HLA-DPB1

HLA-DPB1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3LQZ, 4P4K, 4P4R, 4P57, 4P5K, 4P5M
Ідентифікатори
Символи	HLA-DPB1, DPB1, HLA-DP, HLA-DP1B, HLA-DPB, major histocompatibility complex, class II, DP beta 1
Зовнішні ІД	OMIM: 142858 HomoloGene: 129927 GeneCards: HLA-DPB1
Пов'язані генетичні захворювання
	гепатит B
Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptide antigen binding;
Клітинна компонента	• інтегральний компонент мембрани; • endocytic vesicle membrane; • clathrin-coated endocytic vesicle membrane; • ендосома; • комплекс Ґольджі; • trans-Golgi network membrane; • мембрана ендоплазматичного ретикулуму; • мембрана; • Golgi membrane; • клітинна мембрана; • transport vesicle membrane; • MHC class II protein complex; • поверхня клітини; • lysosomal membrane; • ендоплазматичний ретикулум; • ER to Golgi transport vesicle membrane; • лізосома; • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane; • endosome membrane;
Біологічний процес	• antigen processing and presentation; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • процес імунної системи; • T cell costimulation; • positive regulation of interferon-gamma production; • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II; • positive regulation of T cell activation; • positive regulation of T cell proliferation; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • T cell receptor signaling pathway; • адаптивна імунна відповідь;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3115
	368615
ENSG00000236693; ENSG00000230708; ENSG00000229295; ENSG00000226826; ENSG00000215048;
	ENSG00000223865; ENSG00000230763; ENSG00000237710
	ENSDARG00000104635
	P04440
	Q32Q47
	NM_002121
	NM_001007206
	NP_002112
	NP_001007207
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HLA-DPB1 (англ. Major histocompatibility complex, class II, DP beta 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 258 амінокислот, а молекулярна маса — 29 159^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMVLQVSAAP	RTVALTALLM	VLLTSVVQGR	ATPENYLFQG	RQECYAFNGT
QRFLERYIYN	REEFARFDSD	VGEFRAVTEL	GRPAAEYWNS	QKDILEEKRA
VPDRMCRHNY	ELGGPMTLQR	RVQPRVNVSP	SKKGPLQHHN	LLVCHVTDFY
PGSIQVRWFL	NGQEETAGVV	STNLIRNGDW	TFQILVMLEM	TPQQGDVYTC
QVEHTSLDSP	VTVEWKAQSD	SARSKTLTGA	GGFVLGLIIC	GVGIFMHRRS
KKVQRGSA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Kelly A., Trowsdale J. (1985). Complete nucleotide sequence of a functional HLA-DP beta gene and the region between the DP beta 1 and DP alpha 1 genes: comparison of the 5' ends of HLA class II genes. Nucleic Acids Res. 13: 1607—1621. PMID 2987832 doi:10.1093/nar/13.5.1607
Compagnone-Post P., Turco E., Robinson C., Trucco M. (1988). The beta-chains of DP4 molecules from different haplotypes are encoded by the same gene. Genomics. 2: 8—13. PMID 2838415 doi:10.1016/0888-7543(88)90103-6
Korioth F., Hartung K., Deicher H., Frey J. (1992). A new HLA-DPB1 allele from a patient with systemic lupus erythematosus. Tissue Antigens. 39: 216—219. PMID 1529429 doi:10.1111/j.1399-0039.1992.tb01938.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Rani R., Fernandez-Vina M.A., Zhang S., Stastny P. (1995). HLA-DPB1 alleles in a population from north India and description of a new variant (DPB1*5601). Tissue Antigens. 45: 264—269. PMID 7638863 doi:10.1111/j.1399-0039.1995.tb02450.x
Hessner M.J., Baxter-Lowe L.A. (1992). Characterization of novel HLA-DPB1 alleles by oligotyping and nucleotide sequencing. Tissue Antigens. 40: 261—263. PMID 1481203 doi:10.1111/j.1399-0039.1992.tb02055.x