RAD51

RAD51
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1N0W, 1B22
Ідентифікатори
Символи	RAD51, BRCC5, FANCR, HHsRad51, HsT16930, MRMV2, RAD51A, RECA, RAD51 recombinase
Зовнішні ІД	OMIM: 179617 MGI: 97890 HomoloGene: 2155 GeneCards: RAD51
Пов'язані генетичні захворювання
	Fanconi anemia complementation group R
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з нуклеотидами; • зв'язування з ДНК; • ATP-dependent activity, acting on DNA; • DNA strand exchange activity; • DNA polymerase binding; • protein C-terminus binding; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • four-way junction DNA binding; • identical protein binding; • endodeoxyribonuclease activity; • зв'язування з АТФ; • single-stranded DNA binding; • зв’язування дволанцюгових ДНК; • GO:0043142 single-stranded DNA helicase activity; • chromatin binding; • enzyme binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • site of double-strand break; • PML body; • цитоскелет; • нуклеоплазма; • центр організації мікротрубочок; • nuclear chromosome; • мітохондріальний матрикс; • ядерце; • мітохондрія; • перинуклеарна ділянка цитоплазми; • хроматин; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • GO:0009327 protein-containing complex; • condensed chromosome; • condensed nuclear chromosome; • lateral element; • хромосома;
Біологічний процес	• strand invasion; • GO:1903211 mitotic recombination-dependent replication fork processing; • reciprocal meiotic recombination; • DNA recombination; • regulation of double-strand break repair via homologous recombination; • DNA metabolic process; • positive regulation of DNA ligation; • cellular response to camptothecin; • double-strand break repair via homologous recombination; • клітинна відповідь на іонізуюче випромінювання; • mitotic recombination; • protein homooligomerization; • GO:0100026 Репарація ДНК; • DNA unwinding involved in DNA replication; • cellular response to DNA damage stimulus; • interstrand cross-link repair; • DNA recombinase assembly; • negative regulation of G0 to G1 transition; • telomere maintenance via recombination; • telomere maintenance via telomere lengthening; • replication fork processing; • GO:0007126 мейоз; • GO:0051178 chromosome organization involved in meiotic cell cycle;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5888
	19361
	ENSG00000051180
	н/д
	Q06609
	Q08297
	NM_001164269; NM_001164270; NM_002875; NM_133487
	NM_011234
	NP_001157741; NP_001157742; NP_002866; NP_597994
	NP_035364
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RAD51 (англ. RAD51 recombinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 339 амінокислот, а молекулярна маса — 36 966^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAMQMQLEAN	ADTSVEEESF	GPQPISRLEQ	CGINANDVKK	LEEAGFHTVE
AVAYAPKKEL	INIKGISEAK	ADKILAEAAK	LVPMGFTTAT	EFHQRRSEII
QITTGSKELD	KLLQGGIETG	SITEMFGEFR	TGKTQICHTL	AVTCQLPIDR
GGGEGKAMYI	DTEGTFRPER	LLAVAERYGL	SGSDVLDNVA	YARAFNTDHQ
TQLLYQASAM	MVESRYALLI	VDSATALYRT	DYSGRGELSA	RQMHLARFLR
MLLRLADEFG	VAVVITNQVV	AQVDGAAMFA	ADPKKPIGGN	IIAHASTTRL
YLRKGRGETR	ICKIYDSPCL	PEAEAMFAIN	ADGVGDAKD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Є прогностичним маркером в онкології для оцінки перебігу уротеліальної карциноми сечового міхура, гепатоцелюлярної карциноми, раку нирки, аденокарциноми легень і підшлункової залози.^[6] Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мітохондрії.

Література

Yoshimura Y., Morita T., Yamamoto A., Matsushiro A. (1993). Cloning and sequence of the human RecA-like gene cDNA. Nucleic Acids Res. 21: 1665—1665. PMID 8479919 doi:10.1093/nar/21.7.1665
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Golub E.I., Kovalenko O.V., Gupta R.C., Ward D.C., Radding C.M. (1997). Interaction of human recombination proteins Rad51 and Rad54. Nucleic Acids Res. 25: 4106—4110. PMID 9321665 doi:10.1093/nar/25.20.4106
Kovalenko O.V., Golub E.I., Bray-Ward P., Ward D.C., Radding C.M. (1997). A novel nucleic acid-binding protein that interacts with human rad51 recombinase. Nucleic Acids Res. 25: 4946—4953. PMID 9396801 doi:10.1093/nar/25.24.4946
Tanaka K., Hiramoto T., Fukuda T., Miyagawa K. (2000). A novel human Rad54 homologue, Rad54B, associates with Rad51. J. Biol. Chem. 275: 26316—26321. PMID 10851248 doi:10.1074/jbc.M910306199
Sigurdsson S., Van Komen S., Petukhova G., Sung P. (2002). Homologous DNA pairing by human recombination factors Rad51 and Rad54. J. Biol. Chem. 277: 42790—42794. PMID 12205100 doi:10.1074/jbc.M208004200

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з RAD51 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9817 (англ.) . Архів оригіналу за 31 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-07-31 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q06609 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ Expression of RAD51 in cancer - The Human Protein Atlas. www.proteinatlas.org.

Див. також

Хромосома 15

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з RAD51 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9817 (англ.) . Архів оригіналу за 31 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-07-31 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, Q06609 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[6] Expression of RAD51 in cancer - The Human Protein Atlas. www.proteinatlas.org.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]