HDAC9

HDAC9
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1TQE
Ідентифікатори
Символи	HDAC9, HD7, HD7b, HD9, HDAC, HDAC7, HDAC7B, HDAC9B, HDAC9FL, HDRP, MITR, histone deacetylase 9
Зовнішні ІД	OMIM: 606543 MGI: 1931221 HomoloGene: 128578 GeneCards: HDAC9
шифр КФ	3.5.1.98
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння, інсульт, неспецифічний виразковий коліт, цереброваскулярні хвороби
Реагує на сполуку
	belinostat, entinostat, givinostat, panobinostat, quisinostat, romidepsin, trichostatin A, золінза
Онтологія гена
Молекулярна функція	• NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific); • GO:0001106 transcription corepressor activity; • histone deacetylase activity; • protein deacetylase activity; • зв'язування з фактором транскрипції; • histone deacetylase binding; • зв’язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • гідролазна активність; • protein kinase C binding; • histone deacetylase activity (H4-K16 specific);
Клітинна компонента	• цитоплазма; • histone deacetylase complex; • регуляторний транскрипційний комплекс; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • histone methyltransferase complex;
Біологічний процес	• histone H3 deacetylation; • peptidyl-lysine deacetylation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis; • response to amphetamine; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of striated muscle cell differentiation; • ДНК-матрична транскрипція; • B cell activation; • development of the heart; • histone H4 deacetylation; • neuron differentiation; • cellular response to insulin stimulus; • regulation of skeletal muscle fiber development; • B cell differentiation; • inflammatory response; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • histone deacetylation; • cholesterol homeostasis; • negative regulation of lipoprotein lipase activity; • histone H4-K16 deacetylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	9734
	79221
	ENSG00000048052
	ENSMUSG00000004698
	Q9UKV0
	Q99N13
NM_001204144; NM_001204145; NM_001204146; NM_001204147; NM_001204148;
	NM_014707; NM_058176; NM_058177; NM_178423; NM_178425; NM_001321868; NM_001321869; NM_001321870; NM_001321871; NM_001321872; NM_001321873; NM_001321874; NM_001321875; NM_001321876; NM_001321877; NM_001321878; NM_001321879; NM_001321884; NM_001321885; NM_001321886; NM_001321887; NM_001321888; NM_001321889; NM_001321890; NM_001321891; NM_001321893; NM_001321894; NM_001321895; NM_001321896; NM_001321897; NM_001321898; NM_001321899; NM_001321900; NM_001321901; NM_001321902
	NM_001271386; NM_024124
NP_001191073; NP_001191074; NP_001191075; NP_001191076; NP_001191077;
	NP_001308797; NP_001308798; NP_001308799; NP_001308800; NP_001308801; NP_001308802; NP_001308803; NP_001308804; NP_001308805; NP_001308806; NP_001308807; NP_001308808; NP_001308813; NP_001308814; NP_001308815; NP_001308816; NP_001308817; NP_001308818; NP_001308819; NP_001308820; NP_001308822; NP_001308823; NP_001308824; NP_001308825; NP_001308826; NP_001308827; NP_001308828; NP_001308829; NP_001308830; NP_001308831; NP_055522; NP_478056; NP_848510; NP_848512
	NP_001258315; NP_077038
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HDAC9 (англ. Histone deacetylase 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 011 амінокислот, а молекулярна маса — 111 297^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MHSMISSVDV	KSEVPVGLEP	ISPLDLRTDL	RMMMPVVDPV	VREKQLQQEL
LLIQQQQQIQ	KQLLIAEFQK	QHENLTRQHQ	AQLQEHIKEL	LAIKQQQELL
EKEQKLEQQR	QEQEVERHRR	EQQLPPLRGK	DRGRERAVAS	TEVKQKLQEF
LLSKSATKDT	PTNGKNHSVS	RHPKLWYTAA	HHTSLDQSSP	PLSGTSPSYK
YTLPGAQDAK	DDFPLRKTAS	EPNLKVRSRL	KQKVAERRSS	PLLRRKDGNV
VTSFKKRMFE	VTESSVSSSS	PGSGPSSPNN	GPTGSVTENE	TSVLPPTPHA
EQMVSQQRIL	IHEDSMNLLS	LYTSPSLPNI	TLGLPAVPSQ	LNASNSLKEK
QKCETQTLRQ	GVPLPGQYGG	SIPASSSHPH	VTLEGKPPNS	SHQALLQHLL
LKEQMRQQKL	LVAGGVPLHP	QSPLATKERI	SPGIRGTHKL	PRHRPLNRTQ
SAPLPQSTLA	QLVIQQQHQQ	FLEKQKQYQQ	QIHMNKLLSK	SIEQLKQPGS
HLEEAEEELQ	GDQAMQEDRA	PSSGNSTRSD	SSACVDDTLG	QVGAVKVKEE
PVDSDEDAQI	QEMESGEQAA	FMQQPFLEPT	HTRALSVRQA	PLAAVGMDGL
EKHRLVSRTH	SSPAASVLPH	PAMDRPLQPG	SATGIAYDPL	MLKHQCVCGN
STTHPEHAGR	IQSIWSRLQE	TGLLNKCERI	QGRKASLEEI	QLVHSEHHSL
LYGTNPLDGQ	KLDPRILLGD	DSQKFFSSLP	CGGLGVDSDT	IWNELHSSGA
ARMAVGCVIE	LASKVASGEL	KNGFAVVRPP	GHHAEESTAM	GFCFFNSVAI
TAKYLRDQLN	ISKILIVDLD	VHHGNGTQQA	FYADPSILYI	SLHRYDEGNF
FPGSGAPNEV	GTGLGEGYNI	NIAWTGGLDP	PMGDVEYLEA	FRTIVKPVAK
EFDPDMVLVS	AGFDALEGHT	PPLGGYKVTA	KCFGHLTKQL	MTLADGRVVL
ALEGGHDLTA	ICDASEACVN	ALLGNELEPL	AEDILHQSPN	MNAVISLQKI
IEIQSMSLKF	S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

Zhou X., Marks P.A., Rifkind R.A., Richon V.M. (2001). Cloning and characterization of a histone deacetylase, HDAC9. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 10572—10577. PMID 11535832 doi:10.1073/pnas.191375098
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Zhou X., Richon V.M., Rifkind R.A., Marks P.A. (2000). Identification of a transcriptional repressor related to the noncatalytic domain of histone deacetylases 4 and 5. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 1056—1061. PMID 10655483 doi:10.1073/pnas.97.3.1056

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з HDAC9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Histone deacetylase 9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14065 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2015-10-17 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9UKV0 (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з HDAC9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Histone deacetylase 9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14065 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2015-10-17 у Wayback Machine.]

[UniProt-6] UniProt, Q9UKV0 (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]