IRF3

IRF3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3QU6, 1J2F, 1QWT, 1T2K, 1ZOQ, 2O61, 2O6G, 2PI0, 3A77, 5JEO, 5JEK, 5JER, 5JEM, 5JEL, 5JEJ
Ідентифікатори
Символи	IRF3, entrez:3661, IIAE7, interferon regulatory factor 3
Зовнішні ІД	OMIM: 603734 MGI: 1859179 HomoloGene: 1208 GeneCards: IRF3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з ДНК; • гомодимеризація білків; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001104 transcription coregulator activity; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • protein domain specific binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • специфічне до послідовності зв'язування з ДНК; • identical protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• GO:0097285 апоптоз; • positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway; • macrophage apoptotic process; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • response to bacterium; • response to exogenous dsRNA; • positive regulation of interferon-alpha production; • MDA-5 signaling pathway; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • процес імунної системи; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • транскрипція РНК-полімеразою II; • cellular response to dsRNA; • ДНК-матрична транскрипція; • cellular response to DNA damage stimulus; • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway; • response to lipopolysaccharide; • defense response to virus; • type I interferon signaling pathway; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • negative regulation of type I interferon production; • programmed necrotic cell death; • GO:0022415 viral process; • cellular response to lipopolysaccharide; • positive regulation of type I interferon production; • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway; • positive regulation of interferon-beta production; • вроджений імунітет; • regulation of type I interferon production; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of defense response to virus by host; • регуляція експресії генів; • regulation of inflammatory response; • cellular response to exogenous dsRNA; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3661
	54131
	ENSG00000126456
	ENSMUSG00000003184
	Q14653
	P70671
NM_001197122; NM_001197123; NM_001197124; NM_001197125; NM_001197126;
	NM_001197127; NM_001197128; NM_001571
	NM_016849
NP_001184051; NP_001184052; NP_001184053; NP_001184054; NP_001184055;
	NP_001184056; NP_001184057; NP_001562; NP_001184053.1; NP_001184056.1; NP_001184057.1
	NP_058545
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

IRF3 (англ. Interferon regulatory factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 427 амінокислот, а молекулярна маса — 47 219^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGTPKPRILP	WLVSQLDLGQ	LEGVAWVNKS	RTRFRIPWKH	GLRQDAQQED
FGIFQAWAEA	TGAYVPGRDK	PDLPTWKRNF	RSALNRKEGL	RLAEDRSKDP
HDPHKIYEFV	NSGVGDFSQP	DTSPDTNGGG	STSDTQEDIL	DELLGNMVLA
PLPDPGPPSL	AVAPEPCPQP	LRSPSLDNPT	PFPNLGPSEN	PLKRLLVPGE
EWEFEVTAFY	RGRQVFQQTI	SCPEGLRLVG	SEVGDRTLPG	WPVTLPDPGM
SLTDRGVMSY	VRHVLSCLGG	GLALWRAGQW	LWAQRLGHCH	TYWAVSEELL
PNSGHGPDGE	VPKDKEGGVF	DLGPFIVDLI	TFTEGSGRSP	RYALWFCVGE
SWPQDQPWTK	RLVMVKVVPT	CLRALVEMAR	VGGASSLENT	VDLHISNSHP
LSLTSDQYKA	YLQDLVEGMD	FQGPGES

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Au W.W.-C., Moore P.P.A., Lowther W.W., Juang Y.-T., Pitha P.M. (1995). Identification of a member of the interferon regulatory factor family that binds to the interferon-stimulated response element and activates expression of interferon-induced genes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 11657—11661. PMID 8524823 doi:10.1073/pnas.92.25.11657
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Bellingham J., Gregory-Evans K., Gregory-Evans C.Y. (1998). Mapping of human interferon regulatory factor 3 (IRF3) to chromosome 19q13.3-13.4 by an intragenic polymorphic marker. Ann. Hum. Genet. 62: 231—234. PMID 9803267 doi:10.1046/j.1469-1809.1998.6230231.x
Lin R., Heylbroeck C., Pitha P.M., Hiscott J. (1998). Virus-dependent phosphorylation of the IRF-3 transcription factor regulates nuclear translocation, transactivation potential, and proteasome-mediated degradation. Mol. Cell. Biol. 18: 2986—2996. PMID 9566918 doi:10.1128/MCB.18.5.2986
Kumar K.P., McBride K.M., Weaver B.K., Dingwall C., Reich N.C. (2000). Regulated nuclear-cytoplasmic localization of interferon regulatory factor 3, a subunit of double-stranded RNA-activated factor 1. Mol. Cell. Biol. 20: 4159—4168. PMID 10805757 doi:10.1128/MCB.20.11.4159-4168.2000
Smith E.J., Marie I.J., Prakash A., Garcia-Sastre A., Levy D.E. (2001). IRF3 and IRF7 phosphorylation in virus-infected cells does not require double-stranded RNA-dependent protein kinase R or Ikappa B kinase but is blocked by Vaccinia virus E3L protein. J. Biol. Chem. 276: 8951—8957. PMID 11124948 doi:10.1074/jbc.M008717200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6118 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q14653 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6118 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q14653 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]