PSEN2

PSEN2
Ідентифікатори
Символи	PSEN2, AD3L, AD4, CMD1V, PS2, STM2, presenilin 2
Зовнішні ІД	OMIM: 600759 MGI: 109284 HomoloGene: 386 GeneCards: PSEN2
Пов'язані генетичні захворювання
	dilated cardiomyopathy 1V
Онтологія гена
Молекулярна функція	• endopeptidase activity; • GO:0070122 peptidase activity; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • гідролазна активність; • aspartic endopeptidase activity, intramembrane cleaving; • aspartic-type endopeptidase activity;
Клітинна компонента	• інтегральний компонент мембрани; • центросома; • комплекс Ґольджі; • мембрана ендоплазматичного ретикулуму; • мембрана; • Golgi membrane; • клітинна мембрана; • інтегральний компонент плазматичної мембрани; • сома; • nuclear inner membrane; • Z discdkac; • ендоплазматичний ретикулум; • перинуклеарна ділянка цитоплазми; • кінетохор; • мітохондріальна внутрішня мембрана; • lysosomal membrane; • cell cortex; • поверхня клітини; • аксон; • growth cone; • neuromuscular junction; • ciliary rootlet; • dendritic shaft; • membrane raft; • клітинне ядро; • рання ендосома; • Синаптичні бульбашки; • apical plasma membrane; • GO:0009327 protein-containing complex; • synaptic membrane; • інтегральний компонент пресинаптичної мембрани; • внутрішньоклітинний;
Біологічний процес	• Сигнальний шлях Notch; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • response to hypoxia; • ephrin receptor signaling pathway; • protein processing; • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity; • negative regulation of apoptotic process; • amyloid-beta metabolic process; • протеоліз; • membrane protein ectodomain proteolysis; • membrane protein intracellular domain proteolysis; • позитивна регуляція апоптозу; • Notch receptor processing; • calcium ion transport; • amyloid precursor protein catabolic process; • Notch receptor processing, ligand-dependent; • regulation of calcium import into the mitochondrion; • mitochondrion-endoplasmic reticulum membrane tethering;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5664
	19165
	ENSG00000143801
	ENSMUSG00000010609
	P49810
	Q61144
	NM_000447; NM_012486
	NM_001128605; NM_011183
	NP_000438; NP_036618
	NP_001122077; NP_035313
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PSEN2 (англ. Presenilin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 448 амінокислот, а молекулярна маса — 50 140^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLTFMASDSE	EEVCDERTSL	MSAESPTPRS	CQEGRQGPED	GENTAQWRSQ
ENEEDGEEDP	DRYVCSGVPG	RPPGLEEELT	LKYGAKHVIM	LFVPVTLCMI
VVVATIKSVR	FYTEKNGQLI	YTPFTEDTPS	VGQRLLNSVL	NTLIMISVIV
VMTIFLVVLY	KYRCYKFIHG	WLIMSSLMLL	FLFTYIYLGE	VLKTYNVAMD
YPTLLLTVWN	FGAVGMVCIH	WKGPLVLQQA	YLIMISALMA	LVFIKYLPEW
SAWVILGAIS	VYDLVAVLCP	KGPLRMLVET	AQERNEPIFP	ALIYSSAMVW
TVGMAKLDPS	SQGALQLPYD	PEMEEDSYDS	FGEPSYPEVF	EPPLTGYPGE
ELEEEEERGV	KLGLGDFIFY	SVLVGKAAAT	GSGDWNTTLA	CFVAILIGLC
LTLLLLAVFK	KALPALPISI	TFGLIFYFST	DNLVRPFMDT	LASHQLYI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, фосфопротеїнів. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

Li J., Ma J., Potter H. (1995). Identification and expression analysis of a potential familial Alzheimer disease gene on chromosome 1 related to AD3. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 12180—12184. PMID 8618867 doi:10.1073/pnas.92.26.12180
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Kimberly W.T., Xia W., Rahmati T., Wolfe M.S., Selkoe D.J. (2000). The transmembrane aspartates in presenilin 1 and 2 are obligatory for gamma-secretase activity and amyloid beta-protein generation. J. Biol. Chem. 275: 3173—3178. PMID 10652302 doi:10.1074/jbc.275.5.3173
Cruts M., van Broeckhoven C. (1998). Presenilin mutations in Alzheimer's disease. Hum. Mutat. 11: 183—190. PMID 9521418 doi:10.1002/(SICI)1098-1004(1998)11:3<183::AID-HUMU1>3.0.CO;2-J
Lao J.I., Beyer K., Fernandez-Novoa L., Cacabelos R. (1998). A novel mutation in the predicted TM2 domain of the presenilin 2 gene in Spanish patient with late-onset Alzheimer's disease. Neurogenetics. 1: 293—296. PMID 10732806 doi:10.1007/s100480050044
Zhang W., Han S.W., McKeel D.W., Goate A., Wu J.Y. (1998). Interaction of presenilins with the filamin family of actin-binding proteins. J. Neurosci. 18: 914—922. PMID 9437013

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PSEN2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9509 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P49810 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з PSEN2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9509 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P49810 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]