HTR1B

HTR1B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4IAQ, 4IAR
Ідентифікатори
Символи	HTR1B, 5-HT1B, 5-HT1DB, HTR1D2, HTR1DB, S12, 5-HT-1B, 5-HT-1D-beta, 5-hydroxytryptamine receptor 1B
Зовнішні ІД	OMIM: 182131 MGI: 96274 HomoloGene: 669 GeneCards: HTR1B
Реагує на сполуку
	frovatriptan, 1-naphthylpiperazine, 2-methyl-5-HT, 5-carboxamidotryptamine, Серотонін, 5-methoxytryptamine, 5-(Nonyloxy)-tryptamine, 8-OH-DPAT, alniditan, арипіпразол, каберголін, CGS-12066A, клозапін, CP-122288, CP94253, дігідроертотамін, donitriptan, елетріптан, lysergol, оланзапін, оксиметазолін, pergolide, ru-24969, 1-(3-trifluoromethylphenyl)piperazine, триптамін, ксаномелін, зипразидон, brl-15572, бромокриптин, gr-127935, lisuride, наратріптан, різатріптан, roxindole, sb-216641, суматріптан, terguride, вортіоксетин, золмітріптан, ketanserin, metergoline, methysergide, ocaperidone, pipamperone, α-yohimbine, рисперидон, ritanserin, сертиндол, yohimbine, zotepine, metitepine, SB236057, sumatriptan succinate, donitriptan, Зімелідин, різатріптан, золмітріптан, naratriptan hydrochloride
Онтологія гена
Молекулярна функція	• активність G-білокспряженого рецептора; • сигнальна трансдукторна активність; • G protein-coupled serotonin receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • neurotransmitter receptor activity; • serotonin binding; • voltage-gated calcium channel activity involved in regulation of presynaptic cytosolic calcium levels;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • інтегральний компонент мембрани; • мембрана; • інтегральний компонент плазматичної мембрани; • клітинна мембрана; • calyx of Held; • інтегральний компонент пресинаптичної мембрани; • serotonergic synapse; • дендрит;
Біологічний процес	• chemical synaptic transmission; • G protein-coupled receptor internalization; • regulation of dopamine secretion; • regulation of behavior; • response to mineralocorticoid; • вазоконстрикція; • adenylate cyclase-inhibiting serotonin receptor signaling pathway; • G protein-coupled receptor signaling pathway, coupled to cyclic nucleotide second messenger; • cellular response to alkaloid; • negative regulation of serotonin secretion; • cellular response to temperature stimulus; • negative regulation of synaptic transmission, GABAergic; • protein kinase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway; • drinking behavior; • ремоделювання кісткової тканини; • харчова поведінка; • response to ethanol; • negative regulation of synaptic transmission, glutamatergic; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • response to cocaine; • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • adenylate cyclase-inhibiting G protein-coupled receptor signaling pathway; • GO:0035737 поведінка тварин; • presynaptic modulation of chemical synaptic transmission; • regulation of synaptic vesicle exocytosis; • regulation of presynaptic cytosolic calcium ion concentration;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3351
	15551
	ENSG00000135312
	ENSMUSG00000049511
	P28222
	P28334
	NM_000863
	NM_010482
	NP_000854
	NP_034612
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HTR1B (англ. 5-hydroxytryptamine receptor 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 390 амінокислот, а молекулярна маса — 43 568^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEEPGAQCAP	PPPAGSETWV	PQANLSSAPS	QNCSAKDYIY	QDSISLPWKV
LLVMLLALIT	LATTLSNAFV	IATVYRTRKL	HTPANYLIAS	LAVTDLLVSI
LVMPISTMYT	VTGRWTLGQV	VCDFWLSSDI	TCCTASILHL	CVIALDRYWA
ITDAVEYSAK	RTPKRAAVMI	ALVWVFSISI	SLPPFFWRQA	KAEEEVSECV
VNTDHILYTV	YSTVGAFYFP	TLLLIALYGR	IYVEARSRIL	KQTPNRTGKR
LTRAQLITDS	PGSTSSVTSI	NSRVPDVPSE	SGSPVYVNQV	KVRVSDALLE
KKKLMAARER	KATKTLGIIL	GAFIVCWLPF	FIISLVMPIC	KDACWFHLAI
FDFFTWLGYL	NSLINPIIYT	MSNEDFKQAF	HKLIRFKCTS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Hamblin M.W., Metcalf M.A., McGuffin R.W., Karpells S. (1992). Molecular cloning and functional characterization of a human 5-HT1B serotonin receptor: a homologue of the rat 5-HT1B receptor with 5-HT1D-like pharmacological specificity. Biochem. Biophys. Res. Commun. 184: 752—759. PMID 1315531 doi:10.1016/0006-291X(92)90654-4
Mochizuki D., Yuyama Y., Tsujita R., Komaki H., Sagai H. (1992). Cloning and expression of the human 5-HT1B-type receptor gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 185: 517—523. PMID 1610347 doi:10.1016/0006-291X(92)91655-A
Weinshank R.L., Zgombick J.M., Macchi M.J., Branchek T.A., Hartig P.R. (1992). Human serotonin 1D receptor is encoded by a subfamily of two distinct genes: 5-HT1D alpha and 5-HT1D beta. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 3630—3634. PMID 1565658 doi:10.1073/pnas.89.8.3630
Kitano T., Liu Y.-H., Ueda S., Saitou N. (2004). Human-specific amino acid changes found in 103 protein-coding genes. Mol. Biol. Evol. 21: 936—944. PMID 15014171 doi:10.1093/molbev/msh100
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Xie Z., Lee S.P., O'Dowd B.F., George S.R. (1999). Serotonin 5-HT1B and 5-HT1D receptors form homodimers when expressed alone and heterodimers when co-expressed. FEBS Lett. 456: 63—67. PMID 10452531 doi:10.1016/S0014-5793(99)00918-7