HLA-DOB

HLA-DOB
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4I0P
Ідентифікатори
Символи	HLA-DOB, DOB, major histocompatibility complex, class II, DO beta, HLA_DOB
Зовнішні ІД	OMIM: 600629 MGI: 95925 HomoloGene: 1602 GeneCards: HLA-DOB
Онтологія гена
Молекулярна функція	• MHC class II receptor activity; • MHC class II protein complex binding;
Клітинна компонента	• lysosomal membrane; • endosome membrane; • лізосома; • мембрана; • ендосома; • інтегральний компонент мембрани; • внутрішньоклітинний; • MHC class II protein complex;
Біологічний процес	• negative regulation of antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class II; • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II; • antigen processing and presentation; • процес імунної системи; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • адаптивна імунна відповідь;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3112
	15002
ENSG00000243496; ENSG00000241910; ENSG00000243612; ENSG00000239457; ENSG00000241386;
	ENSG00000241106
	ENSMUSG00000041538
	P13765
	н/д
	NM_002120
	NM_010389
	NP_002111
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HLA-DOB (англ. Major histocompatibility complex, class II, DO beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 273 амінокислот, а молекулярна маса — 30 822^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGSGWVPWVV	ALLVNLTRLD	SSMTQGTDSP	EDFVIQAKAD	CYFTNGTEKV
QFVVRFIFNL	EEYVRFDSDV	GMFVALTKLG	QPDAEQWNSR	LDLLERSRQA
VDGVCRHNYR	LGAPFTVGRK	VQPEVTVYPE	RTPLLHQHNL	LHCSVTGFYP
GDIKIKWFLN	GQEERAGVMS	TGPIRNGDWT	FQTVVMLEMT	PELGHVYTCL
VDHSSLLSPV	SVEWRAQSEY	SWRKMLSGIA	AFLLGLIFLL	VGIVIQLRAQ
KGYVRTQMSG	NEVSRAVLLP	QSC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література

Jonsson A.-K., Rask L. (1989). Human class II DNA and DOB genes display low sequence variability. Immunogenetics. 29: 411—413. PMID 2499532 doi:10.1007/BF00375872
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Alfonso C., Karlsson L. (2000). Nonclassical MHC class II molecules. Annu. Rev. Immunol. 18: 113—142. PMID 10837054 doi:10.1146/annurev.immunol.18.1.113
Tonnelle C., Demars R., Long E.O. (1985). DO beta: a new beta chain gene in HLA-D with a distinct regulation of expression. EMBO J. 4: 2839—2847. PMID 2998758
Servenius B., Rask L., Peterson P.A. (1987). Class II genes of the human major histocompatibility complex. The DO beta gene is a divergent member of the class II beta gene family. J. Biol. Chem. 262: 8759—8766. PMID 3036827

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4937 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2015-10-17 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P13765 (англ.) . Архів оригіналу за 9 жовтня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4937 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2015-10-17 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P13765 (англ.) . Архів оригіналу за 9 жовтня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]