HLA-DPA1

HLA-DPA1
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3LQZ, 4P4K, 4P4R, 4P57, 4P5K, 4P5M
Ідентифікатори
Символи	HLA-DPA1, DP(W3), DP(W4), HLA-DP1A, HLADP, HLASB, PLT1, major histocompatibility complex, class II, DP alpha 1, DPA1, HLA-DPB1, HLA-DPA, Major histocompatibility complex, class II, DP alpha 1
Зовнішні ІД	OMIM: 142880 HomoloGene: 110708 GeneCards: HLA-DPA1
Пов'язані генетичні захворювання
	гепатит B
Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptide antigen binding; • MHC class II receptor activity;
Клітинна компонента	• інтегральний компонент мембрани; • endocytic vesicle membrane; • clathrin-coated endocytic vesicle membrane; • ендосома; • комплекс Ґольджі; • trans-Golgi network membrane; • мембрана ендоплазматичного ретикулуму; • мембрана; • Golgi membrane; • клітинна мембрана; • transport vesicle membrane; • інтегральний компонент плазматичної мембрани; • MHC class II protein complex; • поверхня клітини; • lysosomal membrane; • ендоплазматичний ретикулум; • ER to Golgi transport vesicle membrane; • лізосома; • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane; • endosome membrane; • внутрішньоклітинна мембранна органела;
Біологічний процес	• antigen processing and presentation; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • процес імунної системи; • positive regulation of interferon-gamma production; • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II; • positive regulation of T cell activation; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • positive regulation of T cell proliferation; • cellular response to interferon-gamma; • T cell receptor signaling pathway; • адаптивна імунна відповідь;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3113
	100332267
ENSG00000229685; ENSG00000224103; ENSG00000206291; ENSG00000168384; ENSG00000228163;
	ENSG00000236177; ENSG00000235844; ENSG00000231389
	н/д
	P20036
	н/д
	NM_001242524; NM_001242525; NM_033554; NM_001405020
	XM_002660389
	NP_001229453; NP_001229454; NP_291032
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HLA-DPA1 (англ. Major histocompatibility complex, class II, DP alpha 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 260 амінокислот, а молекулярна маса — 29 381^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRPEDRMFHI	RAVILRALSL	AFLLSLRGAG	AIKADHVSTY	AAFVQTHRPT
GEFMFEFDED	EMFYVDLDKK	ETVWHLEEFG	QAFSFEAQGG	LANIAILNNN
LNTLIQRSNH	TQATNDPPEV	TVFPKEPVEL	GQPNTLICHI	DKFFPPVLNV
TWLCNGELVT	EGVAESLFLP	RTDYSFHKFH	YLTFVPSAED	FYDCRVEHWG
LDQPLLKHWE	AQEPIQMPET	TETVLCALGL	VLGLVGIIVG	TVLIIKSLRS
GHDPRAQGTL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Lawrance S.K., Das H.K., Pan J., Weissman S.M. (1985). The genomic organisation and nucleotide sequence of the HLA-SB(DP) alpha gene. Nucleic Acids Res. 13: 7515—7528. PMID 2997750 doi:10.1093/nar/13.20.7515
Young J.A., Lindsay J., Bodmer J.G., Trowsdale J. (1988). Epitope recognition by a DP alpha chain-specific monoclonal antibody (DP11.1) is influenced by the interaction between the DP alpha chain and its polymorphic DP beta chain partner. Hum. Immunol. 23: 37—44. PMID 2461352 doi:10.1016/0198-8859(88)90016-X
Muntau B., Thye T., Pirmez C., Horstmann R.D. (1997). A novel DPA1 allele (DPA1*0203) composed of known epitopes. Tissue Antigens. 49: 668—669. PMID 9234495 doi:10.1111/j.1399-0039.1997.tb02821.x
McDaniel D.O., Nguyen C., McDaniel L.S. (2000). A new HLA-DPA1 allele, DPA1*02016, identified in African-American population. Tissue Antigens. 56: 197—198. PMID 11019928 doi:10.1034/j.1399-0039.2000.560219.x
Peterson T.A., Luo M., Mao X., Brunham R.C., Plummer F.A. (2008). Identification of a novel DPA1 allele, DPA1*010602, in an East African population. Hum. Immunol. 69: 885—886. PMID 18838095 doi:10.1016/j.humimm.2008.09.001
Lee K.W. (2008). Description of two novel HLA-DPA1 alleles: DPA1*0110 and DPA1*010304. Tissue Antigens. 71: 575—577. PMID 18380777 doi:10.1111/j.1399-0039.2008.01035.x