Гістондеацетилаза-5

HDAC5
Ідентифікатори
Символи	HDAC5, HD5, NY-CO-9, histone deacetylase 5
Зовнішні ІД	OMIM: 605315 MGI: 1333784 HomoloGene: 3995 GeneCards: HDAC5
шифр КФ	3.5.1.98
Реагує на сполуку
	belinostat, givinostat, pracinostat, quisinostat, romidepsin, trichostatin A, золінза
Онтологія гена
Молекулярна функція	• NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific); • protein deacetylase activity; • histone deacetylase binding; • chromatin binding; • зв’язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • гідролазна активність; • protein kinase C binding; • histone deacetylase activity; • зв'язування з фактором транскрипції; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• комплекс Ґольджі; • histone deacetylase complex; • цитоплазма; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • гіалоплазма; • nuclear speck; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• histone H3 deacetylation; • ремоделювання хроматину; • regulation of myotube differentiation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • Епігенетичне успадкування; • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity; • regulation of histone H3-K9 acetylation; • response to activity; • ДНК-матрична транскрипція; • protein deacetylation; • negative regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis; • B cell activation; • neuron differentiation; • negative regulation of myotube differentiation; • cellular response to insulin stimulus; • B cell differentiation; • inflammatory response; • regulation of protein binding; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • cellular response to lipopolysaccharide; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • response to cocaine; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • histone deacetylation; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	10014
	15184
	ENSG00000108840
	ENSMUSG00000008855
	Q9UQL6
	Q9Z2V6
	NM_001015053; NM_005474; NM_139205; NM_001382393
NM_001077696; NM_001284248; NM_001284249; NM_001284250; NM_010412;
	NM_001361596
	NP_001015053; NP_005465; NP_001369322
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Гістондеацетилаза-5 (англ. Histone deacetylase 5) — білок, який кодується геном HDAC5, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 122 амінокислот, а молекулярна маса — 121 978^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNSPNESDGM	SGREPSLEIL	PRTSLHSIPV	TVEVKPVLPR	AMPSSMGGGG
GGSPSPVELR	GALVGSVDPT	LREQQLQQEL	LALKQQQQLQ	KQLLFAEFQK
QHDHLTRQHE	VQLQKHLKQQ	QEMLAAKQQQ	EMLAAKRQQE	LEQQRQREQQ
RQEELEKQRL	EQQLLILRNK	EKSKESAIAS	TEVKLRLQEF	LLSKSKEPTP
GGLNHSLPQH	PKCWGAHHAS	LDQSSPPQSG	PPGTPPSYKL	PLPGPYDSRD
DFPLRKTASE	PNLKVRSRLK	QKVAERRSSP	LLRRKDGTVI	STFKKRAVEI
TGAGPGASSV	CNSAPGSGPS	SPNSSHSTIA	ENGFTGSVPN	IPTEMLPQHR
ALPLDSSPNQ	FSLYTSPSLP	NISLGLQATV	TVTNSHLTAS	PKLSTQQEAE
RQALQSLRQG	GTLTGKFMST	SSIPGCLLGV	ALEGDGSPHG	HASLLQHVLL
LEQARQQSTL	IAVPLHGQSP	LVTGERVATS	MRTVGKLPRH	RPLSRTQSSP
LPQSPQALQQ	LVMQQQHQQF	LEKQKQQQLQ	LGKILTKTGE	LPRQPTTHPE
ETEEELTEQQ	EVLLGEGALT	MPREGSTESE	STQEDLEEED	EEDDGEEEED
CIQVKDEEGE	SGAEEGPDLE	EPGAGYKKLF	SDAQPLQPLQ	VYQAPLSLAT
VPHQALGRTQ	SSPAAPGGMK	SPPDQPVKHL	FTTGVVYDTF	MLKHQCMCGN
THVHPEHAGR	IQSIWSRLQE	TGLLSKCERI	RGRKATLDEI	QTVHSEYHTL
LYGTSPLNRQ	KLDSKKLLGP	ISQKMYAVLP	CGGIGVDSDT	VWNEMHSSSA
VRMAVGCLLE	LAFKVAAGEL	KNGFAIIRPP	GHHAEESTAM	GFCFFNSVAI
TAKLLQQKLN	VGKVLIVDWD	IHHGNGTQQA	FYNDPSVLYI	SLHRYDNGNF
FPGSGAPEEV	GGGPGVGYNV	NVAWTGGVDP	PIGDVEYLTA	FRTVVMPIAH
EFSPDVVLVS	AGFDAVEGHL	SPLGGYSVTA	RCFGHLTRQL	MTLAGGRVVL
ALEGGHDLTA	ICDASEACVS	ALLSVELQPL	DEAVLQQKPN	INAVATLEKV
IEIQSKHWSC	VQKFAAGLGR	SLREAQAGET	EEAETVSAMA	LLSVGAEQAQ
AAAAREHSPR	PAEEPMEQEP	AL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Grozinger C.M., Hassig C.A., Schreiber S.L. (1999). Three proteins define a class of human histone deacetylases related to yeast Hda1p. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 4868—4873. PMID 10220385 doi:10.1073/pnas.96.9.4868
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
McKinsey T.A., Zhang C.-L., Lu J., Olson E.N. (2000). Signal-dependent nuclear export of a histone deacetylase regulates muscle differentiation. Nature. 408: 106—111. PMID 11081517 doi:10.1038/35040593
McKinsey T.A., Zhang C.-L., Olson E.N. (2000). Activation of the myocyte enhancer factor-2 transcription factor by calcium/calmodulin-dependent protein kinase-stimulated binding of 14-3-3 to histone deacetylase 5. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 14400—14405. PMID 11114197 doi:10.1073/pnas.260501497
McKinsey T.A., Zhang C.-L., Olson E.N. (2001). Identification of a signal-responsive nuclear export sequence in class II histone deacetylases. Mol. Cell. Biol. 21: 6312—6321. PMID 11509672 doi:10.1128/MCB.21.18.6312-6321.2001
Hook S.S., Orian A., Cowley S.M., Eisenman R.N. (2002). Histone deacetylase 6 binds polyubiquitin through its zinc finger (PAZ domain) and copurifies with deubiquitinating enzymes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 13425—13430. PMID 12354939 doi:10.1073/pnas.172511699