TSEN2

TSEN2
Ідентифікатори
Символи	TSEN2, PCH2B, SEN2, SEN2L, tRNA splicing endonuclease subunit 2
Зовнішні ІД	OMIM: 608753 MGI: 2141599 HomoloGene: 41622 GeneCards: TSEN2
шифр КФ	4.6.1.16
Пов'язані генетичні захворювання
	рак простати, pontocerebellar hypoplasia type 2B, pontocerebellar hypoplasia type 2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• tRNA-intron endonuclease activity; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • ліазна активність; • зв'язування з нуклеїновими кислотами; • nuclease activity;
Клітинна компонента	• центросома; • ядерце; • клітинне ядро; • tRNA-intron endonuclease complex; • нуклеоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• процесинг мРНК; • tRNA-type intron splice site recognition and cleavage; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic; • tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation; • RNA phosphodiester bond hydrolysis; • tRNA processing; • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	80746
	381802
	ENSG00000154743
	ENSMUSG00000042389
	Q8NCE0
	Q6P7W5
NM_001145392; NM_001145393; NM_001145394; NM_001145395; NM_025265;
	NM_001321277; NM_001321278; NM_001321279
	NM_199033
NP_001138864; NP_001138865; NP_001138866; NP_001308206; NP_001308207;
	NP_001308208; NP_079541
	NP_950198
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TSEN2 (англ. TRNA splicing endonuclease subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 465 амінокислот, а молекулярна маса — 53 247^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEAVFHAPK	RKRRVYETYE	SPLPIPFGQD	HGPLKEFKIF	RAEMINNNVI
VRNAEDIEQL	YGKGYFGKGI	LSRSRPSFTI	SDPKLVAKWK	DMKTNMPIIT
SKRYQHSVEW	AAELMRRQGQ	DESTVRRILK	DYTKPLEHPP	VKRNEEAQVH
DKLNSGMVSN	MEGTAGGERP	SVVNGDSGKS	GGVGDPREPL	GCLQEGSGCH
PTTESFEKSV	REDASPLPHV	CCCKQDALIL	QRGLHHEDGS	QHIGLLHPGD
RGPDHEYVLV	EEAECAMSER	EAAPNEELVQ	RNRLICRRNP	YRIFEYLQLS
LEEAFFLVYA	LGCLSIYYEK	EPLTIVKLWK	AFTVVQPTFR	TTYMAYHYFR
SKGWVPKVGL	KYGTDLLLYR	KGPPFYHASY	SVIIELVDDH	FEGSLRRPLS
WKSLAALSRV	SVNVSKELML	CYLIKPSTMT	DKEMESPECM	KRIKVQEVIL
SRWVSSRERS	DQDDL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, процесинг тРНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Paushkin S.V., Patel M., Furia B.S., Peltz S.W., Trotta C.R. (2004). Identification of a human endonuclease complex reveals a link between tRNA splicing and pre-mRNA 3' end formation. Cell. 117: 311—321. PMID 15109492 doi:10.1016/S0092-8674(04)00342-3
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504