HLA-F

HLA-F
Ідентифікатори
Символи	HLA-F, CDA12, HLA-5.4, HLA-CDA12, major histocompatibility complex, class I, F
Зовнішні ІД	OMIM: 143110 MGI: 3647514 HomoloGene: 133121 GeneCards: HLA-F
Онтологія гена
Молекулярна функція	• TAP2 binding; • TAP1 binding; • signaling receptor binding; • peptide antigen binding; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • beta-2-microglobulin binding; • 14-3-3 protein binding;
Клітинна компонента	• інтегральний компонент мембрани; • phagocytic vesicle membrane; • мембрана ранньої ендосоми; • мембрана; • Golgi membrane; • клітинна мембрана; • поверхня клітини; • ендоплазматичний ретикулум; • MHC class I protein complex; • ER to Golgi transport vesicle membrane; • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane; • recycling endosome membrane; • міжклітинний простір; • лізосома; • lysosomal membrane; • ендосома; • зовнішня поверхня плазматичної мембрани; • MHC class Ib protein complex;
Біологічний процес	• antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • процес імунної системи; • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-independent; • type I interferon signaling pathway; • regulation of immune response; • positive regulation of T cell mediated cytotoxicity; • antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class Ib; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class Ib; • antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class I via ER pathway, TAP-independent; • negative regulation of T cell cytokine production; • negative regulation of natural killer cell cytokine production; • positive regulation of natural killer cell cytokine production; • negative regulation of natural killer cell degranulation; • positive regulation of natural killer cell degranulation; • negative regulation of natural killer cell mediated cytotoxicity; • negative regulation of neuron death;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3134
	630294
ENSG00000229698; ENSG00000237508; ENSG00000234487; ENSG00000206509; ENSG00000137403;
	ENSG00000235220; ENSG00000204642
	н/д
	P30511
	Q0WXH6
	NM_001098478; NM_001098479; NM_018950
	NM_001177467
	NP_001091948; NP_001091949; NP_061823
	NP_001170938
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HLA-F (англ. Major histocompatibility complex, class I, F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 346 амінокислот, а молекулярна маса — 39 062^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPRSLLLLL	SGALALTDTW	AGSHSLRYFS	TAVSRPGRGE	PRYIAVEYVD
DTQFLRFDSD	AAIPRMEPRE	PWVEQEGPQY	WEWTTGYAKA	NAQTDRVALR
NLLRRYNQSE	AGSHTLQGMN	GCDMGPDGRL	LRGYHQHAYD	GKDYISLNED
LRSWTAADTV	AQITQRFYEA	EEYAEEFRTY	LEGECLELLR	RYLENGKETL
QRADPPKAHV	AHHPISDHEA	TLRCWALGFY	PAEITLTWQR	DGEEQTQDTE
LVETRPAGDG	TFQKWAAVVV	PPGEEQRYTC	HVQHEGLPQP	LILRWEQSPQ
PTIPIVGIVA	GLVVLGAVVT	GAVVAAVMWR	KKSSDRNRGS	YSQAAV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

Geraghty D.E., Wei X., Orr H.T., Koller B.H. (1990). Human leukocyte antigen F (HLA-F). An expressed HLA gene composed of a class I coding sequence linked to a novel transcribed repetitive element. J. Exp. Med. 171: 1—18. PMID 1688605 doi:10.1084/jem.171.1.1
Lury D., Epstein H., Holmes N. (1990). The human class I MHC gene HLA-F is expressed in lymphocytes. Int. Immunol. 2: 531—537. PMID 1707659 doi:10.1093/intimm/2.6.531
He X., Xu L., Liu Y., Zeng Y. (2004). Identification of a novel HLA-F allele - HLA-F*010102. Tissue Antigens. 63: 181—183. PMID 14705989 doi:10.1111/j.1399-0039.2004.00145.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4963 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2015. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2015-08-23 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P30511 (англ.) . Архів оригіналу за 11 жовтня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4963 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2015. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2015-08-23 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P30511 (англ.) . Архів оригіналу за 11 жовтня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]