EPCAM

EPCAM
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4MZV
Ідентифікатори
Символи	EPCAM, DIAR5, EGP-2, EGP314, EGP40, ESA, HNPCC8, KS1/4, KSA, M4S1, MIC18, MK-1, TACSTD1, TROP1, epithelial cell adhesion molecule, BerEp4, MOC-31, Ber-Ep4
Зовнішні ІД	OMIM: 185535 MGI: 106653 HomoloGene: 1764 GeneCards: EPCAM
Пов'язані генетичні захворювання
	congenital diarrhea 5 with tufting enteropathy
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0032403 protein-containing complex binding; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • cadherin binding involved in cell-cell adhesion;
Клітинна компонента	• інтегральний компонент мембрани; • lateral plasma membrane; • мембрана; • bicellular tight junction; • клітинна мембрана; • поверхня клітини; • міжклітинні контакти; • basolateral plasma membrane; • apical plasma membrane; • екзосома; • інтегральний компонент плазматичної мембрани;
Біологічний процес	• ureteric bud development; • positive regulation of cell motility; • negative regulation of cell-cell adhesion mediated by cadherin; • signal transduction involved in regulation of gene expression; • negative regulation of apoptotic process; • stem cell differentiation; • positive regulation of cell population proliferation; • positive regulation of stem cell proliferation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • leukocyte migration; • cell-cell adhesion via plasma-membrane adhesion molecules;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4072
	17075
	ENSG00000119888
	ENSMUSG00000045394
	P16422
	Q99JW5
	NM_002354
	NM_008532
	NP_002345
	NP_032558
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EPCAM (англ. Epithelial cell adhesion molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 314 амінокислот, а молекулярна маса — 34 932^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPPQVLAFG	LLLAAATATF	AAAQEECVCE	NYKLAVNCFV	NNNRQCQCTS
VGAQNTVICS	KLAAKCLVMK	AEMNGSKLGR	RAKPEGALQN	NDGLYDPDCD
ESGLFKAKQC	NGTSMCWCVN	TAGVRRTDKD	TEITCSERVR	TYWIIIELKH
KAREKPYDSK	SLRTALQKEI	TTRYQLDPKF	ITSILYENNV	ITIDLVQNSS
QKTQNDVDIA	DVAYYFEKDV	KGESLFHSKK	MDLTVNGEQL	DLDPGQTLIY
YVDEKAPEFS	MQGLKAGVIA	VIVVVVIAVV	AGIVVLVISR	KKRMAKYEKA
EIKEMGEMHR	ELNA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Chong J.M., Speicher D.W. (2001). Determination of disulfide bond assignments and N-glycosylation sites of the human gastrointestinal carcinoma antigen GA733-2 (CO17-1A, EGP, KS1-4, KSA, and Ep-CAM). J. Biol. Chem. 276: 5804—5813. PMID 11080501 doi:10.1074/jbc.M008839200
Muenz M., Zeidler R., Gires O. (2005). The tumour-associated antigen EpCAM upregulates the fatty acid binding protein E-FABP. Cancer Lett. 225: 151—157. PMID 15922867 doi:10.1016/j.canlet.2004.11.048
Munz M., Fellinger K., Hofmann T., Schmitt B., Gires O. (2008). Glycosylation is crucial for stability of tumour and cancer stem cell antigen EpCAM. Front. Biosci. 13: 5195—5201. PMID 18508581 doi:10.2741/3075
Ng V.Y., Ang S.N., Chan J.X., Choo A.B. (2010). Characterization of epithelial cell adhesion molecule as a surface marker on undifferentiated human embryonic stem cells. Stem Cells. 28: 29—35. PMID 19785009 doi:10.1002/stem.221
Perez M.S., Walker L.E. (1989). Isolation and characterization of a cDNA encoding the KS1/4 epithelial carcinoma marker. J. Immunol. 142: 3662—3667. PMID 2469722