PCDHA4

PCDHA4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1WUZ
Ідентифікатори
Символи	PCDHA4, CNR1, CNRN1, CRNR1, PCDH-ALPHA4, protocadherin alpha 4
Зовнішні ІД	OMIM: 606310 MGI: 1298406 HomoloGene: 130626 GeneCards: PCDHA4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • зв'язування з іоном кальцію; • зв’язування з іоном металу; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• інтегральний компонент мембрани; • клітинна мембрана; • інтегральний компонент плазматичної мембрани; • мембрана; • ендоплазматичний ретикулум; • синапс;
Біологічний процес	• адгезія клітин; • нейробіологія розвитку; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • cell-cell signaling;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	56144
	12936
	ENSG00000204967
	ENSMUSG00000104252
	Q9UN74
	O88689
	NM_031500; NM_018907
	NM_007766
	NP_061730; NP_113688
	NP_001167625
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PCDHA4 (англ. Protocadherin alpha 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 947 амінокислот, а молекулярна маса — 102 293^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEFSWGSGQE	SRRLLLLLLL	LAAWEAGNGQ	LHYSVSEEAK	HGTFVGRIAQ
DLGLELAELV	PRLFRVASKG	RGGLLEVNLQ	NGILFVNSRI	DREELCRRSA
ECSIHLEVIV	DRPLQVFHVD	VEVRDINDNP	PVFPATQKNL	SIAESRPLDS
RFPLEGASDA	DIGENALLTY	RLSPNEYFSL	EKPPDDELVK	GLGLILRKSL
DREEAPEIFL	VLTATDGGKP	ELTGTVQLLI	TVLDANDNAP	AFDRTIYKVR
LLENVPNGTL	VIKLNASDLD	EGLNGDIVYS	FSNDISPNVK	SKFHIDPITG
QIIVKGYIDF	EESKSYEIIV	EGIDKGQLPL	SGHCRVIVEV	EDNNDNVPDL
EFKSLSLPIR	EDAPLGTVIA	LISVSDKDMG	VNGLVTCSLT	SHVPFKLVST
FKNYYSLVLD	SALDRESVSA	YELVVTARDG	GSPSLWATAS	VSVEVADVND
NAPAFAQPEY	TVFVKENNPP	GCHIFTVSAW	DADAQENALV	SYSLVERRVG
ERALSSYVSV	HAESGKVYAL	QPLDHEELEL	LQFQVTARDA	GVPPLGSNVT
LQVFVLDEND	NAPALLAPRA	GGTGGAVSEL	VPWSVGVGHV	VAKVRAVDAD
SGYNAWLSYE	LQPGTGGARI	PFRVGLYTGE	ISTTRALDET	DAPRHRLLVL
VKDHGEPALT	ATATVLVSLV	ESGQAPKASS	RALVGAVGPD	AALVDVNVYL
IIAICAVSSL	LVLTLLLYTA	LRCSALPTEG	ACAPGKPTLV	CSSAVGSWSY
SQQRRPRVCS	GEGPPKTDLM	AFSPSLPDSR	DREDQLQTTE	ESFAKPRQPN
PDWRYSASLR	AGMHSSVHLE	EAGILRAGPG	GPDQQWPTVS	SATPEPEAGE
VSPPVGAGVN	SNSWTFKYGP	GNPKQSGPGE	LPDKFIIPGS	PAIISIRQEP
TNSQIDKSDF	ITFGKKEETK	KKKKKKKGNK	TQEKKEKGNS	TTDNSDQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 doi:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8670 (англ.) . Архів оригіналу за 30 жовтня 2015. Процитовано 5 вересня 2017. [Архівовано 2015-10-30 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9UN74 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8670 (англ.) . Архів оригіналу за 30 жовтня 2015. Процитовано 5 вересня 2017. [Архівовано 2015-10-30 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q9UN74 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 5 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]