DNMT3L

DNMT3L
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2PV0, 2PVC, 2QRV, 4U7P, 4U7T
Ідентифікатори
Символи	DNMT3L, DNA methyltransferase 3 like
Зовнішні ІД	OMIM: 606588 MGI: 1859287 HomoloGene: 8362 GeneCards: DNMT3L
Онтологія гена
Молекулярна функція	• enzyme binding; • GO:0010576 enzyme regulator activity; • GO:0010577 enzyme activator activity; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • зв’язування з іоном металу; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • клітинне ядро; • ESC/E(Z) complex;
Біологічний процес	• регуляція експресії генів шляхом геномного імпринтингу; • Метилювання ДНК; • GO:0048552 regulation of catalytic activity; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity; • male meiosis I; • Сперматогенез; • диференціація клітин; • DNA methylation on cytosine; • DNA methylation involved in gamete generation; • stem cell differentiation; • negative regulation of DNA methylation; • positive regulation of DNA methylation; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	29947
	54427
	ENSG00000142182
	ENSMUSG00000000730
	Q9UJW3
	Q9CWR8
	NM_013369; NM_175867
NM_001081695; NM_001284197; NM_001284198; NM_001284199; NM_001284200;
	NM_019448
	NP_037501; NP_787063
NP_001075164; NP_001271126; NP_001271127; NP_001271128; NP_001271129;
	NP_062321
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DNMT3L (англ. DNA methyltransferase 3 like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 386 амінокислот, а молекулярна маса — 43 583^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAIPALDPE	AEPSMDVILV	GSSELSSSVS	PGTGRDLIAY	EVKANQRNIE
DICICCGSLQ	VHTQHPLFEG	GICAPCKDKF	LDALFLYDDD	GYQSYCSICC
SGETLLICGN	PDCTRCYCFE	CVDSLVGPGT	SGKVHAMSNW	VCYLCLPSSR
SGLLQRRRKW	RSQLKAFYDR	ESENPLEMFE	TVPVWRRQPV	RVLSLFEDIK
KELTSLGFLE	SGSDPGQLKH	VVDVTDTVRK	DVEEWGPFDL	VYGATPPLGH
TCDRPPSWYL	FQFHRLLQYA	RPKPGSPRPF	FWMFVDNLVL	NKEDLDVASR
FLEMEPVTIP	DVHGGSLQNA	VRVWSNIPAI	RSRHWALVSE	EELSLLAQNK
QSSKLAAKWP	TKLVKNCFLP	LREYFKYFST	ELTSSL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Має схожу з DNMT3A та DNMT3B N-кінцеву ділянку, але не містить каталітичних мотивів^[5]. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Jia D., Jurkowska R.Z., Zhang X., Jeltsch A., Cheng X. (2007). Structure of Dnmt3a bound to Dnmt3L suggests a model for de novo DNA methylation. Nature. 449: 248—251. PMID 17713477 doi:10.1038/nature06146

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2980 (англ.) . Архів оригіналу за 27 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-27 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9UJW3 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ Wang, Mengxi (10 лютого 2014). Studies of Mechanisms Regulating Tet Proteins (PDF). edoc.ub.uni-muenchen.de (англ.). Ludwig-Maximilians-Universität München.

Див. також

Хромосома 21

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2980 (англ.) . Архів оригіналу за 27 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-27 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q9UJW3 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[5] Wang, Mengxi (10 лютого 2014). Studies of Mechanisms Regulating Tet Proteins (PDF). edoc.ub.uni-muenchen.de (англ.). Ludwig-Maximilians-Universität München.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]