TNNC1

TNNC1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1AP4, 1IH0, 1J1D, 1J1E, 1LXF, 1MXL, 1OZS, 1SPY, 1WRK, 1WRL, 2JT0, 2JT3, 2JT8, 2JTZ, 2JXL, 2KDH, 2KFX, 2KGB, 2KRD, 2L1R, 2L98, 2MKP, 2MLE, 2MLF, 2MZP, 3RV5, 3SD6, 3SWB, 4GJE, 4GJF, 4GJG, 2N79, 4Y99
Ідентифікатори
Символи	TNNC1, CMD1Z, CMH13, TN-C, TNC, TNNC, Troponin C type 1, troponin C1, slow skeletal and cardiac type
Зовнішні ІД	OMIM: 191040 MGI: 98779 HomoloGene: 55728 GeneCards: TNNC1
Пов'язані генетичні захворювання
	dilated cardiomyopathy 1Z, hypertrophic cardiomyopathy 13
Реагує на сполуку
	Левосимендан
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном кальцію; • гомодимеризація білків; • troponin T binding; • зв’язування з іоном металу; • calcium-dependent protein binding; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • troponin I binding; • зв'язування з актиновими філаментами;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • Тропонін; • скоротливе волокно; • cardiac Troponin complex;
Біологічний процес	• regulation of muscle contraction; • transition between fast and slow fiber; • diaphragm contraction; • response to metal ion; • ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis; • muscle filament sliding; • regulation of muscle filament sliding speed; • regulation of ATP-dependent activity; • skeletal muscle contraction; • cardiac muscle contraction;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7134
	21924
	ENSG00000114854
	ENSMUSG00000091898
	P63316
	P19123
	NM_003280
	NM_009393
	NP_003271
	NP_033419
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TNNC1 (англ. Troponin C1, slow skeletal and cardiac type) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 161 амінокислот, а молекулярна маса — 18 403^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDDIYKAAVE	QLTEEQKNEF	KAAFDIFVLG	AEDGCISTKE	LGKVMRMLGQ
NPTPEELQEM	IDEVDEDGSG	TVDFDEFLVM	MVRCMKDDSK	GKSEEELSDL
FRMFDKNADG	YIDLDELKIM	LQATGETITE	DDIEELMKDG	DKNNDGRIDY
DEFLEFMKGV	E

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до м'язових білків, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію.

Література

Roher A., Lieska N., Spitz W. (1986). The amino acid sequence of human cardiac troponin-C. Muscle Nerve. 9: 73—77. PMID 3951483 doi:10.1002/mus.880090112
Gahlmann R., Wade R., Gunning R., Kedes L. (1988). Differential expression of slow and fast skeletal muscle troponin C. Slow skeletal muscle troponin C is expressed in human fibroblasts. J. Mol. Biol. 201: 379—391. PMID 3166492 doi:10.1016/0022-2836(88)90145-3
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Takeda S., Kobayashi T., Taniguchi H., Hayashi H., Maeda Y. (1997). Structural and functional domains of the troponin complex revealed by limited digestion. Eur. J. Biochem. 246: 611—617. PMID 9219516 doi:10.1111/j.1432-1033.1997.00611.x
Lindhout D.A., Sykes B.D. (2003). Structure and dynamics of the C-domain of human cardiac troponin C in complex with the inhibitory region of human cardiac troponin I. J. Biol. Chem. 278: 27024—27034. PMID 12732641 doi:10.1074/jbc.M302497200
Hoffmann B., Schmidt-Traub H., Perrot A., Osterziel K.J., Gessner R. (2001). First mutation in cardiac troponin C, L29Q, in a patient with hypertrophic cardiomyopathy. Hum. Mutat. 17: 524—524. PMID 11385718 doi:10.1002/humu.1143

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TNNC1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Troponin C1, slow skeletal and cardiac type переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11943 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P63316 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з TNNC1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Troponin C1, slow skeletal and cardiac type переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11943 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-6] UniProt, P63316 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]