PRIM1

PRIM1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4BPU, 4BPW, 4BPX, 4LIK, 4LIL, 4MHQ, 4RR2, 5EXR
Ідентифікатори
Символи	PRIM1, p49, primase (DNA) subunit 1, DNA primase subunit 1
Зовнішні ІД	OMIM: 176635 MGI: 97757 HomoloGene: 730 GeneCards: PRIM1
шифр КФ	2.7.7.102
Реагує на сполуку
	Viroporin 3a
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity; • трансферазна активність; • nucleotidyltransferase activity; • зв’язування з іоном металу; • single-stranded DNA binding; • DNA primase activity;
Клітинна компонента	• мембрана; • нуклеоплазма; • alpha DNA polymerase:primase complex; • primosome complex;
Біологічний процес	• реплікація ДНК; • G1 phase; • DNA replication initiation; • DNA replication, synthesis of RNA primer; • telomere maintenance via semi-conservative replication; • G1/S transition of mitotic cell cycle;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5557
	19075
	ENSG00000198056
	ENSMUSG00000025395
	P49642
	P20664
	NM_000946
	NM_008921
	NP_000937
	NP_032947
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PRIM1 (англ. DNA primase subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 420 амінокислот, а молекулярна маса — 49 902^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
METFDPTELP	ELLKLYYRRL	FPYSQYYRWL	NYGGVIKNYF	QHREFSFTLK
DDIYIRYQSF	NNQSDLEKEM	QKMNPYKIDI	GAVYSHRPNQ	HNTVKLGAFQ
AQEKELVFDI	DMTDYDDVRR	CCSSADICPK	CWTLMTMAIR	IIDRALKEDF
GFKHRLWVYS	GRRGVHCWVC	DESVRKLSSA	VRSGIVEYLS	LVKGGQDVKK
KVHLSEKIHP	FIRKSINIIK	KYFEEYALVN	QDILENKESW	DKILALVPET
IHDELQQSFQ	KSHNSLQRWE	HLKKVASRYQ	NNIKNDKYGP	WLEWEIMLQY
CFPRLDINVS	KGINHLLKSP	FSVHPKTGRI	SVPIDLQKVD	QFDPFTVPTI
SFICRELDAI	STNEEEKEEN	EAESDVKHRT	RDYKKTSLAP	YVKVFEHFLE
NLDKSRKGEL	LKKSDLQKDF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, реплікація ДНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Cloutier S., Hamel H., Champagne M., Yotov W.V. (1997). Mapping of the human DNA primase 1 (PRIM1) to chromosome 12q13. Genomics. 43: 398—401. PMID 9268648 doi:10.1006/geno.1997.4833

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з DNA primase subunit 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9369 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P49642 (англ.) . Архів оригіналу за 26 грудня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з DNA primase subunit 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9369 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P49642 (англ.) . Архів оригіналу за 26 грудня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]