NFKBIA

NFKBIA
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1IKN, 1NFI
Ідентифікатори
Символи	NFKBIA, IKBA, MAD-3, NFKBI, NFKB inhibitor alpha, EDAID2
Зовнішні ІД	OMIM: 164008 MGI: 104741 HomoloGene: 7863 GeneCards: NFKBIA
Пов'язані генетичні захворювання
	ectodermal dysplasia, anhidrotic, with T-cell immunodeficiency, autosomal dominant, Hypohidrotic ectodermal dysplasia with immune deficiency
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з фактором транскрипції; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • nuclear localization sequence binding; • identical protein binding; • enzyme binding; • зв'язування з убіквітинпротеїнлігазою; • heat shock protein binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • NF-kappaB binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • I-kappaB/NF-kappaB complex; • клітинна мембрана; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • внутрішньоклітинний; • GO:0009327 protein-containing complex; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• response to muscle stretch; • GO:0051247, GO:0051200 positive regulation of protein metabolic process; • response to exogenous dsRNA; • cytoplasmic sequestering of transcription factor; • negative regulation of DNA binding; • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound; • cytoplasmic sequestering of NF-kappaB; • response to muramyl dipeptide; • negative regulation of apoptotic process; • cellular response to cytokine stimulus; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • response to lipopolysaccharide; • cellular response to cold; • regulation of cell population proliferation; • positive regulation of cholesterol efflux; • nucleotide-binding oligomerization domain containing 2 signaling pathway; • регуляція експресії генів; • negative regulation of lipid storage; • GO:0022415 viral process; • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • negative regulation of myeloid cell differentiation; • negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation; • nucleotide-binding oligomerization domain containing 1 signaling pathway; • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway; • negative regulation of Notch signaling pathway; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0097285 апоптоз; • liver regeneration; • toll-like receptor 4 signaling pathway; • protein deubiquitination; • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • positive regulation of inflammatory response; • cellular response to tumor necrosis factor; • interleukin-1-mediated signaling pathway; • regulation of NIK/NF-kappaB signaling; • protein import into nucleus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4792
	18035
	ENSG00000100906
	ENSMUSG00000021025
	P25963
	Q9Z1E3
	NM_020529
	NM_010907
	NP_065390
	NP_035037
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NFKBIA (англ. NFKB inhibitor alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 317 амінокислот, а молекулярна маса — 35 609^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFQAAERPQE	WAMEGPRDGL	KKERLLDDRH	DSGLDSMKDE	EYEQMVKELQ
EIRLEPQEVP	RGSEPWKQQL	TEDGDSFLHL	AIIHEEKALT	MEVIRQVKGD
LAFLNFQNNL	QQTPLHLAVI	TNQPEIAEAL	LGAGCDPELR	DFRGNTPLHL
ACEQGCLASV	GVLTQSCTTP	HLHSILKATN	YNGHTCLHLA	SIHGYLGIVE
LLVSLGADVN	AQEPCNGRTA	LHLAVDLQNP	DLVSLLLKCG	ADVNRVTYQG
YSPYQLTWGR	PSTRIQQQLG	QLTLENLQML	PESEDEESYD	TESEFTEFTE
DELPYDDCVF	GGQRLTL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Ganchi P.A., Sun S.C., Greene W.C., Ballard D.W. (1992). I kappa B/MAD-3 masks the nuclear localization signal of NF-kappa B p65 and requires the transactivation domain to inhibit NF-kappa B p65 DNA binding. Mol. Biol. Cell. 3: 1339—1352. PMID 1493333 doi:10.1091/mbc.3.12.1339
Scherer D.C., Brockman J.A., Chen Z., Maniatis T., Ballard D.W. (1995). Signal-induced degradation of IkappaB alpha requires site-specific ubiquitination. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 11259—11263. PMID 7479976 doi:10.1073/pnas.92.24.11259
McElhinny J.A., Trushin S.A., Bren G.D., Chester N., Paya C.V. (1996). Casein kinase II phosphorylates I kappa B alpha at S-283, S-289, S-293, and T-291 and is required for its degradation. Mol. Cell. Biol. 16: 899—906. PMID 8622692 doi:10.1128/MCB.16.3.899
Lin R., Beauparlant P., Makris C., Meloche S., Hiscott J. (1996). Phosphorylation of IkappaBalpha in the C-terminal PEST domain by casein kinase II affects intrinsic protein stability. Mol. Cell. Biol. 16: 1401—1409. PMID 8657113 doi:10.1128/MCB.16.4.1401
Sachdev S., Hoffmann A., Hannink M. (1998). Nuclear localization of IkappaB alpha is mediated by the second ankyrin repeat: the IkappaB alpha ankyrin repeats define a novel class of cis-acting nuclear import sequences. Mol. Cell. Biol. 18: 2524—2534. PMID 9566872 doi:10.1128/MCB.18.5.2524

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з NFKBIA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7797 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P25963 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 14

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з NFKBIA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7797 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P25963 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]