PCDH8

PCDH8
Ідентифікатори
Символи	PCDH8, ARCADLIN, PAPC, protocadherin 8
Зовнішні ІД	OMIM: 603580 MGI: 1306800 HomoloGene: 1943 GeneCards: PCDH8
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном кальцію;
Клітинна компонента	• cell projection; • міжклітинні контакти; • постсинаптична мембрана; • клітинна мембрана; • мембрана; • presynaptic membrane; • інтегральний компонент мембрани; • синапс; • дендрит; • інтегральний компонент плазматичної мембрани; • glutamatergic synapse; • інтегральний компонент постсинаптичної мембрани;
Біологічний процес	• morphogenesis of embryonic epithelium; • somitogenesis; • chemical synaptic transmission; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • cell-cell signaling; • адгезія клітин; • нейробіологія розвитку; • regulation of synaptic membrane adhesion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5100
	18530
	ENSG00000136099
	ENSMUSG00000036422
	O95206
	Q7TSK3
	NM_032949; NM_002590
	NM_001042726; NM_021543
	NP_002581; NP_116567
	NP_001036191; NP_067518
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PCDH8 (англ. Protocadherin 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 070 амінокислот, а молекулярна маса — 113 019^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSPVRRWGSP	CLFPLQLFSL	CWVLSVAQSK	TVRYSTFEED	APGTVIGTLA
EDLHMKVSGD	TSFRLMKQFN	SSLLRVREGD	GQLTVGDAGL	DRERLCGQAP
QCVLAFDVVS	FSQEQFRLVH	VEVEVRDVND	HAPRFPRAQI	PVEVSEGAAV
GTRIPLEVPV	DEDVGANGLQ	TVRLAEPHSP	FRVELQTRAD	GAQCADLVLL
QELDRESQAA	YSLELVAQDG	GRPPRSATAA	LSVRVLDAND	HSPAFPQGAV
AEVELAEDAP	VGSLLLDLDA	ADPDEGPNGD	VVFAFGARTP	PEARRLFRLD
PRSGRLTLAG	PVDYERQDTY	ELDVRAQDRG	PGPRAATCKV	IVRIRDVNDN
APDIAITPLA	APGAPATSPF	AAAAAAAALG	GADASSPAGA	GTPEAGATSL
VPEGAARESL	VALVSTSDRD	SGANGQVRCA	LYGHEHFRLQ	PAYAGSYLVV
TAASLDRERI	AEYNLTLVAE	DRGAPPLRTV	RPYTVRVGDE	NDNAPLFTRP
VYEVSVRENN	PPGAYLATVA	ARDRDLGRNG	QVTYRLLEAE	VGRAGGAVST
YVSVDPATGA	IYALRSFDYE	TLRQLDVRIQ	ASDGGSPQLS	SSALVQVRVL
DQNDHAPVLV	HPAPANGSLE	VAVPGRTAKD	TVVARVQARD	ADEGANGELA
FELQQQEPRE	AFAIGRRTGE	ILLTGDLSQE	PPGRVFRALL	VISDGGRPPL
TTTATVSFVV	TAGGGRGPAA	PASAGSPERS	RPPGSRLGVS	GSVLQWDTPL
IVIIVLAGSC	TLLLAAIIAI	ATTCNRRKKE	VRKGGALREE	RPGAAGGGAS
APGSPEEAAR	GAGPRPNMFD	VLTFPGTGKA	PFGSPAADAP	PPAVAAAEVP
GSEGGSATGE	SACHFEGQQR	LRGAHAEPYG	ASPGFGKEPA	PPVAVWKGHS
FNTISGREAE	KFSGKDSGKG	DSDFNDSDSD	ISGDALKKDL	INHMQSGLWA
CTAECKILGH	SDRCWSPSCS	GPNAHPSPHP	PAQMSTFCKS	TSLPRDPLRR
DNYYQAQLPK	TVGLQSVYEK	VLHRDYDRTV	TLLSPPRPGR	LPDLQEIGVP
LYQSPPGRYL	SPKKGANENV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.

Література

Strehl S., Glatt K., Liu Q.M., Glatt H., Lalande M. (1998). Characterization of two novel protocadherins (PCDH8 and PCDH9) localized on human chromosome 13 and mouse chromosome 14. Genomics. 53: 81—89. PMID 9787079 doi:10.1006/geno.1998.5467
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8660 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O95206 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 13

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8660 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, O95206 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]