SS18

SS18
Ідентифікатори
Символи	SS18, SSXT, SYT, nBAF chromatin remodeling complex subunit, SS18 subunit of BAF chromatin remodeling complex, SMARCL1
Зовнішні ІД	OMIM: 600192 MGI: 107708 HomoloGene: 38080 GeneCards: SS18
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • nuclear receptor coactivator activity; • GO:0001105 transcription coactivator activity;
Клітинна компонента	• cytoplasmic microtubule; • npBAF complex; • клітинне ядро; • SWI/SNF complex;
Біологічний процес	• ephrin receptor signaling pathway; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • cytoskeleton organization; • microtubule cytoskeleton organization; • GO:0000767 cell morphogenesis; • ДНК-матрична транскрипція; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • neuronal stem cell population maintenance; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • regulation of nucleic acid-templated transcription; • positive regulation of nucleic acid-templated transcription;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	6760
	268996
	ENSG00000141380
	ENSMUSG00000037013
	Q15532; Q4VAX0
	Q62280
	NM_001007559; NM_001308201; NM_005637
	NM_001161369; NM_001161370; NM_001161371; NM_009280
	NP_001007560; NP_001295130; NP_005628; NP_005628.2
	NP_001154841; NP_001154842; NP_001154843; NP_033306
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SS18 (англ. SS18, nBAF chromatin remodeling complex subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 418 амінокислот, а молекулярна маса — 45 929^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSVAFAAPRQ	RGKGEITPAA	IQKMLDDNNH	LIQCIMDSQN	KGKTSECSQY
QQMLHTNLVY	LATIADSNQN	MQSLLPAPPT	QNMPMGPGGM	NQSGPPPPPR
SHNMPSDGMV	GGGPPAPHMQ	NQMNGQMPGP	NHMPMQGPGP	NQLNMTNSSM
NMPSSSHGSM	GGYNHSVPSS	QSMPVQNQMT	MSQGQPMGNY	GPRPNMSMQP
NQGPMMHQQP	PSQQYNMPQG	GGQHYQGQQP	PMGMMGQVNQ	GNHMMGQRQI
PPYRPPQQGP	PQQYSGQEDY	YGDQYSHGGQ	GPPEGMNQQY	YPDGHNDYGY
QQPSYPEQGY	DRPYEDSSQH	YYEGGNSQYG	QQQDAYQGPP	PQQGYPPQQQ
QYPGQQGYPG	QQQGYGPSQG	GPGPQYPNYP	QGQGQQYGGY	RPTQPGPPQP
PQQRPYGYDQ	GQYGNYQQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Iwasaki T., Koibuchi N., Chin W.W. (2005). Synovial sarcoma translocation (SYT) encodes a nuclear receptor coactivator. Endocrinology. 146: 3892—3899. PMID 15919756 doi:10.1210/en.2004-1513

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11340 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q15532 (англ.) . Архів оригіналу за 7 грудня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 18

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11340 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q15532 (англ.) . Архів оригіналу за 7 грудня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]