Рецептор ліпопротеїнів дуже низької щільності

Рецептор ліпопротеїнів дуже низької щільності
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1V9U, 3DPR
Ідентифікатори
Символи	VLDLR, CAMRQ1, CARMQ1, CHRMQ1, VLDLRCH, VLDL-R, very low density lipoprotein receptor
Зовнішні ІД	OMIM: 192977 MGI: 98935 HomoloGene: 443 GeneCards: VLDLR
Пов'язані генетичні захворювання
	cerebellar ataxia, mental retardation, and dysequilibrium syndrome 1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• активність рецептора частинок ліпопротеїнів низької щільності; • reelin receptor activity; • зв'язування з іоном кальцію; • зв'язування з аполіпопротеїнами; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • very-low-density lipoprotein particle binding; • calcium-dependent protein binding; • very-low-density lipoprotein particle receptor activity; • cargo receptor activity;
Клітинна компонента	• інтегральний компонент мембрани; • мембрана; • рецепторний комплекс; • клітинна мембрана; • very-low-density lipoprotein particle; • clathrin-coated pit; • міжклітинний простір; • lysosomal membrane;
Біологічний процес	• steroid metabolic process; • lipid transport; • ендоцитоз; • dendrite morphogenesis; • обмін жирів; • glycoprotein transport; • cholesterol metabolic process; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • пам'ять; • positive regulation of dendrite development; • рецептор-опосередкований ендоцитоз; • нейробіологія розвитку; • ventral spinal cord development; • reelin-mediated signaling pathway; • GO:0015915 транспорт; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • positive regulation of protein kinase activity; • axon guidance; • low-density lipoprotein particle receptor catabolic process; • very-low-density lipoprotein particle clearance;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	7436
	22359
	ENSG00000147852
	ENSMUSG00000024924
	P98155
	P98156
	NM_001018056; NM_003383; NM_001322225; NM_001322226
	NM_001161420; NM_013703; NM_001347441
	NP_001018066; NP_001309154; NP_001309155; NP_003374
	NP_001154892; NP_001334370; NP_038731
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Рецептор ліпопротеїнів дуже низької щільності (ЛПДНЩ-рецептор;англ. Very low density lipoprotein receptor, VLDLR) – білок, який кодується геном VLDLR, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 873 амінокислот, а молекулярна маса — 96 098^[5]. За структурою схожий із рецептором ліпопротеїнів низької щільності, але не здатний зв'язувати ліпопротеїни низької щільності. Рецептор ЛПДНЩ відіграє роль в метаболізмі ліпопротеїнів дуже низької щільності. Експресія ЛПДНЩ-рецептору висока в серці, скелетних м'язах, жировій тканині; ЛПДНЩ-рецептор спільно з рецептором ЛНЩ зв'язує і захоплює залишкові ліпопротеїни: ліпопротеїни проміжної щільності і хіломікронні ремнанти^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGTSALWALW	LLLALCWAPR	ESGATGTGRK	AKCEPSQFQC	TNGRCITLLW
KCDGDEDCVD	GSDEKNCVKK	TCAESDFVCN	NGQCVPSRWK	CDGDPDCEDG
SDESPEQCHM	RTCRIHEISC	GAHSTQCIPV	SWRCDGENDC	DSGEDEENCG
NITCSPDEFT	CSSGRCISRN	FVCNGQDDCS	DGSDELDCAP	PTCGAHEFQC
STSSCIPISW	VCDDDADCSD	QSDESLEQCG	RQPVIHTKCP	ASEIQCGSGE
CIHKKWRCDG	DPDCKDGSDE	VNCPSRTCRP	DQFECEDGSC	IHGSRQCNGI
RDCVDGSDEV	NCKNVNQCLG	PGKFKCRSGE	CIDISKVCNQ	EQDCRDWSDE
PLKECHINEC	LVNNGGCSHI	CKDLVIGYEC	DCAAGFELID	RKTCGDIDEC
QNPGICSQIC	INLKGGYKCE	CSRGYQMDLA	TGVCKAVGKE	PSLIFTNRRD
IRKIGLERKE	YIQLVEQLRN	TVALDADIAA	QKLFWADLSQ	KAIFSASIDD
KVGRHVKMID	NVYNPAAIAV	DWVYKTIYWT	DAASKTISVA	TLDGTKRKFL
FNSDLREPAS	IAVDPLSGFV	YWSDWGEPAK	IEKAGMNGFD	RRPLVTADIQ
WPNGITLDLI	KSRLYWLDSK	LHMLSSVDLN	GQDRRIVLKS	LEFLAHPLAL
TIFEDRVYWI	DGENEAVYGA	NKFTGSELAT	LVNNLNDAQD	IIVYHELVQP
SGKNWCEEDM	ENGGCEYLCL	PAPQINDHSP	KYTCSCPSGY	NVEENGRDCQ
STATTVTYSE	TKDTNTTEIS	ATSGLVPGGI	NVTTAVSEVS	VPPKGTSAAW
AILPLLLLVM	AAVGGYLMWR	NWQHKNMKSM	NFDNPVYLKT	TEEDLSIDIG
RHSASVGHTY	PAISVVSTDD	DLA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани.

Див. також

Хромосома 9

Література

Webb J.C., Patel D.D., Jones M.D., Knight B.L., Soutar A.K. (1994). Characterization and tissue-specific expression of the human 'very low density lipoprotein (VLDL) receptor' mRNA. Hum. Mol. Genet. 3: 531—537. PMID 8069294 doi:10.1093/hmg/3.4.531
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Neumann E., Moser R., Snyers L., Blaas D., Hewat E.A. (2003). A cellular receptor of human rhinovirus type 2, the very-low-density lipoprotein receptor, binds to two neighboring proteins of the viral capsid. J. Virol. 77: 8504—8511. PMID 12857919 doi:10.1128/JVI.77.15.8504-8511.2003
Verdaguer N., Fita I., Reithmayer M., Moser R., Blaas D. (2004). X-ray structure of a minor group human rhinovirus bound to a fragment of its cellular receptor protein. Nat. Struct. Mol. Biol. 11: 429—434. PMID 15064754 doi:10.1038/nsmb753

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з Рецептор ліпопротеїнів дуже низької щільності переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12698 (англ.) . Архів оригіналу за 2 травня 2018. Процитовано 26 квітня 2018.
↑ UniProt, P98155 (англ.) . Процитовано 26 квітня 2018.
↑ Takahashi S, Sakai J, Fujino T, Hattori H, Zenimaru Y, Suzuki J, Miyamori I, Yamamoto TT (2004). The very low-density lipoprotein (VLDL) receptor: characterization and functions as a peripheral lipoprotein receptor. J. Atheroscler. Thromb. 11 (4): 200—8. PMID 15356379.

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з Рецептор ліпопротеїнів дуже низької щільності переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12698 (англ.) . Архів оригіналу за 2 травня 2018. Процитовано 26 квітня 2018.

[UniProt-5] UniProt, P98155 (англ.) . Процитовано 26 квітня 2018.

[Takahashi_2004-6] Takahashi S, Sakai J, Fujino T, Hattori H, Zenimaru Y, Suzuki J, Miyamori I, Yamamoto TT (2004). The very low-density lipoprotein (VLDL) receptor: characterization and functions as a peripheral lipoprotein receptor. J. Atheroscler. Thromb. 11 (4): 200—8. PMID 15356379.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]