CDH8

CDH8
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1ZXK, 2A62
Ідентифікатори
Символи	CDH8, Nbla04261, cadherin 8
Зовнішні ІД	OMIM: 603008 MGI: 107434 HomoloGene: 55604 GeneCards: CDH8
Пов'язані генетичні захворювання
	недрібноклітинна карцинома легенів
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном кальцію; • зв’язування з іоном металу; • identical protein binding; • cytoskeletal protein binding; • гомодимеризація білків; • зв'язування з кадгерином;
Клітинна компонента	• axon terminus; • інтегральний компонент мембрани; • synaptic cleft; • мембрана; • клітинна мембрана; • synaptic membrane; • glutamatergic synapse; • поверхня клітини; • катеніновий комплекс;
Біологічний процес	• response to cold; • адгезія клітин; • adherens junction organization; • synaptic transmission, glutamatergic; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • chemical synaptic transmission; • GO:1904739 regulation of synapse organization; • cell-cell junction assembly; • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • cell-cell adhesion mediated by cadherin; • cell-cell adhesion; • GO:0000767 cell morphogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1006
	12564
	ENSG00000150394
	ENSMUSG00000036510
	P55286
	P97291
	NM_001796
	NM_001039154; NM_001285913; NM_001285914; NM_007667
	NP_001787
	NP_001034243; NP_001272842; NP_001272843; NP_031693
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CDH8 (англ. Cadherin 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 799 амінокислот, а молекулярна маса — 88 253^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPERLAEMLL	DLWTPLIILW	ITLPPCIYMA	PMNQSQVLMS	GSPLELNSLG
EEQRILNRSK	RGWVWNQMFV	LEEFSGPEPI	LVGRLHTDLD	PGSKKIKYIL
SGDGAGTIFQ	INDVTGDIHA	IKRLDREEKA	EYTLTAQAVD	WETSKPLEPP
SEFIIKVQDI	NDNAPEFLNG	PYHATVPEMS	ILGTSVTNVT	ATDADDPVYG
NSAKLVYSIL	EGQPYFSIEP	ETAIIKTALP	NMDREAKEEY	LVVIQAKDMG
GHSGGLSGTT	TLTVTLTDVN	DNPPKFAQSL	YHFSVPEDVV	LGTAIGRVKA
NDQDIGENAQ	SSYDIIDGDG	TALFEITSDA	QAQDGIIRLR	KPLDFETKKS
YTLKVEAANV	HIDPRFSGRG	PFKDTATVKI	VVEDADEPPV	FSSPTYLLEV
HENAALNSVI	GQVTARDPDI	TSSPIRFSID	RHTDLERQFN	INADDGKITL
ATPLDRELSV	WHNITIIATE	IRNHSQISRV	PVAIKVLDVN	DNAPEFASEY
EAFLCENGKP	GQVIQTVSAM	DKDDPKNGHY	FLYSLLPEMV	NNPNFTIKKN
EDNSLSILAK	HNGFNRQKQE	VYLLPIIISD	SGNPPLSSTS	TLTIRVCGCS
NDGVVQSCNV	EAYVLPIGLS	MGALIAILAC	IILLLVIVVL	FVTLRRHKNE
PLIIKDDEDV	RENIIRYDDE	GGGEEDTEAF	DIATLQNPDG	INGFLPRKDI
KPDLQFMPRQ	GLAPVPNGVD	VDEFINVRLH	EADNDPTAPP	YDSIQIYGYE
GRGSVAGSLS	SLESTTSDSD	QNFDYLSDWG	PRFKRLGELY	SVGESDKET

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Shimoyama Y., Tsujimoto G., Kitajima M., Natori M. (2000). Identification of three human type-II classic cadherins and frequent heterophilic interactions between different subclasses of type-II classic cadherins. Biochem. J. 349: 159—167. PMID 10861224 doi:10.1042/0264-6021:3490159
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Tanihara H., Sano K., Heimark R.L., St John T., Suzuki S. (1994). Cloning of five human cadherins clarifies characteristic features of cadherin extracellular domain and provides further evidence for two structurally different types of cadherin. Cell Adhes. Commun. 2: 15—26. PMID 7982033
Suzuki S., Sano K., Tanihara H. (1991). Diversity of the cadherin family: evidence for eight new cadherins in nervous tissue. Cell Regul. 2: 261—270. PMID 2059658

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CDH8 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1767 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P55286 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CDH8 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1767 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P55286 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]