Src (ген)

Src
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1A07, 1A08, 1A09, 1A1A, 1A1B, 1A1C, 1A1E, 1FMK, 1HCS, 1HCT, 1KSW, 1O41, 1O42, 1O43, 1O44, 1O45, 1O46, 1O47, 1O48, 1O49, 1O4A, 1O4B, 1O4C, 1O4D, 1O4E, 1O4F, 1O4G, 1O4H, 1O4I, 1O4J, 1O4K, 1O4L, 1O4M, 1O4N, 1O4O, 1O4P, 1O4Q, 1O4R, 1SHD, 1Y57, 1YI6, 1YOJ, 1YOL, 1YOM, 2BDF, 2H8H, 3VRO, 3ZMP, 3ZMQ, 4F59, 4F5A, 4F5B, 4HXJ, 4K11, 4MXO, 4MXX, 4MXY, 4MXZ
Ідентифікатори
Символи	SRC, ASV, SRC1, c-p60-Src, SRC proto-oncogene, non-receptor tyrosine kinase, THC6
Зовнішні ІД	OMIM: 190090 MGI: 98397 HomoloGene: 21120 GeneCards: SRC
шифр КФ	2.7.10.2
Реагує на сполуку
	бозутиніб, Дазатиніб, saracatinib, SU6656, saracatinib, PD166285
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transmembrane transporter binding; • protein domain specific binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • SH2 domain binding; • кіназна активність; • signaling receptor binding; • estrogen receptor binding; • зв'язування з АТФ; • протеїнкіназна активність; • insulin receptor binding; • non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity; • kinase binding; • heme binding; • enzyme binding; • трансферазна активність; • зв’язування з Eph-рецептором; • scaffold protein binding; • integrin binding; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • protein kinase binding; • зв'язування з молекулами клітинної адгезії; • protein kinase C binding; • hormone receptor binding; • зв'язування з нуклеотидами; • growth factor receptor binding; • phosphoprotein binding; • protein tyrosine kinase activity; • protein C-terminus binding; • зв'язування з убіквітинпротеїнлігазою; • зв'язування з кадгерином; • connexin binding; • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • мембрана; • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane; • ruffle membrane; • мітохондрія; • перинуклеарна ділянка цитоплазми; • caveola; • neuron projection; • цитоскелет; • клітинне ядро; • лізосома; • екзосома; • late endosome; • клітинна мембрана; • мікрофіламент; • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення; • мітохондріальна внутрішня мембрана; • podosome; • нуклеоплазма; • glutamatergic synapse; • postsynaptic specialization, intracellular component;
Біологічний процес	• response to mineralocorticoid; • negative regulation of telomere maintenance via telomerase; • response to interleukin-1; • positive regulation of MAP kinase activity; • позитивна регуляція канонічного сигнального шляху Wnt; • negative regulation of telomerase activity; • cellular response to progesterone stimulus; • regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway; • stress fiber assembly; • positive regulation of protein serine/threonine kinase activity; • platelet activation; • positive regulation of smooth muscle cell migration; • protein phosphorylation; • regulation of vascular permeability; • vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • regulation of podosome assembly; • клітинний цикл; • substrate adhesion-dependent cell spreading; • osteoclast development; • проліферація; • transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • cellular response to hypoxia; • cellular response to transforming growth factor beta stimulus; • negative regulation of protein homooligomerization; • positive regulation of protein kinase B signaling; • positive regulation of lamellipodium morphogenesis; • epidermal growth factor receptor signaling pathway; • branching involved in mammary gland duct morphogenesis; • Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis; • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway; • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway; • response to mechanical stimulus; • response to virus; • positive regulation of epithelial cell migration; • signal complex assembly; • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway; • positive regulation of platelet-derived growth factor receptor signaling pathway; • Оогенез; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • regulation of epithelial cell migration; • response to nutrient levels; • positive regulation of DNA biosynthetic process; • cellular response to insulin stimulus; • protein autophosphorylation; • GO:0022415 viral process; • negative regulation of focal adhesion assembly; • response to acidic pH; • response to fatty acid; • regulation of cell projection assembly; • фосфорилювання; • процес імунної системи; • negative regulation of mitochondrial depolarization; • positive regulation of integrin activation; • negative regulation of apoptotic process; • cellular response to platelet-derived growth factor stimulus; • positive regulation of podosome assembly; • positive regulation of glucose metabolic process; • Цитопемпсис; • cellular response to fluid shear stress; • response to electrical stimulus; • positive regulation of protein transport; • uterus development; • protein destabilization; • regulation of cell-cell adhesion; • peptidyl-tyrosine autophosphorylation; • integrin-mediated signaling pathway; • GO:1903106 positive regulation of insulin receptor signaling pathway; • progesterone receptor signaling pathway; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • adherens junction organization; • negative regulation of anoikis; • response to hydrogen peroxide; • leukocyte migration; • activation of protein kinase B activity; • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • regulation of early endosome to late endosome transport; • ephrin receptor signaling pathway; • T cell costimulation; • GO:0010740 positive regulation of intracellular signal transduction; • regulation of caveolin-mediated endocytosis; • regulation of cell cycle; • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity; • GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species; • cellular response to peptide hormone stimulus; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • cellular response to fatty acid; • regulation of cell population proliferation; • angiotensin-activated signaling pathway involved in heart process; • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation; • positive regulation of protein autophosphorylation; • positive regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity; • позитивна регуляція апоптозу; • розвиток переднього мозку; • regulation of protein binding; • cellular response to lipopolysaccharide; • regulation of bone resorption; • cell migration; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • positive regulation of cell adhesion; • адгезія клітин; • positive regulation of protein processing; • вроджений імунітет; • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation; • neurotrophin TRK receptor signaling pathway; • positive regulation of small GTPase mediated signal transduction; • кісткова резорбція; • central nervous system development; • positive regulation of protein localization to nucleus; • platelet-derived growth factor receptor signaling pathway; • ERBB2 signaling pathway; • intracellular estrogen receptor signaling pathway; • axon guidance; • macroautophagy; • peptidyl-tyrosine phosphorylation; • entry of bacterium into host cell; • cell-cell adhesion; • primary ovarian follicle growth; • positive regulation of ovarian follicle development; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling; • диференціація клітин; • phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process; • regulation of postsynaptic neurotransmitter receptor activity; • positive regulation of non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • cellular response to hydrogen peroxide; • positive regulation of platelet-derived growth factor receptor-beta signaling pathway; • odontogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	6714
	20779
	ENSG00000197122
	ENSMUSG00000027646
	P12931
	P05480
	NM_005417; NM_198291
	NM_001025395; NM_009271
	NP_005408; NP_938033
	NP_001020566; NP_033297
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Src (англ. SRC proto-oncogene, non-receptor tyrosine kinase) – білок, який кодується геном SRC, розташованим у людини на довгому плечі 20-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 536 амінокислот, а молекулярна маса — 59 835^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGSNKSKPKD	ASQRRRSLEP	AENVHGAGGG	AFPASQTPSK	PASADGHRGP
SAAFAPAAAE	PKLFGGFNSS	DTVTSPQRAG	PLAGGVTTFV	ALYDYESRTE
TDLSFKKGER	LQIVNNTEGD	WWLAHSLSTG	QTGYIPSNYV	APSDSIQAEE
WYFGKITRRE	SERLLLNAEN	PRGTFLVRES	ETTKGAYCLS	VSDFDNAKGL
NVKHYKIRKL	DSGGFYITSR	TQFNSLQQLV	AYYSKHADGL	CHRLTTVCPT
SKPQTQGLAK	DAWEIPRESL	RLEVKLGQGC	FGEVWMGTWN	GTTRVAIKTL
KPGTMSPEAF	LQEAQVMKKL	RHEKLVQLYA	VVSEEPIYIV	TEYMSKGSLL
DFLKGETGKY	LRLPQLVDMA	AQIASGMAYV	ERMNYVHRDL	RAANILVGEN
LVCKVADFGL	ARLIEDNEYT	ARQGAKFPIK	WTAPEAALYG	RFTIKSDVWS
FGILLTELTT	KGRVPYPGMV	NREVLDQVER	GYRMPCPPEC	PESLHDLMCQ
CWRKEPEERP	TFEYLQAFLE	DYFTSTEPQY	QPGENL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до тирозинових протеїнкіназ родини Src-протеїнкіназ.

