ZNF473

ZNF473
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2EMB, 2EMC, 2EME, 2EOU, 2EOX, 2EOY, 2EOZ, 2YRH, 2YRJ, 2YSV, 2YTD, 2YTE, 2YTT, 2YU5
Ідентифікатори
Символи	ZNF473, HZFP100, ZN473, zinc finger protein 473, ZFP100
Зовнішні ІД	OMIM: 617908 MGI: 2442697 HomoloGene: 18698 GeneCards: ZNF473
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв’язування з іоном металу; • зв'язування з ДНК; • зв'язування з нуклеїновими кислотами; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми;
Клітинна компонента	• Тільце Кахаля; • клітинне ядро; • внутрішньоклітинний; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• termination of RNA polymerase II transcription; • mRNA 3'-end processing by stem-loop binding and cleavage; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • histone mRNA metabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	25888
	243963
	ENSG00000142528
	ENSMUSG00000048012
	Q8WTR7
	Q8BI67
	NM_001006656; NM_001308424; NM_015428
	NM_001289836; NM_001289837; NM_001289838; NM_001289839; NM_178734
	NP_001006657; NP_001295353; NP_056243
	NP_001276765; NP_001276766; NP_001276767; NP_001276768; NP_848849
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ZNF473 (англ. Zinc finger protein 473) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 871 амінокислот, а молекулярна маса — 100 182^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEEFVTLKD	VGMDFTLGDW	EQLGLEQGDT	FWDTALDNCQ	DLFLLDPPRP
NLTSHPDGSE	DLEPLAGGSP	EATSPDVTET	KNSPLMEDFF	EEGFSQEIIE
MLSKDGFWNS	NFGEACIEDT	WLDSLLGDPE	SLLRSDIATN	GESPTECKSH
ELKRGLSPVS	TVSTGEDSMV	HNVSEKTLTP	AKSKEYRGEF	FSYSDHSQQD
SVQEGEKPYQ	CSECGKSFSG	SYRLTQHWIT	HTREKPTVHQ	ECEQGFDRNA
SLSVYPKTHT	GYKFYVCNEY	GTTFSQSTYL	WHQKTHTGEK	PCKSQDSDHP
PSHDTQPGEH	QKTHTDSKSY	NCNECGKAFT	RIFHLTRHQK	IHTRKRYECS
KCQATFNLRK	HLIQHQKTHA	AKTTSECQEC	GKIFRHSSLL	IEHQALHAGE
EPYKCNERGK	SFRHNSTLKI	HQRVHSGEKP	YKCSECGKAF	HRHTHLNEHR
RIHTGYRPHK	CQECVRSFSR	PSHLMRHQAI	HTAEKPYSCA	ECKETFSDNN
RLVQHQKMHT	VKTPYECQEC	GERFICGSTL	KCHESVHARE	KQGFFVSGKI
LDQNPEQKEK	CFKCNKCEKT	FSCSKYLTQH	ERIHTRGVKP	FECDQCGKAF
GQSTRLIHHQ	RIHSRVRLYK	WGEQGKAISS	ASLIKLQSFH	TKEHPFKCNE
CGKTFSHSAH	LSKHQLIHAG	ENPFKCSKCD	RVFTQRNYLV	QHERTHARKK
PLVCNECGKT	FRQSSCLSKH	QRIHSGEKPY	VCDYCGKAFG	LSAELVRHQR
IHTGEKPYVC	QECGKAFTQS	SCLSIHRRVH	TGEKPYRCGE	CGKAFAQKAN
LTQHQRIHTG	EKPYSCNVCG	KAFVLSAHLN	QHLRVHTQET	LYQCQRCQKA
FRCHSSLSRH	QRVHNKQQYC	L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Dominski Z., Erkmann J.A., Yang X., Sanchez R., Marzluff W.F. (2002). A novel zinc finger protein is associated with U7 snRNP and interacts with the stem-loop binding protein in the histone pre-mRNP to stimulate 3'-end processing. Genes Dev. 16: 58—71. PMID 11782445 doi:10.1101/gad.932302
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Azzouz T.N., Gruber A., Schuemperli D. (2005). U7 snRNP-specific Lsm11 protein: dual binding contacts with the 100 kDa zinc finger processing factor (ZFP100) and a ZFP100-independent function in histone RNA 3'-end processing. Nucleic Acids Res. 33: 2106—2117. PMID 15824063 doi:10.1093/nar/gki516
Wagner E.J., Marzluff W.F. (2006). ZFP100, a component of the active U7 snRNP limiting for histone pre-mRNA processing, is required for entry into S phase. Mol. Cell. Biol. 26: 6702—6712. PMID 16914750 doi:10.1128/MCB.00391-06

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23239 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8WTR7 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23239 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q8WTR7 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]