CLDN1

CLDN1
Ідентифікатори
Символи	CLDN1, CLD1, ILVASC, SEMP1, claudin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603718 MGI: 1276109 HomoloGene: 9620 GeneCards: CLDN1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • structural molecule activity; • identical protein binding; • virus receptor activity;
Клітинна компонента	• мембрана; • інтегральний компонент мембрани; • міжклітинні контакти; • клітинна мембрана; • інтегральний компонент плазматичної мембрани; • apical plasma membrane; • lateral plasma membrane; • bicellular tight junction; • цитоплазма; • basolateral plasma membrane;
Біологічний процес	• viral entry into host cell; • cell-cell junction organization; • calcium-independent cell-cell adhesion via plasma membrane cell-adhesion molecules; • GO:0022415 viral process; • protein homooligomerization; • protein heterooligomerization; • establishment of skin barrier; • утворення двоклітинних щільних контактів; • GO:0010260 старіння людини; • establishment of blood-nerve barrier; • response to toxic substance; • response to lipopolysaccharide; • hyperosmotic salinity response; • response to ethanol; • xenobiotic transport across blood-nerve barrier; • response to interleukin-18; • cellular response to lead ion; • cellular response to interferon-gamma; • cellular response to tumor necrosis factor; • response to dexamethasone; • cellular response to transforming growth factor beta stimulus; • establishment of endothelial intestinal barrier; • liver regeneration; • positive regulation of bicellular tight junction assembly; • cellular response to butyrate;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	9076
	12737
	ENSG00000163347
	ENSMUSG00000022512
	O95832
	O88551
	NM_021101
	NM_016674
	NP_066924
	NP_057883
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CLDN1 (англ. Claudin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 211 амінокислот, а молекулярна маса — 22 744^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MANAGLQLLG	FILAFLGWIG	AIVSTALPQW	RIYSYAGDNI	VTAQAMYEGL
WMSCVSQSTG	QIQCKVFDSL	LNLSSTLQAT	RALMVVGILL	GVIAIFVATV
GMKCMKCLED	DEVQKMRMAV	IGGAIFLLAG	LAILVATAWY	GNRIVQEFYD
PMTPVNARYE	FGQALFTGWA	AASLCLLGGA	LLCCSCPRKT	TSYPTPRPYP
KPAPSSGKDY	V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

Kraemer F., White K., Kubbies M., Swisshelm K.L., Weber B.H.F. (2000). Genomic organization of claudin-1 and its assessment in hereditary and sporadic breast cancer. Hum. Genet. 107: 249—256. PMID 11071387 doi:10.1007/s004390000375
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Che P., Tang H., Li Q. (2013). The interaction between claudin-1 and dengue viral prM/M protein for its entry. Virology. 446: 303—313. PMID 24074594 doi:10.1016/j.virol.2013.08.009

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2032 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017. [Архівовано 2016-03-15 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, O95832 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2032 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017. [Архівовано 2016-03-15 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, O95832 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]