TRIM21

TRIM21
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2IWG
Ідентифікатори
Символи	TRIM21, RNF81, RO52, Ro/SSA, SSA, SSA1, tripartite motif containing 21, Tripartite motif-containing protein 21
Зовнішні ІД	OMIM: 109092 MGI: 106657 HomoloGene: 2365 GeneCards: TRIM21
шифр КФ	2.3.2.27
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з ДНК; • зв'язування з іонами цинку; • зв’язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • зв'язування з РНК; • identical protein binding; • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • трансферазна активність;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • SCF ubiquitin ligase complex; • P-тільце; • внутрішньоклітинний; • autophagosome; • GO:0016023 цитоплазматичний міхур; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • рибонуклеопротеїни;
Біологічний процес	• negative regulation of protein deubiquitination; • відповідь на γ-інтерферон; • positive regulation of autophagy; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • protein trimerization; • positive regulation of viral entry into host cell; • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity; • protein monoubiquitination; • regulation of type I interferon production; • positive regulation of cell cycle; • protein destabilization; • Убіквітин-залежний протеоліз; • клітинний цикл; • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • protein autoubiquitination; • вроджений імунітет; • protein polyubiquitination; • negative regulation of viral transcription;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6737
	20821
	ENSG00000132109
	ENSMUSG00000030966
	P19474
	Q62191
	NM_003141
	NM_001082552; NM_009277
	NP_003132
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TRIM21 (англ. Tripartite motif containing 21) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 475 амінокислот, а молекулярна маса — 54 170^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASAARLTMM	WEEVTCPICL	DPFVEPVSIE	CGHSFCQECI	SQVGKGGGSV
CPVCRQRFLL	KNLRPNRQLA	NMVNNLKEIS	QEAREGTQGE	RCAVHGERLH
LFCEKDGKAL	CWVCAQSRKH	RDHAMVPLEE	AAQEYQEKLQ	VALGELRRKQ
ELAEKLEVEI	AIKRADWKKT	VETQKSRIHA	EFVQQKNFLV	EEEQRQLQEL
EKDEREQLRI	LGEKEAKLAQ	QSQALQELIS	ELDRRCHSSA	LELLQEVIIV
LERSESWNLK	DLDITSPELR	SVCHVPGLKK	MLRTCAVHIT	LDPDTANPWL
ILSEDRRQVR	LGDTQQSIPG	NEERFDSYPM	VLGAQHFHSG	KHYWEVDVTG
KEAWDLGVCR	DSVRRKGHFL	LSSKSGFWTI	WLWNKQKYEA	GTYPQTPLHL
QVPPCQVGIF	LDYEAGMVSF	YNITDHGSLI	YSFSECAFTG	PLRPFFSPGF
NDGGKNTAPL	TLCPLNIGSQ	GSTDY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, цитоплазматичних везикулах.

Література

Itoh K., Itoh Y., Frank M.B. (1991). Protein heterogeneity in the human Ro/SSA ribonucleoproteins. The 52- and 60-kD Ro/SSA autoantigens are encoded by separate genes. J. Clin. Invest. 87: 177—186. PMID 1985094 doi:10.1172/JCI114968
Chan E.K., Hamel J.C., Buyon J.P., Tan E.M. (1991). Molecular definition and sequence motifs of the 52-kD component of human SS-A/Ro autoantigen. J. Clin. Invest. 87: 68—76. PMID 1985112 doi:10.1172/JCI115003
Tsugu H., Horowitz R., Gibson N., Frank M.B. (1994). The location of a disease-associated polymorphism and genomic structure of the human 52-kDa Ro/SSA locus (SSA1). Genomics. 24: 541—548. PMID 7713506 doi:10.1006/geno.1994.1664
Keech C.L., Gordon T.P., McCluskey J. (1996). Structural differences between the human and mouse 52-kD Ro autoantigens associated with poorly conserved autoantibody activity across species. Clin. Exp. Immunol. 104: 255—263. PMID 8625517 doi:10.1046/j.1365-2249.1996.16726.x
Bepler G., O'Briant K.C., Kim Y.-C., Schreiber G., Pitterle D.M. (1999). A 1.4-Mb high-resolution physical map and contig of chromosome segment 11p15.5 and genes in the LOH11A metastasis suppressor region. Genomics. 55: 164—175. PMID 9933563 doi:10.1006/geno.1998.5659
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11312 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-26 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P19474 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11312 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-26 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P19474 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]