SPON1

SPON1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2ZOT, 2ZOU, 3COO, 3Q13
Ідентифікатори
Символи	SPON1, VSGP/F-spondin, f-spondin, Spondin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604989 MGI: 2385287 HomoloGene: 4453 GeneCards: SPON1
Пов'язані генетичні захворювання
	туберкульоз
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • зв’язування з іоном металу; • структурний компонент позаклітинного матриксу; • LBD domain binding;
Клітинна компонента	• GO:0005578 позаклітинний матрикс; • extracellular region; • порожнина ендоплазматичного ретикулуму; • міжклітинний простір; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• адгезія клітин; • protein O-linked fucosylation; • positive regulation of protein processing; • positive regulation of protein binding; • negative regulation of amyloid-beta formation; • positive regulation of amyloid precursor protein catabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	10418
	233744
	ENSG00000262655
	ENSMUSG00000038156
	Q9HCB6
	Q8VCC9
	NM_006108
	NM_145584
	NP_006099
	NP_663559
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SPON1 (англ. Spondin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 807 амінокислот, а молекулярна маса — 90 973^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRLSPAPLKL	SRTPALLALA	LPLAAALAFS	DETLDKVPKS	EGYCSRILRA
QGTRREGYTE	FSLRVEGDPD	FYKPGTSYRV	TLSAAPPSYF	RGFTLIALRE
NREGDKEEDH	AGTFQIIDEE	ETQFMSNCPV	AVTESTPRRR	TRIQVFWIAP
PAGTGCVILK	ASIVQKRIIY	FQDEGSLTKK	LCEQDSTFDG	VTDKPILDCC
ACGTAKYRLT	FYGNWSEKTH	PKDYPRRANH	WSAIIGGSHS	KNYVLWEYGG
YASEGVKQVA	ELGSPVKMEE	EIRQQSDEVL	TVIKAKAQWP	AWQPLNVRAA
PSAEFSVDRT	RHLMSFLTMM	GPSPDWNVGL	SAEDLCTKEC	GWVQKVVQDL
IPWDAGTDSG	VTYESPNKPT	IPQEKIRPLT	SLDHPQSPFY	DPEGGSITQV
ARVVIERIAR	KGEQCNIVPD	NVDDIVADLA	PEEKDEDDTP	ETCIYSNWSP
WSACSSSTCD	KGKRMRQRML	KAQLDLSVPC	PDTQDFQPCM	GPGCSDEDGS
TCTMSEWITW	SPCSISCGMG	MRSRERYVKQ	FPEDGSVCTL	PTEETEKCTV
NEECSPSSCL	MTEWGEWDEC	SATCGMGMKK	RHRMIKMNPA	DGSMCKAETS
QAEKCMMPEC	HTIPCLLSPW	SEWSDCSVTC	GKGMRTRQRM	LKSLAELGDC
NEDLEQVEKC	MLPECPIDCE	LTEWSQWSEC	NKSCGKGHVI	RTRMIQMEPQ
FGGAPCPETV	QRKKCRIRKC	LRNPSIQKLR	WREARESRRS	EQLKEESEGE
QFPGCRMRPW	TAWSECTKLC	GGGIQERYMT	VKKRFKSSQF	TSCKDKKEIR
ACNVHPC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Tan K., Duquette M., Liu J.H., Lawler J., Wang J.H. (2008). The crystal structure of the heparin-binding reelin-N domain of f-spondin. J. Mol. Biol. 381: 1213—1223. PMID 18602404 doi:10.1016/j.jmb.2008.06.045
Tan K., Lawler J. (2011). The structure of the Ca+-binding, glycosylated F-spondin domain of F-spondin - A C2-domain variant in an extracellular matrix protein. BMC Struct. Biol. 11: 22—22. PMID 21569239 doi:10.1186/1472-6807-11-22