Pdx1

Pdx1
Ідентифікатори
Символи	PDX1, GSF, IDX-1, IPF1, IUF1, MODY4, PAGEN1, PDX-1, STF-1, pancreatic and duodenal homeobox 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600733 MGI: 102851 HomoloGene: 175 GeneCards: PDX1
Пов'язані генетичні захворювання
	partial pancreatic agenesis, maturity-onset diabetes of the young type 9
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з ДНК; • специфічне до послідовності зв'язування з ДНК; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • chromatin binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • зв'язування з фактором транскрипції; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • активність гетеродимеризації білків; • promoter-specific chromatin binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • nuclear speck; • внутрішньоклітинний; • клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• exocrine pancreas development; • negative regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway; • диференціація клітин; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • glucose homeostasis; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II; • insulin secretion; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • generation of precursor metabolites and energy; • ДНК-матрична транскрипція; • розвиток багатоклітинного організму; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • regulation of cell population proliferation; • positive regulation of cell population proliferation; • nitric oxide mediated signal transduction; • glucose metabolic process; • animal organ morphogenesis; • pancreas development; • liver development; • positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus; • morphogenesis of embryonic epithelium; • digestive tract development; • negative regulation of type B pancreatic cell apoptotic process; • негативна регуляція проліферації клітин; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • endocrine pancreas development; • type B pancreatic cell differentiation; • транскрипція РНК-полімеразою II; • detection of glucose; • smoothened signaling pathway; • central nervous system development; • response to wounding; • response to glucose; • response to iron(II) ion; • response to chlorate; • регуляція експресії генів; • positive regulation of cell death; • GO:1904578 response to organic cyclic compound; • animal organ regeneration; • response to nutrient levels; • positive regulation of insulin secretion; • response to vitamin; • response to lipid; • response to cytokine; • response to nicotine; • response to leucine; • response to alkaloid; • positive regulation of DNA binding; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • stem cell differentiation; • response to glucocorticoid; • transdifferentiation; • response to fatty acid;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3651
	18609
	ENSG00000139515
	ENSMUSG00000029644
	P52945
	P52946
	NM_000209
	NM_008814
	NP_000200
	NP_032840
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Pdx1 (англ. Pancreatic and duodenal homeobox 1) – білок, який кодується геном PDX1, розташованим у людей на довгому плечі 13-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 283 амінокислот, а молекулярна маса — 30 771^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNGEEQYYAA	TQLYKDPCAF	QRGPAPEFSA	SPPACLYMGR	QPPPPPPHPF
PGALGALEQG	SPPDISPYEV	PPLADDPAVA	HLHHHLPAQL	ALPHPPAGPF
PEGAEPGVLE	EPNRVQLPFP	WMKSTKAHAW	KGQWAGGAYA	AEPEENKRTR
TAYTRAQLLE	LEKEFLFNKY	ISRPRRVELA	VMLNLTERHI	KIWFQNRRMK
WKKEEDKKRG	GGTAVGGGGV	AEPEQDCAVT	SGEELLALPP	PPPPGGAVPP
AAPVAAREGR	LPPGLSASPQ	PSSVAPRRPQ	EPR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Транскрипційний фактор залучений до розвитку підшлункової залози та дозрівання β-клітин. Відповідний ген, що його кодує, носить назву Pdx1 (у гризунів) або Ipf1 (в людини).

Література

Stoffers D.A., Zinkin N.T., Stanojevic V., Clarke W.L., Habener J.F. (1997). Pancreatic agenesis attributable to a single nucleotide deletion in the human IPF1 gene coding sequence. Nat. Genet. 15: 106—110. PMID 8988180 doi:10.1038/ng0197-106
Francis J., Chakrabarti S.K., Garmey J.C., Mirmira R.G. (2005). Pdx-1 links histone H3-Lys-4 methylation to RNA polymerase II elongation during activation of insulin transcription. J. Biol. Chem. 280: 36244—36253. PMID 16141209 doi:10.1074/jbc.M505741200