HLA-E

HLA-E
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3CII, 1KPR, 1KTL, 1MHE, 2ESV, 3AM8, 3BZE, 3BZF, 3CDG
Ідентифікатори
Символи	HLA-E, EA1.2, EA2.1, HLA-6.2, MHC, QA1, major histocompatibility complex, class I, E
Зовнішні ІД	OMIM: 143010 MGI: 2442805 HomoloGene: 134018 GeneCards: HLA-E
Онтологія гена
Молекулярна функція	• beta-2-microglobulin binding; • MHC class I protein binding; • signaling receptor binding; • natural killer cell lectin-like receptor binding; • peptide antigen binding; • T cell receptor binding;
Клітинна компонента	• інтегральний компонент мембрани; • phagocytic vesicle membrane; • мембрана ранньої ендосоми; • мембрана; • MHC class Ib protein complex; • Golgi membrane; • клітинна мембрана; • поверхня клітини; • MHC class I protein complex; • ER to Golgi transport vesicle membrane; • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane; • екзосома; • recycling endosome membrane;
Біологічний процес	• antigen processing and presentation; • адаптивна імунна відповідь; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; • CD8-positive, alpha-beta T cell activation; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • процес імунної системи; • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I; • positive regulation of T cell mediated cytotoxicity; • positive regulation of TRAIL production; • positive regulation of interleukin-4 production; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-independent; • protection from natural killer cell mediated cytotoxicity; • positive regulation of interleukin-13 production; • type I interferon signaling pathway; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • regulation of natural killer cell mediated immunity; • positive regulation of natural killer cell mediated immunity; • regulation of immune response; • positive regulation of tumor necrosis factor production; • вроджений імунітет; • positive regulation of CD8-positive, alpha-beta T cell proliferation; • antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class Ib;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	3133
	667803
ENSG00000204592; ENSG00000225201; ENSG00000236632; ENSG00000230254; ENSG00000206493;
	ENSG00000233904; ENSG00000229252
	ENSMUSG00000073405
	P13747
	н/д
	NM_005516
	NM_001271005
	NP_005507
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HLA-E (англ. Major histocompatibility complex, class I, E) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 358 амінокислот, а молекулярна маса — 40 157^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVDGTLLLLL	SEALALTQTW	AGSHSLKYFH	TSVSRPGRGE	PRFISVGYVD
DTQFVRFDND	AASPRMVPRA	PWMEQEGSEY	WDRETRSARD	TAQIFRVNLR
TLRGYYNQSE	AGSHTLQWMH	GCELGPDRRF	LRGYEQFAYD	GKDYLTLNED
LRSWTAVDTA	AQISEQKSND	ASEAEHQRAY	LEDTCVEWLH	KYLEKGKETL
LHLEPPKTHV	THHPISDHEA	TLRCWALGFY	PAEITLTWQQ	DGEGHTQDTE
LVETRPAGDG	TFQKWAAVVV	PSGEEQRYTC	HVQHEGLPEP	VTLRWKPASQ
PTIPIVGIIA	GLVLLGSVVS	GAVVAAVIWR	KKSSGGKGGS	YSKAEWSDSA
QGSESHSL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Ohya K., Kondo K., Mizuno S. (1990). Polymorphism in the human class I MHC locus HLA-E in Japanese. Immunogenetics. 32: 205—209. PMID 1977695 doi:10.1007/BF02114975
Mizuno S., Trapani J.A., Koller B.H., Dupont B., Yang S.Y. (1988). Isolation and nucleotide sequence of a cDNA clone encoding a novel HLA class I gene. J. Immunol. 140: 4024—4030. PMID 3131426
Koller B.H., Geraghty D.E., Shimizu Y., Demars R., Orr H.T. (1988). HLA-E. A novel HLA class I gene expressed in resting T lymphocytes. J. Immunol. 141: 897—904. PMID 3260916

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4962 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2015. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2015-08-23 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P13747 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4962 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2015. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2015-08-23 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P13747 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]