TBP

TBP
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1TGH, 1C9B, 1JFI, 1NVP, 4ROC, 4ROE, 4ROD, 5IY9, 5IYA, 5FUR, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6
Ідентифікатори
Символи	TBP, GTF2D, GTF2D1, HDL4, SCA17, TFIID, TATA-box binding protein, TATA-binding protein, TBP1
Зовнішні ІД	OMIM: 600075 MGI: 101838 HomoloGene: 2404 GeneCards: TBP
Пов'язані генетичні захворювання
	spinocerebellar ataxia type 17
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з ДНК; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • зв'язування з фактором транскрипції; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • enzyme binding; • TFIIB-class transcription factor binding; • aryl hydrocarbon receptor binding; • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • RNA polymerase III general transcription initiation factor activity; • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity; • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase III transcription regulatory region sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • transcription factor TFIID complex; • male pronucleus; • female pronucleus; • нуклеоплазма; • transcription factor TFIIA complex; • Пронуклеус; • клітинне ядро; • transcription preinitiation complex; • GO:0009327 protein-containing complex; • transcription factor TFIIIB complex; • регуляторний транскрипційний комплекс;
Біологічний процес	• termination of RNA polymerase I transcription; • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription initiation from RNA polymerase I promoter; • ДНК-матрична транскрипція; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • Сперматогенез; • DNA-templated transcription, initiation; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • snRNA transcription by RNA polymerase II; • regulation of signal transduction by p53 class mediator; • GO:0022415 viral process; • regulation of transcription by RNA polymerase III; • транскрипція РНК-полімеразою II; • transcription by RNA polymerase III; • RNA polymerase II preinitiation complex assembly; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II; • RNA polymerase III preinitiation complex assembly; • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6908
	21374
	ENSG00000112592
	ENSMUSG00000014767
	P20226
	P29037
	NM_003194; NM_001172085
	NM_013684
	NP_001165556; NP_003185
	NP_038712
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TBP (англ. TATA-box binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 339 амінокислот, а молекулярна маса — 37 698^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDQNNSLPPY	AQGLASPQGA	MTPGIPIFSP	MMPYGTGLTP	QPIQNTNSLS
ILEEQQRQQQ	QQQQQQQQQQ	QQQQQQQQQQ	QQQQQQQQQQ	QQQQQAVAAA
AVQQSTSQQA	TQGTSGQAPQ	LFHSQTLTTA	PLPGTTPLYP	SPMTPMTPIT
PATPASESSG	IVPQLQNIVS	TVNLGCKLDL	KTIALRARNA	EYNPKRFAAV
IMRIREPRTT	ALIFSSGKMV	CTGAKSEEQS	RLAARKYARV	VQKLGFPAKF
LDFKIQNMVG	SCDVKFPIRL	EGLVLTHQQF	SSYEPELFPG	LIYRMIKPRI
VLLIFVSGKV	VLTGAKVRAE	IYEAFENIYP	ILKGFRKTT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Peterson M.G., Tanese N., Pugh B.F., Tjian R. (1990). Functional domains and upstream activation properties of cloned human TATA binding protein. Science. 248: 1625—1630. PMID 2363050 doi:10.1126/science.2363050
Geisberg J.V., Lee W.S., Berk A.J., Ricciardi R.P. (1994). The zinc finger region of the adenovirus E1A transactivating domain complexes with the TATA box binding protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 2488—2492. PMID 8146144 doi:10.1073/pnas.91.7.2488
Veschambre P., Simard P., Jalinot P. (1995). Evidence for functional interaction between the HIV-1 Tat transactivator and the TATA box binding protein in vivo. J. Mol. Biol. 250: 169—180. PMID 7608968 doi:10.1006/jmbi.1995.0368
LeRoy G., Orphanides G., Lane W.S., Reinberg D. (1998). Requirement of RSF and FACT for transcription of chromatin templates in vitro. Science. 282: 1900—1904. PMID 9836642 doi:10.1126/science.282.5395.1900
Yuan C.X., Gurley W.B. (2000). Potential targets for HSF1 within the preinitiation complex. Cell Stress Chaperones. 5: 229—242. PMID 11005381 doi:10.1379/1466-1268(2000)005<0229:PTFHWT>2.0.CO;2
Friedrich J.K., Panov K.I., Cabart P., Russell J., Zomerdijk J.C.B.M. (2005). TBP-TAF complex SL1 directs RNA polymerase I pre-initiation complex formation and stabilizes upstream binding factor at the rDNA promoter. J. Biol. Chem. 280: 29551—29558. PMID 15970593 doi:10.1074/jbc.M501595200

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TBP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11588 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P20226 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з TBP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11588 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P20226 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]