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, клітинний цикл, альтернативний сплайсинг. Білок є ліпопротеїном, має сайт для зв'язування з АТФ. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, внутрішній мембрані мітохондрії.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Anderson S.K., Gibbs C.P., Tanaka A., Kung H.-J., Fujita D.J. (1985). Human cellular src gene: nucleotide sequence and derived amino acid sequence of the region coding for the carboxy-terminal two-thirds of pp60c-src. Mol. Cell. Biol. 5: 1122—1129. PMID 2582238 doi:10.1128/MCB.5.5.1122
Pyper J.M., Bolen J.B. (1989). Neuron-specific splicing of C-SRC RNA in human brain. J. Neurosci. Res. 24: 89—96. PMID 2681803 doi:10.1002/jnr.490240113
Parker R.C., Mardon G., Lebo R.V., Varmus H.E., Bishop J.M. (1985). Isolation of duplicated human c-src genes located on chromosomes 1 and 20. Mol. Cell. Biol. 5: 831—838. PMID 2581127 doi:10.1128/MCB.5.4.831
Cartwright C.A., Kamps M.P., Meisler A.I., Pipas J.M., Eckhart W. (1989). pp60c-src activation in human colon carcinoma. J. Clin. Invest. 83: 2025—2033. PMID 2498394 doi:10.1172/JCI114113
Pyper J.M., Bolen J.B. (1990). Identification of a novel neuronal C-SRC exon expressed in human brain. Mol. Cell. Biol. 10: 2035—2040. PMID 1691439 doi:10.1128/MCB.10.5.2035

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з SRC proto-oncogene, non-receptor tyrosine kinase переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11283 (англ.) . Архів оригіналу за 29 квітня 2018. Процитовано 26 квітня 2018. [Архівовано 2018-04-29 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P12931 (англ.) . Архів оригіналу за 29 квітня 2018. Процитовано 26 квітня 2018.

Див. також

Хромосома 20

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з SRC proto-oncogene, non-receptor tyrosine kinase переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11283 (англ.) . Архів оригіналу за 29 квітня 2018. Процитовано 26 квітня 2018. [Архівовано 2018-04-29 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, P12931 (англ.) . Архів оригіналу за 29 квітня 2018. Процитовано 26 квітня 2018.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]