Важкий ланцюг клатрину

Важкий ланцюг клатрину
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2XZG, 4G55
Ідентифікатори
Символи	CLTC, CHC, CHC17, CLH-17, CLTCL2, Hc, clathrin heavy chain, MRD56
Зовнішні ІД	OMIM: 118955 MGI: 2388633 HomoloGene: 3572 GeneCards: CLTC
Пов'язані генетичні захворювання
	autosomal dominant mental retardation 56
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • double-stranded RNA binding; • protein kinase binding; • structural molecule activity; • зв'язування з РНК; • clathrin light chain binding; • disordered domain specific binding; • low-density lipoprotein particle receptor binding; • ubiquitin-specific protease binding;
Клітинна компонента	• extracellular vesicle; • гіалоплазма; • clathrin-coated endocytic vesicle membrane; • clathrin coat of coated pit; • trans-Golgi network membrane; • clathrin coat of trans-Golgi network vesicle; • focal adhesion; • Меланосома; • клітинна мембрана; • endolysosome membrane; • clathrin-coated pit; • екзосома; • cytoplasmic vesicle membrane; • GO:0016023 цитоплазматичний міхур; • clathrin-coated vesicle; • GO:0005578 позаклітинний матрикс; • мембрана; • mitotic spindle microtubule; • цитоплазма; • лізосома; • ендосома; • веретено поділу; • цитоскелет; • clathrin coat; • Клатрин; • GO:0009327 protein-containing complex; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • clathrin-coated endocytic vesicle; • mitotic spindle; • внутрішньоклітинний;
Біологічний процес	• antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II; • transferrin transport; • receptor internalization; • negative regulation of protein localization to plasma membrane; • retrograde transport, endosome to Golgi; • osteoblast differentiation; • vesicle-mediated transport; • negative regulation of hyaluronan biosynthetic process; • intracellular protein transport; • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway; • regulation of mitotic spindle organization; • автофагія; • microtubule-based movement; • клітинний цикл; • поділ клітини; • membrane organization; • GO:0007067 мітоз; • рецептор-опосередкований ендоцитоз; • low-density lipoprotein particle receptor catabolic process; • low-density lipoprotein particle clearance; • clathrin coat assembly; • clathrin-dependent endocytosis; • amyloid-beta clearance by transcytosis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1213
	67300
	ENSG00000141367
	ENSMUSG00000047126
	Q00610
	Q68FD5
	NM_001288653; NM_004859
	NM_001003908; NM_001356393
	NP_001275582; NP_004850
	NP_001003908; NP_001343322
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Важкий ланцюг клатрину (англ. Clathrin heavy chain) — білок, який кодується геном CLTC, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 675 амінокислот, а молекулярна маса — 191 615^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQILPIRFQ	EHLQLQNLGI	NPANIGFSTL	TMESDKFICI	REKVGEQAQV
