GRN

GRN
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1G26, 2JYE, 2JYT, 2JYU, 2JYV
Ідентифікатори
Символи	GRN, CLN11, GEP, GP88, PCDGF, PEPI, PGranulin, granulin precursor
Зовнішні ІД	OMIM: 138945 MGI: 95832 HomoloGene: 1577 GeneCards: GRN
Пов'язані генетичні захворювання
	фронтотемпоральна деменція з мутацією гена GRN та включеннями Tdp43, neuronal ceroid lipofuscinosis 11
Онтологія гена
Молекулярна функція	• активність цитокінів; • growth factor activity; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • зв'язування з РНК; • зв'язування з шапероном;
Клітинна компонента	• екзосома; • extracellular region; • міжклітинний простір; • лізосома; • ендосома; • ендоплазматичний ретикулум; • azurophil granule lumen; • lysosomal membrane; • late endosome; • комплекс Ґольджі; • trans-Golgi network; • клітинна мембрана; • мембрана;
Біологічний процес	• GO:0072468 сигнальна трансдукція; • дегрануляція нейтрофілів; • regulation of signaling receptor activity; • positive regulation of cell migration; • astrocyte activation involved in immune response; • microglial cell activation involved in immune response; • lysosome organization; • lysosomal transport; • lysosomal lumen acidification; • positive regulation of endothelial cell migration; • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process; • positive regulation of neuron apoptotic process; • positive regulation of angiogenesis; • positive regulation of axon regeneration; • positive regulation of epithelial cell proliferation; • protein stabilization; • negative regulation of respiratory burst involved in inflammatory response; • positive regulation of inflammatory response to wounding; • positive regulation of defense response to bacterium; • negative regulation of neutrophil activation; • positive regulation of protein folding; • negative regulation of microglial cell activation; • positive regulation of aspartic-type peptidase activity; • positive regulation of lysosome organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	2896
	14824
	ENSG00000030582
	ENSMUSG00000034708
	P28799
	P28798
	NM_001012479; NM_002087
	NM_008175
	NP_002078
	NP_032201
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GRN (англ. Granulin precursor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 593 амінокислот, а молекулярна маса — 63 544^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWTLVSWVAL	TAGLVAGTRC	PDGQFCPVAC	CLDPGGASYS	CCRPLLDKWP
TTLSRHLGGP	CQVDAHCSAG	HSCIFTVSGT	SSCCPFPEAV	ACGDGHHCCP
RGFHCSADGR	SCFQRSGNNS	VGAIQCPDSQ	FECPDFSTCC	VMVDGSWGCC
PMPQASCCED	RVHCCPHGAF	CDLVHTRCIT	PTGTHPLAKK	LPAQRTNRAV
ALSSSVMCPD	ARSRCPDGST	CCELPSGKYG	CCPMPNATCC	SDHLHCCPQD
TVCDLIQSKC	LSKENATTDL	LTKLPAHTVG	DVKCDMEVSC	PDGYTCCRLQ
SGAWGCCPFT	QAVCCEDHIH	CCPAGFTCDT	QKGTCEQGPH	QVPWMEKAPA
HLSLPDPQAL	KRDVPCDNVS	SCPSSDTCCQ	LTSGEWGCCP	IPEAVCCSDH
QHCCPQGYTC	VAEGQCQRGS	EIVAGLEKMP	ARRASLSHPR	DIGCDQHTSC
PVGQTCCPSL	GGSWACCQLP	HAVCCEDRQH	CCPAGYTCNV	KARSCEKEVV
SAQPATFLAR	SPHVGVKDVE	CGEGHFCHDN	QTCCRDNRQG	WACCPYRQGV
CCADRRHCCP	AGFRCAARGT	KCLRREAPRW	DAPLRDPALR	QLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

Bhandari V., Bateman A. (1992). Structure and chromosomal location of the human granulin gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 188: 57—63. PMID 1417868 doi:10.1016/0006-291X(92)92349-3
Bhandari V., Palfree R.G.E., Bateman A. (1992). Isolation and sequence of the granulin precursor cDNA from human bone marrow reveals tandem cysteine-rich granulin domains. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 1715—1719. PMID 1542665 doi:10.1073/pnas.89.5.1715
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Bateman A., Belcourt D.R., Bennett H.P., Lazure C., Solomon S. (1990). Granulins, a novel class of peptide from leukocytes. Biochem. Biophys. Res. Commun. 173: 1161—1168. PMID 2268320 doi:10.1016/S0006-291X(05)80908-8
Kardana A., Bagshawe K.D., Coles B., Read D., Taylor M. (1993). Characterisation of UGP and its relationship with beta-core fragment. Br. J. Cancer. 67: 686—692. PMID 8471426 doi:10.1038/bjc.1993.127
Songsrirote K., Li Z., Ashford D., Bateman A., Thomas-Oates J. (2010). Development and application of mass spectrometric methods for the analysis of progranulin N-glycosylation. J. Proteomics. 73: 1479—1490. PMID 20188224 doi:10.1016/j.jprot.2010.02.013