНК;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • регуляторний транскрипційний комплекс; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • мітохондрія;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • somatic stem cell population maintenance; • GO:1905617 negative regulation of gene silencing by miRNA; • cell fate commitment involved in formation of primary germ layer; • endodermal cell fate specification; • anatomical structure morphogenesis; • mRNA transcription by RNA polymerase II; • regulation of asymmetric cell division; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • транскрипція РНК-полімеразою II; • ДНК-матрична транскрипція; • regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly; • розвиток багатоклітинного організму; • cardiac cell fate determination; • response to wounding; • BMP signaling pathway involved in heart induction; • регуляція експресії генів; • regulation of heart induction by regulation of canonical Wnt signaling pathway; • blastocyst development; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of SMAD protein signal transduction;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5460
	18999
ENSG00000230336; ENSG00000206454; ENSG00000204531; ENSG00000237582; ENSG00000229094;
	ENSG00000233911; ENSG00000235068
	ENSMUSG00000024406
	Q01860
	P20263
	NM_203289; NM_001173531; NM_001285986; NM_001285987; NM_002701
	NM_001252452; NM_013633
NP_001167002; NP_001272915; NP_001272916; NP_002692; NP_976034;
	NP_001272915.1
	NP_001239381; NP_038661
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

POU5F1 (англ. POU class 5 homeobox 1), також відомий як OCT4 (англ. octamer-binding transcription factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Двокомпонентний гомеодоменний фактор транскрипції, належить до родини Pit-Oct-Unc (POU)^[5]. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 360 амінокислот, а молекулярна маса — 38 571^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGHLASDFA	FSPPPGGGGD	GPGGPEPGWV	DPRTWLSFQG	PPGGPGIGPG
VGPGSEVWGI	PPCPPPYEFC	GGMAYCGPQV	GVGLVPQGGL	ETSQPEGEAG
VGVESNSDGA	SPEPCTVTPG	AVKLEKEKLE	QNPEESQDIK	ALQKELEQFA
KLLKQKRITL	GYTQADVGLT	LGVLFGKVFS	QTTICRFEAL	QLSFKNMCKL
RPLLQKWVEE	ADNNENLQEI	CKAETLVQAR	KRKRTSIENR	VRGNLENLFL
QCPKPTLQQI	SHIAQQLGLE	KDVVRVWFCN	RRQKGKRSSS	DYAQREDFEA
AGSPFSGGPV	SFPLAPGPHF	GTPGYGSPHF	TALYSSVPFP	EGEAFPPVSV
TTLGSPMHSN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, її регуляція, альтернативний сплайсинг.

Один із основних факторів плюрипотентності, підвищує експресію TET2 шляхом зв'язування з його проксимальною промоторною ділянкою^[7], також має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Takeda J., Seino S., Bell G.I. (1992). Human Oct3 gene family: cDNA sequences, alternative splicing, gene organization, chromosomal location, and expression at low levels in adult tissues. Nucleic Acids Res. 20: 4613—4620. PMID 1408763 doi:10.1093/nar/20.17.4613
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Wey E., Lyons G.E., Schaefer B.W. (1994). A human POU domain gene, mPOU, is expressed in developing brain and specific adult tissues. Eur. J. Biochem. 220: 753—762. PMID 7908264 doi:10.1111/j.1432-1033.1994.tb18676.x
Abdel-Rahman B., Fiddler M., Rappolee D., Pergament E. (1995). Expression of transcription regulating genes in human preimplantation embryos. Hum. Reprod. 10: 2787—2792. PMID 8567814 doi:10.1093/oxfordjournals.humrep.a135792
Lee J., Kim H.K., Han Y.-M., Kim J. (2008). Pyruvate kinase isozyme type M2 (PKM2) interacts and cooperates with Oct-4 in regulating transcription. Int. J. Biochem. Cell Biol. 40: 1043—1054. PMID 18191611 doi:10.1016/j.biocel.2007.11.009
Spelat R., Ferro F., Curcio F. (2012). Serine 111 phosphorylation regulates OCT4A protein subcellular distribution and degradation. J. Biol. Chem. 287: 38279—38288. PMID 23024368 doi:10.1074/jbc.M112.386755

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з POU5F1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9221 (англ.) . Архів оригіналу за 21 грудня 2014. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2014-12-21 у Wayback Machine.]
↑ Wang, Mengxi (10 лютого 2014). Studies of Mechanisms Regulating Tet Proteins (PDF). edoc.ub.uni-muenchen.de (англ.). Ludwig-Maximilians-Universität München.
↑ UniProt, Q01860 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ Yang J, Bashkenova N, Zang R, Huang X, Wang J (15 січня 2020). The roles of TET family proteins in development and stem cells. Development. 147 (2): dev183129. doi:10.1242/dev.183129. PMC 6983710. PMID 31941705.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з POU5F1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9221 (англ.) . Архів оригіналу за 21 грудня 2014. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2014-12-21 у Wayback Machine.]

[Wang2014-5] Wang, Mengxi (10 лютого 2014). Studies of Mechanisms Regulating Tet Proteins (PDF). edoc.ub.uni-muenchen.de (англ.). Ludwig-Maximilians-Universität München.

[UniProt-6] UniProt, Q01860 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[Yang2020-7] Yang J, Bashkenova N, Zang R, Huang X, Wang J (15 січня 2020). The roles of TET family proteins in development and stem cells. Development. 147 (2): dev183129. doi:10.1242/dev.183129. PMC 6983710. PMID 31941705.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]