S100B

S100B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1MQ1, 1UWO, 2H61, 2M49, 2PRU, 3CZT, 3D0Y, 3D10, 3HCM, 4XYN, 5CSJ, 5CSF, 5CSN, 5CSI
Ідентифікатори
Символи	S100B, NEF, S100, S100-B, S100beta, S100 calcium binding protein B
Зовнішні ІД	OMIM: 176990 MGI: 98217 HomoloGene: 4567 GeneCards: S100B
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном кальцію; • S100 protein binding; • гомодимеризація білків; • зв'язування з іонами цинку; • зв’язування з іоном металу; • calcium-dependent protein binding; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • identical protein binding; • tau protein binding; • signaling receptor binding; • RAGE receptor binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ruffle; • extracellular region; • сома; • перинуклеарна ділянка цитоплазми; • клітинне ядро; • міжклітинний простір;
Біологічний процес	• аксоноґенеза; • response to glucocorticoid; • пам'ять; • negative regulation of skeletal muscle cell differentiation; • central nervous system development; • astrocyte differentiation; • positive regulation of synaptic transmission; • positive regulation of cell population proliferation; • regulation of cell shape; • позитивна регуляція апоптозу; • learning or memory; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • regulation of neuronal synaptic plasticity; • response to methylmercury; • проліферація; • вроджений імунітет; • cellular response to hypoxia; • довготривала потенціація; • positive regulation of myelination;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6285
	20203
	ENSG00000160307
	ENSMUSG00000033208
	P04271
	P50114
	NM_006272
	NM_009115
	NP_006263
	NP_033141
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

S100B (англ. S100 calcium binding protein B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 92 амінокислот, а молекулярна маса — 10 713^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSELEKAMVA	LIDVFHQYSG	REGDKHKLKK	SELKELINNE	LSHFLEEIKE
QEVVDKVMET	LDNDGDGECD	FQEFMAFVAM	VTTACHEFFE	HE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Jensen R., Marshak D.R., Anderson C., Lukas T.J., Watterson D.M. (1985). Characterization of human brain S100 protein fraction: amino acid sequence of S100 beta. J. Neurochem. 45: 700—705. PMID 4031854 doi:10.1111/j.1471-4159.1985.tb04048.x
Baudier J., Glasser N., Haglid K., Gerard D. (1984). Purification, characterization and ion binding properties of human brain S100b protein. Biochim. Biophys. Acta. 790: 164—173. PMID 6487634 doi:10.1016/0167-4838(84)90220-6
Yang Q., O'Hanlon D., Heizmann C.W., Marks A. (1999). Demonstration of heterodimer formation between S100B and S100A6 in the yeast two-hybrid system and human melanoma. Exp. Cell Res. 246: 501—509. PMID 9925766 doi:10.1006/excr.1998.4314
Park H., Adsit F.G., Boyington J.C. (2010). The 1.5 A crystal structure of human receptor for advanced glycation endproducts (RAGE) ectodomains reveals unique features determining ligand binding. J. Biol. Chem. 285: 40762—40770. PMID 20943659 doi:10.1074/jbc.M110.169276
Smith S.P., Shaw G.S. (1998). A novel calcium-sensitive switch revealed by the structure of human S100B in the calcium-bound form. Structure. 6: 211—222. PMID 9519411 doi:10.1016/S0969-2126(98)00022-7

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10500 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P04271 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 21

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10500 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P04271 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]