GTF2B

GTF2B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1C9B, 1DL6, 1RLY, 1RO4, 1TFB, 1VOL, 2PHG, 5IY7, 5IYA, 5IY6, 5IY9, 5IYB, 5IYD, 5IY8, 5IYC
Ідентифікатори
Символи	GTF2B, TF2B, TFIIB, general transcription factor IIB
Зовнішні ІД	OMIM: 189963 MGI: 2385191 HomoloGene: 1158 GeneCards: GTF2B
шифр КФ	2.3.1.48
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з ДНК; • зв'язування з фактором транскрипції; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • зв’язування з іоном металу; • thyroid hormone receptor binding; • TBP-class protein binding; • RNA polymerase II complex binding; • acetyltransferase activity; • promoter-specific chromatin binding; • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding; • зв'язування з іонами цинку; • histone acetyltransferase activity; • трансферазна активність; • ацилтрансферазна активність; • RNA polymerase II complex recruiting activity; • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма; • transcription factor TFIID complex; • ядерні тільця; • transcription preinitiation complex; • хромосома; • ДНК-білковий комплекс; • RNA polymerase II transcription regulator complex;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • ДНК-матрична транскрипція; • positive regulation of viral transcription; • snRNA transcription by RNA polymerase II; • GO:0022415 viral process; • transcription preinitiation complex assembly; • positive regulation of core promoter binding; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • protein acetylation; • positive regulation by host of viral transcription; • positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • transcriptional start site selection at RNA polymerase II promoter; • транскрипція РНК-полімеразою II; • RNA polymerase II preinitiation complex assembly; • RNA polymerase II core complex assembly; • histone acetylation; • DNA-templated transcription, initiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	2959
	229906
	ENSG00000137947
	ENSMUSG00000028271
	Q00403
	P62915
	NM_001514
	NM_145546
	NP_001505
	NP_663521
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GTF2B (англ. General transcription factor IIB) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 316 амінокислот, а молекулярна маса — 34 833^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASTSRLDAL	PRVTCPNHPD	AILVEDYRAG	DMICPECGLV	VGDRVIDVGS
EWRTFSNDKA	TKDPSRVGDS	QNPLLSDGDL	STMIGKGTGA	ASFDEFGNSK
YQNRRTMSSS	DRAMMNAFKE	ITTMADRINL	PRNIVDRTNN	LFKQVYEQKS
LKGRANDAIA	SACLYIACRQ	EGVPRTFKEI	CAVSRISKKE	IGRCFKLILK
ALETSVDLIT	TGDFMSRFCS	NLCLPKQVQM	AATHIARKAV	ELDLVPGRSP
ISVAAAAIYM	ASQASAEKRT	QKEIGDIAGV	ADVTIRQSYR	LIYPRAPDLF
PTDFKFDTPV	DKLPQL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

Ha I., Lane W.S., Reinberg D. (1991). Cloning of a human gene encoding the general transcription initiation factor IIB. Nature. 352: 689—695. PMID 1876184 doi:10.1038/352689a0
Malik S., Hisatake K., Sumimoto H., Horikoshi M., Roeder R.G. (1991). Sequence of general transcription factor TFIIB and relationships to other initiation factors. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 9553—9557. PMID 1946368 doi:10.1073/pnas.88.21.9553
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Umehara T., Kida S., Yamamoto T., Horikoshi M. (1995). Isolation and characterization of a cDNA encoding a new type of human transcription elongation factor S-II. Gene. 167: 297—302. PMID 8566795 doi:10.1016/0378-1119(95)00634-6
Yuan C.X., Gurley W.B. (2000). Potential targets for HSF1 within the preinitiation complex. Cell Stress Chaperones. 5: 229—242. PMID 11005381 doi:10.1379/1466-1268(2000)005<0229:PTFHWT>2.0.CO;2
Chen H.T., Legault P., Glushka J., Omichinski J.G., Scott R.A. (2000). Structure of a (Cys3His) zinc ribbon, a ubiquitous motif in archaeal and eucaryal transcription. Protein Sci. 9: 1743—1752. PMID 11045620 doi:10.1110/ps.9.9.1743

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з GTF2B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4648 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q00403 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з GTF2B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4648 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q00403 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]