HLA-DOA

HLA-DOA
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4I0P
Ідентифікатори
Символи	HLA-DOA, HLA-DNA, HLA-DZA, HLADZ, major histocompatibility complex, class II, DO alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 142930 MGI: 95924 HomoloGene: 1601 GeneCards: HLA-DOA
Пов'язані генетичні захворювання
	пародонтит
Онтологія гена
Молекулярна функція	• MHC class II receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • MHC class II protein complex binding;
Клітинна компонента	• інтегральний компонент мембрани; • lysosomal membrane; • ендосома; • клітинна мембрана; • лізосома; • MHC class II protein complex; • endosome membrane; • мембрана;
Біологічний процес	• antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II; • antigen processing and presentation; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • negative regulation of antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class II; • regulation of T cell differentiation; • процес імунної системи; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • адаптивна імунна відповідь;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3111
	15001
ENSG00000204252; ENSG00000230141; ENSG00000232962; ENSG00000235744; ENSG00000231558;
	ENSG00000206292; ENSG00000232957
	ENSMUSG00000024334
	P06340
	н/д
	NM_002119; NM_015851
	NM_008206
	NP_002110
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HLA-DOA (англ. Major histocompatibility complex, class II, DO alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 250 амінокислот, а молекулярна маса — 27 599^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALRAGLVLG	FHTLMTLLSP	QEAGATKADH	MGSYGPAFYQ	SYGASGQFTH
EFDEEQLFSV	DLKKSEAVWR	LPEFGDFARF	DPQGGLAGIA	AIKAHLDILV
ERSNRSRAIN	VPPRVTVLPK	SRVELGQPNI	LICIVDNIFP	PVINITWLRN
GQTVTEGVAQ	TSFYSQPDHL	FRKFHYLPFV	PSAEDVYDCQ	VEHWGLDAPL
LRHWELQVPI	PPPDAMETLV	CALGLAIGLV	GFLVGTVLII	MGTYVSSVPR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література

Jonsson A.-K., Rask L. (1989). Human class II DNA and DOB genes display low sequence variability. Immunogenetics. 29: 411—413. PMID 2499532 doi:10.1007/BF00375872
Young J.A., Trowsdale J. (1990). The HLA-DNA (DZA) gene is correctly expressed as a 1.1 kb mature mRNA transcript. Immunogenetics. 31: 386—388. PMID 2370084 doi:10.1007/BF02115015
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Alfonso C., Karlsson L. (2000). Nonclassical MHC class II molecules. Annu. Rev. Immunol. 18: 113—142. PMID 10837054 doi:10.1146/annurev.immunol.18.1.113
Trowsdale J., Kelly A. (1985). The human HLA class II alpha chain gene DZ alpha is distinct from genes in the DP, DQ and DR subregions. EMBO J. 4: 2231—2237. PMID 3000765