VIIDMNDPSN	PIRRPISADS	AIMNPASKVI	ALKAGKTLQI	FNIEMKSKMK
AHTMTDDVTF	WKWISLNTVA	LVTDNAVYHW	SMEGESQPVK	MFDRHSSLAG
CQIINYRTDA	KQKWLLLTGI	SAQQNRVVGA	MQLYSVDRKV	SQPIEGHAAS
FAQFKMEGNA	EESTLFCFAV	RGQAGGKLHI	IEVGTPPTGN	QPFPKKAVDV
FFPPEAQNDF	PVAMQISEKH	DVVFLITKYG	YIHLYDLETG	TCIYMNRISG
ETIFVTAPHE	ATAGIIGVNR	KGQVLSVCVE	EENIIPYITN	VLQNPDLALR
MAVRNNLAGA	EELFARKFNA	LFAQGNYSEA	AKVAANAPKG	ILRTPDTIRR
FQSVPAQPGQ	TSPLLQYFGI	LLDQGQLNKY	ESLELCRPVL	QQGRKQLLEK
WLKEDKLECS	EELGDLVKSV	DPTLALSVYL	RANVPNKVIQ	CFAETGQVQK
IVLYAKKVGY	TPDWIFLLRN	VMRISPDQGQ	QFAQMLVQDE	EPLADITQIV
DVFMEYNLIQ	QCTAFLLDAL	KNNRPSEGPL	QTRLLEMNLM	HAPQVADAIL
GNQMFTHYDR	AHIAQLCEKA	GLLQRALEHF	TDLYDIKRAV	VHTHLLNPEW
LVNYFGSLSV	EDSLECLRAM	LSANIRQNLQ	ICVQVASKYH	EQLSTQSLIE
LFESFKSFEG	LFYFLGSIVN	FSQDPDVHFK	YIQAACKTGQ	IKEVERICRE
SNCYDPERVK	NFLKEAKLTD	QLPLIIVCDR	FDFVHDLVLY	LYRNNLQKYI
EIYVQKVNPS	RLPVVIGGLL	DVDCSEDVIK	NLILVVRGQF	STDELVAEVE
KRNRLKLLLP	WLEARIHEGC	EEPATHNALA	KIYIDSNNNP	ERFLRENPYY
DSRVVGKYCE	KRDPHLACVA	YERGQCDLEL	INVCNENSLF	KSLSRYLVRR
KDPELWGSVL	LESNPYRRPL	IDQVVQTALS	ETQDPEEVSV	TVKAFMTADL
PNELIELLEK	IVLDNSVFSE	HRNLQNLLIL	TAIKADRTRV	MEYINRLDNY
DAPDIANIAI	SNELFEEAFA	IFRKFDVNTS	AVQVLIEHIG	NLDRAYEFAE
RCNEPAVWSQ	LAKAQLQKGM	VKEAIDSYIK	ADDPSSYMEV	VQAANTSGNW
EELVKYLQMA	RKKARESYVE	TELIFALAKT	NRLAELEEFI	NGPNNAHIQQ
VGDRCYDEKM	YDAAKLLYNN	VSNFGRLAST	LVHLGEYQAA	VDGARKANST
RTWKEVCFAC	VDGKEFRLAQ	MCGLHIVVHA	DELEELINYY	QDRGYFEELI
TMLEAALGLE	RAHMGMFTEL	AILYSKFKPQ	KMREHLELFW	SRVNIPKVLR
AAEQAHLWAE	LVFLYDKYEE	YDNAIITMMN	HPTDAWKEGQ	FKDIITKVAN
VELYYRAIQF	YLEFKPLLLN	DLLMVLSPRL	DHTRAVNYFS	KVKQLPLVKP
YLRSVQNHNN	KSVNESLNNL	FITEEDYQAL	RTSIDAYDNF	DNISLAQRLE
KHELIEFRRI	AAYLFKGNNR	WKQSVELCKK	DSLYKDAMQY	ASESKDTELA
EELLQWFLQE	EKRECFGACL	FTCYDLLRPD	VVLETAWRHN	IMDFAMPYFI
QVMKEYLTKV	DKLDASESLR	KEEEQATETQ	PIVYGQPQLM	LTAGPSVAVP
PQAPFGYGYT	APPYGQPQPG	FGYSM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, автофагія. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани, цитоплазматичних везикулах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Royle S.J., Bright N.A., Lagnado L. (2005). Clathrin is required for the function of the mitotic spindle. Nature. 434: 1152—1157. PMID 15858577 doi:10.1038/nature03502
Royle S.J., Lagnado L. (2006). Trimerisation is important for the function of clathrin at the mitotic spindle. J. Cell Sci. 119: 4071—4078. PMID 16968737 doi:10.1242/jcs.03192
Jarczowski F., Fischer G., Edlich F. (2008). FKBP36 forms complexes with clathrin and Hsp72 in spermatocytes. Biochemistry. 47: 6946—6952. PMID 18529014 doi:10.1021/bi8001506
Ravikumar B., Moreau K., Jahreiss L., Puri C., Rubinsztein D.C. (2010). Plasma membrane contributes to the formation of pre-autophagosomal structures. Nat. Cell Biol. 12: 747—757. PMID 20639872 doi:10.1038/ncb2078
Booth D.G., Hood F.E., Prior I.A., Royle S.J. (2011). A TACC3/ch-TOG/clathrin complex stabilises kinetochore fibres by inter-microtubule bridging. EMBO J. 30: 906—919. PMID 21297582 doi:10.1038/emboj.2011.15