SRI

SRI
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1JUO, 2JC2, 4U8D, 4UPG, 4USL
Ідентифікатори
Символи	SRI, CP-22, CP22, SCN, V19, sorcin
Зовнішні ІД	OMIM: 182520 MGI: 98419 HomoloGene: 37736 GeneCards: SRI
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном кальцію; • transmembrane transporter binding; • calcium channel regulator activity; • зв’язування з іоном металу; • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity; • зв'язування з протеазами; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • активність гетеродимеризації білків; • identical protein binding; • signaling receptor binding;
Клітинна компонента	• axon terminus; • dendritic spine neck; • везикула; • гіалоплазма; • мембрана ендоплазматичного ретикулуму; • мембрана; • T-tubule; • клітинна мембрана; • внутрішньоклітинний; • sarcoplasmic reticulum; • нуклеоплазма; • smooth endoplasmic reticulum; • аксон; • chromaffin granule membrane; • Z discdkac; • мітохондрія; • sarcoplasmic reticulum membrane; • екзосома; • цитоплазма;
Біологічний процес	• regulation of calcium ion transport; • regulation of heart contraction; • cytoplasmic sequestering of transcription factor; • muscle organ development; • positive regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol; • negative regulation of heart rate; • протеоліз; • negative regulation of ryanodine-sensitive calcium-release channel activity; • regulation of cardiac muscle cell contraction; • development of the heart; • intracellular sequestering of iron ion; • regulation of striated muscle contraction; • negative regulation of transcription regulatory region DNA binding; • regulation of high voltage-gated calcium channel activity; • потенціал дії; • positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus; • regulation of cell communication by electrical coupling; • regulation of cell communication by electrical coupling involved in cardiac conduction; • regulation of relaxation of muscle; • regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol by sarcoplasmic reticulum; • calcium ion transport; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • negative regulation of cardiac muscle contraction; • GO:0015915 транспорт;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	6717
	109552
	ENSG00000075142
	ENSMUSG00000003161
	P30626
	Q6P069
	NM_001256891; NM_001256892; NM_003130; NM_198901
	NM_001080974; NM_025618
	NP_001243820; NP_001243821; NP_003121; NP_944490
	NP_001074443; NP_079894
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SRI (англ. Sorcin) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 198 амінокислот, а молекулярна маса — 21 676^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAYPGHPGAG	GGYYPGGYGG	APGGPAFPGQ	TQDPLYGYFA	AVAGQDGQID
ADELQRCLTQ	SGIAGGYKPF	NLETCRLMVS	MLDRDMSGTM	GFNEFKELWA
VLNGWRQHFI	SFDTDRSGTV	DPQELQKALT	TMGFRLSPQA	VNSIAKRYST
NGKITFDDYI	ACCVKLRALT	DSFRRRDTAQ	QGVVNFPYDD	FIQCVMSV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, саркоплазматичному ретикулумі.

Література

Wang S.L., Tam M.F., Ho Y.S., Pai S.H., Kao M.C. (1995). Isolation and molecular cloning of human sorcin a calcium-binding protein in vincristine-resistant HOB1 lymphoma cells. Biochim. Biophys. Acta. 1260: 285—293. PMID 7873602 doi:10.1016/0167-4781(94)00206-I
Lee W.P. (1996). Purification, cDNA cloning, and expression of human sorcin in vincristine-resistant HOB1 lymphoma cell lines. Arch. Biochem. Biophys. 325: 217—226. PMID 8561500 doi:10.1006/abbi.1996.0027
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Hansen C., Tarabykina S., la Cour J.M., Lollike K., Berchtold M.W. (2003). The PEF family proteins sorcin and grancalcin interact in vivo and in vitro. FEBS Lett. 545: 151—154. PMID 12804766 doi:10.1016/S0014-5793(03)00518-0
Xie X., Dwyer M.D., Swenson L., Parker M.H., Botfield M.C. (2001). Crystal structure of calcium-free human sorcin: a member of the penta-EF-hand protein family. Protein Sci. 10: 2419—2425. PMID 11714909 doi:10.1110/ps.36701

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11292 (англ.) . Архів оригіналу за 7 грудня 2017. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2017-12-07 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P30626 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11292 (англ.) . Архів оригіналу за 7 грудня 2017. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2017-12-07 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P30626 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]