RARG

RARG
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: H3BMH6 PDBe H3BMH6 RCSB
Список кодів PDB
	1EXA, 1EXX, 1FCX, 1FCY, 1FCZ, 1FD0, 2LBD, 3LBD, 4LBD
Ідентифікатори
Символи	RARG, NR1B3, RARC, retinoic acid receptor gamma, RARgamma
Зовнішні ІД	OMIM: 180190 MGI: 97858 HomoloGene: 20263 GeneCards: RARG
Реагує на сполуку
	Адапален, alitretinoin, palovarotene, tamibarotene, tazarotene, третиноїн
Онтологія гена
Молекулярна функція	• специфічне до послідовності зв'язування з ДНК; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • зв'язування з іонами цинку; • зв’язування з іоном металу; • steroid hormone receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • зв'язування з ДНК; • retinoid X receptor binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • зв'язування з фактором транскрипції; • nuclear receptor coactivator activity; • сигнальна рецепторна активність; • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity;
Клітинна компонента	• інтегральний компонент мембрани; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • регуляторний транскрипційний комплекс; • RNA polymerase II transcription regulator complex;
Біологічний процес	• regulation of cell size; • growth plate cartilage development; • клітинна відповідь на ретиноєву кислоту; • gland development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of cartilage development; • response to retinoic acid; • multicellular organism growth; • negative regulation of cell differentiation; • bone morphogenesis; • chondrocyte development; • negative regulation of apoptotic process; • retinal pigment epithelium development; • ДНК-матрична транскрипція; • epithelium development; • embryonic camera-type eye development; • reproductive structure development; • розвиток кінцівок; • face development; • neural tube closure; • negative regulation of chondrocyte differentiation; • Harderian gland development; • prostate gland epithelium morphogenesis; • regulation of myelination; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • retina development in camera-type eye; • positive regulation of cell population proliferation; • growth plate cartilage chondrocyte growth; • canonical Wnt signaling pathway; • регуляція експресії генів; • camera-type eye development; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • regulation of myeloid cell differentiation; • bone development; • trachea cartilage development; • anterior/posterior pattern specification; • glandular epithelial cell development; • steroid hormone mediated signaling pathway; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • embryonic hindlimb morphogenesis; • retinoic acid receptor signaling pathway; • негативна регуляція проліферації клітин; • embryonic eye morphogenesis; • позитивна регуляція апоптозу; • positive regulation of programmed cell death; • cellular response to leukemia inhibitory factor; • розвиток багатоклітинного організму; • hormone-mediated signaling pathway; • диференціація клітин; • response to lipid;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5916
	19411
	ENSG00000172819
	ENSMUSG00000001288
	P13631
	P18911
	NM_000966; NM_001042728; NM_001243730; NM_001243731; NM_001243732
	NM_001042727; NM_011244
	NP_000957; NP_001036193; NP_001230659; NP_001230660; NP_001230661
	NP_001036192; NP_035374
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RARG (англ. Retinoic acid receptor gamma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 454 амінокислот, а молекулярна маса — 50 342^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATNKERLFA	AGALGPGSGY	PGAGFPFAFP	GALRGSPPFE	MLSPSFRGLG
QPDLPKEMAS	LSVETQSTSS	EEMVPSSPSP	PPPPRVYKPC	FVCNDKSSGY
HYGVSSCEGC	KGFFRRSIQK	NMVYTCHRDK	NCIINKVTRN	RCQYCRLQKC
FEVGMSKEAV	RNDRNKKKKE	VKEEGSPDSY	ELSPQLEELI	TKVSKAHQET
FPSLCQLGKY	TTNSSADHRV	QLDLGLWDKF	SELATKCIIK	IVEFAKRLPG
FTGLSIADQI	TLLKAACLDI	LMLRICTRYT	PEQDTMTFSD	GLTLNRTQMH
NAGFGPLTDL	VFAFAGQLLP	LEMDDTETGL	LSAICLICGD	RMDLEEPEKV
DKLQEPLLEA	LRLYARRRRP	SQPYMFPRML	MKITDLRGIS	TKGAERAITL
KMEIPGPMPP	LIREMLENPE	MFEDDSSQPG	PHPNASSEDE	VPGGQGKGGL
KSPA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Krust A., Kastner P., Petkovich M., Zelent A., Chambon P. (1989). A third human retinoic acid receptor, hRAR-gamma. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 5310—5314. PMID 2546152 doi:10.1073/pnas.86.14.5310
Lehmann J.M., Hoffmann B., Pfahl M. (1991). Genomic organization of the retinoic acid receptor gamma gene. Nucleic Acids Res. 19: 573—578. PMID 1849262 doi:10.1093/nar/19.3.573
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Lehmann J.M., Zhang X.K., Pfahl M. (1992). RAR-gamma-2 expression is regulated through a retinoic acid response element embedded in Sp1 sites. Mol. Cell. Biol. 12: 2976—2985. PMID 1320193 doi:10.1128/MCB.12.7.2976