CDX2

CDX2
Ідентифікатори
Символи	CDX2, CDX-3, CDX2/AS, CDX3, caudal type homeobox 2, Cdx2
Зовнішні ІД	OMIM: 600297 MGI: 88361 HomoloGene: 968 GeneCards: CDX2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • зв'язування з ДНК; • специфічне до послідовності зв'язування з ДНК; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • зв’язування дволанцюгових ДНК; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • зв'язування з метильованими CpG-динуклеотидами; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• transcription repressor complex; • нуклеоплазма; • condensed nuclear chromosome; • клітинне ядро; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• pattern specification process; • диференціація клітин; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of somitogenesis; • somatic stem cell population maintenance; • endosome to lysosome transport; • placenta development; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II; • labyrinthine layer development; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • транскрипція РНК-полімеразою II; • ДНК-матрична транскрипція; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • розвиток багатоклітинного організму; • blood vessel development; • trophectodermal cell differentiation; • establishment or maintenance of epithelial cell apical/basal polarity; • positive regulation of cell differentiation; • intestinal epithelial cell differentiation; • positive regulation of cell population proliferation; • animal organ morphogenesis; • anterior/posterior axis specification; • blastocyst development; • anterior/posterior pattern specification;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1045
	12591
	ENSG00000165556
	ENSMUSG00000029646
	Q99626
	P43241
	NM_001265; NM_001354700
	NM_007673
	NP_001256; NP_001341629
	NP_031699
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CDX2 (англ. Caudal type homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 313 амінокислот, а молекулярна маса — 33 520^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYVSYLLDKD	VSMYPSSVRH	SGGLNLAPQN	FVSPPQYPDY	GGYHVAAAAA
AAANLDSAQS	PGPSWPAAYG	APLREDWNGY	APGGAAAAAN	AVAHGLNGGS
PAAAMGYSSP	ADYHPHHHPH	HHPHHPAAAP	SCASGLLQTL	NPGPPGPAAT
AAAEQLSPGG	QRRNLCEWMR	KPAQQSLGSQ	VKTRTKDKYR	VVYTDHQRLE
LEKEFHYSRY	ITIRRKAELA	ATLGLSERQV	KIWFQNRRAK	ERKINKKKLQ
QQQQQQPPQP	PPPPPQPPQP	QPGPLRSVPE	PLSPVSSLQA	SVPGSVPGVL
GPTGGVLNPT	VTQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Drummond F.J., Putt W., Fox M., Edwards Y.H. (1997). Cloning and chromosome assignment of the human CDX2 gene. Ann. Hum. Genet. 61: 393—400. PMID 9459001 doi:10.1017/S0003480097006465
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Inamori K., Takeshita K., Chiba S., Yazaki Y., Hirai H. (1993). Identification of homeobox genes expressed in human T-lymphocytes. Biochem. Biophys. Res. Commun. 196: 203—208. PMID 8105782 doi:10.1006/bbrc.1993.2235

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1806 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q99626 (англ.) . Архів оригіналу за 15 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 13

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1806 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q99626 (англ.) . Архів оригіналу за 15 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]