S100A9

S100A9
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1IRJ, 1XK4, 4GGF, 4XJK
Ідентифікатори
Символи	S100A9, 60B8AG, CAGB, CFAG, CGLB, L1AG, LIAG, MAC387, MIF, MRP14, NIF, P14, S100 calcium binding protein A9, S100-A9
Зовнішні ІД	OMIM: 123886 MGI: 1338947 HomoloGene: 2227 GeneCards: S100A9
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном кальцію; • microtubule binding; • зв'язування з іонами цинку; • сигнальна трансдукторна активність; • зв’язування з іоном металу; • Toll-like receptor 4 binding; • antioxidant activity; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • RAGE receptor binding; • arachidonic acid binding;
Клітинна компонента	• мембрана; • клітинна мембрана; • екзосома; • цитоскелет; • клітинне ядро; • GO:0005578 позаклітинний матрикс; • міжклітинний простір; • нуклеоплазма; • гіалоплазма; • міжклітинні контакти; • secretory granule lumen; • цитоплазма; • extracellular region; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• peptidyl-cysteine S-trans-nitrosylation; • positive regulation of inflammatory response; • chemokine production; • процес імунної системи; • cellular oxidant detoxification; • cell-cell signaling; • GO:0032617 творба цитокінів; • leukocyte migration involved in inflammatory response; • neutrophil chemotaxis; • defense response to fungus; • хемотаксис; • sequestering of zinc ion; • neutrophil aggregation; • positive regulation of cell growth; • defense response to bacterium; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • regulation of inflammatory response; • вроджений імунітет; • inflammatory response; • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway; • regulation of cytoskeleton organization; • GO:0097285 апоптоз; • автофагія; • toll-like receptor signaling pathway; • antimicrobial humoral response; • дегрануляція нейтрофілів; • positive regulation of neuron projection development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6280
	20202
	ENSG00000163220
	ENSMUSG00000056071
	P06702
	P31725
	NM_002965
	NM_001281852; NM_009114
	NP_002956
	NP_001268781; NP_033140
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

S100A9 (англ. S100 calcium binding protein A9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 114 амінокислот, а молекулярна маса — 13 242^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTCKMSQLER	NIETIINTFH	QYSVKLGHPD	TLNQGEFKEL	VRKDLQNFLK
KENKNEKVIE	HIMEDLDTNA	DKQLSFEEFI	MLMARLTWAS	HEKMHEGDEG
PGHHHKPGLG	EGTP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антиоксидантів, антимікробних білків. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, хемотаксис, автофагія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Lagasse E., Clerc R.G. (1988). Cloning and expression of two human genes encoding calcium-binding proteins that are regulated during myeloid differentiation. Mol. Cell. Biol. 8: 2402—2410. PMID 3405210 doi:10.1128/MCB.8.6.2402
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Edgeworth J., Freemont P., Hogg N. (1989). Ionomycin-regulated phosphorylation of the myeloid calcium-binding protein p14. Nature. 342: 189—192. PMID 2478889 doi:10.1038/342189a0
Tobe T., Murakami K., Tomita M., Nozawa R. (1989). Amino acid sequences of 60B8 antigens induced in HL-60 cells by 1,25-dihydroxyvitamin D3. The antigens are identical with macrophage-related protein-14 and -8. Chem. Pharm. Bull. 37: 1576—1580. PMID 2776242 doi:10.1248/cpb.37.1576
Miyasaki K.T., Bodeau A.L., Murthy A.R., Lehrer R.I. (1993). In vitro antimicrobial activity of the human neutrophil cytosolic S-100 protein complex, calprotectin, against Capnocytophaga sputigena. J. Dent. Res. 72: 517—523. PMID 8423249 doi:10.1177/00220345930720020801
Ryckman C., Vandal K., Rouleau P., Talbot M., Tessier P.A. (2003). Proinflammatory activities of S100: proteins S100A8, S100A9, and S100A8/A9 induce neutrophil chemotaxis and adhesion. J. Immunol. 170: 3233—3242. PMID 12626582 doi:10.4049/jimmunol.170.6.3233

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10499 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P06702 (англ.) . Архів оригіналу за 23 грудня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10499 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P06702 (англ.) . Архів оригіналу за 23 грудня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]