HLA-DRB1

HLA-DRB1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1A6A, 1BX2, 1YMM, 2WBJ,%%s1AQD, 1DLH, 1FYT, 1HXY, 1JWM, 1JWS, 1JWU, 1KG0, 1KLG, 1KLU, 1LO5, 1PYW, 1R5I, 1SEB, 1SJH, 1T5W, 1T5X, 2FSE, 2G9H, 2IAM, 2IAN, 2ICW, 2IPK, 2OJE, 2XN9, 3L6F, 3PDO, 3PGC, 3PGD, 3QXA, 3QXD, 3S4S, 3S5L, 4AEN, 4AH2, 4C56, 4E41, 4FQX, 4GBX, 4I5B, 4OV5, 4X5W, 4X5X,%%s1D5M, 1D5X, 1D5Z, 1D6E, 1J8H, 2SEB, 3O6F, 3T0E, 4IS6, 4MCY, 4MCZ, 4MD0, 4MD4, 4MD5, 4MDI, 4MDJ, 4Y19, 4Y1A
Ідентифікатори
Символи	HLA-DRB1, DRB1, DRw10, HLA-DR1B, HLA-DRB, SS1, major histocompatibility complex, class II, DR beta 1
Зовнішні ІД	OMIM: 142857 MGI: 95901 HomoloGene: 136635 GeneCards: HLA-DRB1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptide antigen binding; • MHC class II receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • MHC class II protein complex binding;
Клітинна компонента	• інтегральний компонент мембрани; • endocytic vesicle membrane; • clathrin-coated endocytic vesicle membrane; • ендосома; • комплекс Ґольджі; • trans-Golgi network membrane; • мембрана ендоплазматичного ретикулуму; • мембрана; • late endosome membrane; • Golgi membrane; • клітинна мембрана; • transport vesicle membrane; • MHC class II protein complex; • lysosomal membrane; • ендоплазматичний ретикулум; • ER to Golgi transport vesicle membrane; • лізосома; • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane; • endosome membrane; • зовнішня поверхня плазматичної мембрани; • поверхня клітини; • екзосома;
Біологічний процес	• antigen processing and presentation; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II; • процес імунної системи; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • immunoglobulin production involved in immunoglobulin-mediated immune response; • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II; • humoral immune response mediated by circulating immunoglobulin; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • peptide antigen assembly with MHC class II protein complex; • T cell receptor signaling pathway; • адаптивна імунна відповідь; • negative regulation of interferon-gamma production; • inflammatory response to antigenic stimulus; • protein tetramerization; • regulation of interleukin-4 production; • negative regulation of T cell proliferation; • T-helper 1 type immune response; • positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus; • T cell costimulation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3123
	14969
ENSG00000236884; ENSG00000206240; ENSG00000229074; ENSG00000196126; ENSG00000206306;
	ENSG00000228080
	ENSMUSG00000060586
	P01911
P04231; P04230; P18468; P18469; O78196;
	н/д
	NM_001243965; NM_002124; NM_001359193; NM_001359194
	NM_010382
	NP_001230894; NP_002115; NP_001346122; NP_001346123; NP_002115.2
	NP_034512
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HLA-DRB1 (англ. HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-15 beta chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 266 амінокислот, а молекулярна маса — 29 966^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVCLKLPGGS	CMTALTVTLM	VLSSPLALSG	DTRPRFLWQP	KRECHFFNGT
ERVRFLDRYF	YNQEESVRFD	SDVGEFRAVT	ELGRPDAEYW	NSQKDILEQA
RAAVDTYCRH	NYGVVESFTV	QRRVQPKVTV	YPSKTQPLQH	HNLLVCSVSG
FYPGSIEVRW	FLNGQEEKAG	MVSTGLIQNG	DWTFQTLVML	ETVPRSGEVY
TCQVEHPSVT	SPLTVEWRAR	SESAQSKMLS	GVGGFVLGLL	FLGAGLFIYF
RNQKGHSGLQ	PTGFLS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Lock C.B., So A.K., Welsh K.I., Parkes J.D., Trowsdale J. (1988). MHC class II sequences of an HLA-DR2 narcoleptic. Immunogenetics. 27: 449—455. PMID 3259543 doi:10.1007/BF00364432
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Lee B.S.M., Rust N.A., McMichael A.J., McDevitt H.O. (1987). HLA-DR2 subtypes form an additional supertypic family of DR beta alleles. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 4591—4595. PMID 2885840 doi:10.1073/pnas.84.13.4591
Cresswell P. (1996). Invariant chain structure and MHC class II function. Cell. 84: 505—507. PMID 8598037 doi:10.1016/S0092-8674(00)81025-9
Villadangos J.A. (2001). Presentation of antigens by MHC class II molecules: getting the most out of them. Mol. Immunol. 38: 329—346. PMID 11684289 doi:10.1016/S0161-5890(01)00069-4
Menendez-Benito V., Neefjes J. (2007). Autophagy in MHC class II presentation: sampling from within. Immunity. 26: 1—3. PMID 17241953 doi:10.1016/j.immuni.2007.01.005

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4948 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2015-10-17 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P01911 (англ.) . Архів оригіналу за 24 жовтня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4948 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2015-10-17 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P01911 (англ.) . Архів оригіналу за 24 жовтня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]